初めての R と beeswarm と 無料版 rstudio （ ubuntu からはじめて arcolinux へ)

初めてなので間違ってるかもです

その場合は　ご指摘ください

無料版rstudioです

https://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu/README.html
にて
インストします

なお

sudo add-apt-repository 'deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu disco-cran35/'

sudo apt install r-base

でした

あとは

$ sudo -i R

> x = c(0 ,0 ,1,以下略 )
> y = c(1.72 ,1.54 ,3.30,以下略 )

> install.packages("beeswarm", dependencies = TRUE)
 
> beeswarm(list(x, y), method = "swarm", pch = 1, main = "swarm")

但し
beeswarm(list(x, y), method = "swarm", pch = 1, main = "swarm")
 beeswarm(list(x, y), method = "swarm", pch = 1, main = "swarm") でエラー: 
   関数 "beeswarm" を見つけることができませんでした

となるときは
http://bigvalley.hatenablog.com/entry/2015/12/09/090437
の

library(beeswarm)

とすればbeeswarm関数が使えるようになる。

working directory の変更
データはhttp://cse.naro.affrc.go.jp/takezawa/r-tips/r/40.html　を利用

> getwd()
[1] "/root"
> setwd("/home/jp/R---")
> getwd()
[1] "/home/jp/R---"
> ( x <- read.table("data01.txt") )
  V1  V2 V3
1  F 158 51
2  F 162 55
3  M 177 72
4  M 173 57
5  M 166 64

excelファイルからは　https://sites.google.com/site/webtextofr/data　の

library(gdata)
data3=read.xls(“demodata.xls”)
かな？（未確認）

役立つだろうスクリプト
cat sed.bat 
cat $1 | sed "s/\"/ /g" > X.txt 
cat X.txt | sed -e 's/  */ /g' 


これを利用して
# R
>getwd()　現在のワーキングディレクトリの表示
> setwd("/home/jp/R---")　　ワーキングディレクトリを/home/jp/R---にする
> x <- read.table("1.csv")　データをｘに読み込む
> x　データの表示
> install.packages("beeswarm", dependencies = TRUE)　 beeswarmを扱うパッケージの導入
> library(beeswarm)　beeswarmを扱うパッケージの足らない部分の強化
> boxplot(x)　　ひげ図を書く
> beeswarm(x,add=TRUE)　　ひげ図の上のbeeswarmを加える

rstudioについては 本来は以下だけど

https://rstudio.com/products/rstudio/download-server/debian-ubuntu/
によると
Install for Debian 10 / Ubuntu 18
To download and install RStudio Server open a terminal window and execute the following commands.
Size:  38.41 MB | SHA-256: 62b1fb2f | Version:  1.2.5033| Released:  2019-12-17

sudo apt-get install gdebi-core
wget https://download2.rstudio.org/server/bionic/amd64/rstudio-server-1.2.5033-amd64.deb
sudo gdebi rstudio-server-1.2.5033-amd64.deb

これよりか以下でOK

https://rstudio.com/products/rstudio/download/#download　より

Ubuntu 18/Debian 10の
	 rstudio-1.2.5033-amd64.deb　
をダウンロードして

apt install gdebi
gdebi　rstudio-1.2.5033-amd64.deb

R と　rstudioがあります

講義が聞けます

https://www.youtube.com/watch?v=6b8pFctsBog&list=TLPQMjgwMjIwMjB-dt37QZwnoQ&index=24
とかyoutubeに一杯ありますねー

windows10用もありますね

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archlinux では

pacman -S r tk

rstudioは　 yay -Sy rstudio-desktop-git
ソ-スからからcc1plusで作って

解説は
https://wiki.archlinux.jp/index.php/R

なお
https://datumstudio.jp/blog/r%E3%81%A7excel%EF%BC%88xlsx%E3%83%95%E3%82%A1%E3%82%A4%E3%83%AB%EF%BC%89%E3%82%92%E8%AA%AD%E3%81%BF%E8%BE%BC%E3%82%80
を参考にすると

# R
> getwd()
[1] "/home/nvme/R---"
> install.packages('openxlsx')
> library(openxlsx)
> X <- read.xlsx("Beeswarm.xlsx")
> install.packages("beeswarm", dependencies = TRUE)
> library(beeswarm)
> boxplot(X)
> beeswarm(X,add=TRUE)
> q()

なおBeeswarm.xlsxは

一旦　作ってしまえば

> search()
[1] ".GlobalEnv"        "package:stats"     "package:graphics" 
[4] "package:grDevices" "package:utils"     "package:datasets" 
[7] "package:methods"   "Autoloads"         "package:base"     
> library(openxlsx)
> library(beeswarm)
> search()
 [1] ".GlobalEnv"        "package:beeswarm"  "package:openxlsx" 
 [4] "package:stats"     "package:graphics"  "package:grDevices"
 [7] "package:utils"     "package:datasets"  "package:methods"  
[10] "Autoloads"         "package:base"     
> 

と　"package:beeswarm" "package:openxlsx" がコンパイルしなくてもいけます。
よかったね

# pacman -S yay

$ yay -S pip
$ pip install numpy --no-warn-script-location
$ pip install pandas
$ pip install scipy
$ pip install matplotlib

https://www.qoosky.io/techs/9ca9c78897 参考にしました

これにて例えば以下です

付録１）良いページ

https://oku.edu.mie-u.ac.jp/~okumura/stat/first.html
https://www1.doshisha.ac.jp/~mjin/R/