CentOS7で複数ユーザーで同時に使用するJupyter Notebook環境を作る

jupyterhub

Jupyter Notebookの環境を立てただけでは、複数ユーザーで同時に使用することは困難なので、ユーザー管理機能を追加する「JupyterHub」を用いて、Jupyter Notebookを使用できる環境を作ります。

環境

今回紹介する構築環境は以下です。

• OS：CentOS7.4　(docker)
• Anaconda3-4.3.1
• Python3.6.9
• 基盤：AWS　EC2

設定

CentOSコンテナ作成

docker run -it --privileged -d -p 888:8000  --name centos_cho centos:7 /sbin/init

事前インストール

yum install wget
yum install bzip2
yum install sudo
yum install which

以降、rootユーザで操作します

Anaconda3インストール

cd ~
wget https://repo.continuum.io/archive/Anaconda3-4.3.1-Linux-x86_64.sh
bash Anaconda3-4.3.1-Linux-x86_64.sh
※注意点：インストールディレクトリは/opt/anaconda3/にします。

jupyterhubインストール＆設定

conda install -c conda-forge jupyterhub
conda install notebook
npm install -g configurable-http-proxy

cd /opt/
jupyterhub --generate-config
vi jupyterhub_config.py

c.JupyterHub.ip = '0.0.0.0'
c.Spawner.ip = '127.0.0.1'
c.JupyterHub.port = 8000
c.PAMAuthenticator.encoding = 'utf8'
c.LocalAuthenticator.create_system_users = True
c.Authenticator.whitelist = {'user1', 'user1', 'user3'}
c.Authenticator.admin_users = {'user1'}
c.LocalAuthenticator.group_whitelist = {'group1'}
c.JupyterHub.statsd_prefix = 'jupyterhub'
c.Spawner.notebook_dir = '~/notebook'

ユーザ作成

groupadd group1
useradd user1
usermod -a -G group1 user1
passwd user1
mkdir -p /home/user01/notebook
chown user01:usergr /home/user01/notebook

起動＆アクセス

jupyterhub --no-ssl
http://公開IPアドレス:888/

エラー解決

1.必要なら

yum install -y gcc-c++ make

2.ImportError: libsodium.so.23: cannot open shared object file: No such file or director

conda install -c conda-forge libsodium

3.ModuleNotFoundError: No module named 'nbconvert.exporters.base'

conda upgrade nbconvert

4./usr/lib64/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.21' not found

strings /usr/lib64/libstdc++.so.6 | grep GLIBC
find / -name "libstdc++.so*"
cp /xxx/xxx/xxxx/libstdc++.so.6.0.21 /usr/lib64
cd /usr/lib64
rm -rf libstdc++.so.6
ln -s libstdc++.so.6.0.21 libstdc++.so.6
strings /usr/lib64/libstdc++.so.6 | grep GLIBC