boot2dockerのディスク容量を増やす必要があったため、~/.boot2docker/profileを修正してVMを作り直しました。
その時ハマった記録。

環境

OS: macOS Sierra 10.12.3
boot2docker version: v1.8.0

問題が発生した手順

boot2docker delete
boot2docker init
boot2docker up
端末再起動
boot2docker up

発生した問題

VM再作成後、3で起動した時点では192.168.59.104だったDocker hostのIP Addressが、5の後は192.168.59.103になってしまう。
環境変数DOCKER_HOSTのIP Addressを192.168.59.103に修正しても、x509 certificate errorになってしまう。
端末を再起動せず、boot2docker down/upしただけではIP addressは192.168.59.104のままになっており、正常に動作する。

$ docker ps
An error occurred trying to connect: Get https://192.168.59.103:2376/v1.24/containers/json: x509: certificate is valid for 127.0.0.1, 10.0.2.15, 192.168.59.104, not 192.168.59.103

最終的に実施した問題解消方法

私がやった限りでは既存VMのIP Addressを修正することができなかったので、再度boot2docker delete -> init -> upでVMを作り直しました。

備考

VMを再作成した際、IP Addressが変わっていた場合は、端末再起動後にIP Addressが古いものになってしまい、x509 certificate errorになる可能性があるのでご注意ください。
もしVM再作成以外に直す方法があればコメントお願いします。

以下、足掻いた記録（蛇足です）

問題が発生した手順5の後、とりあえずDocker hostのIP Addressをコマンドで設定。

ifconfig 
 192.168.59.104 netmask 255.255.255.0 broadcast 192.168.59.255 up

当然だが動くようにはなった。

しかしboot2docker VMはCore Linuxで、IP AddressはDHCPで設定しているので、リース期限が来ると再び192.168.59.103が設定されてしまう。

設定を永続化しておきたいが、boot2docker downで設定が消えてしまう。

また、DHCPで強制的に192.168.59.104を設定しようとしたけどうまくいきませんでした。