基本的なレイヤー構成

<フォルダ>
├<髪>
│├揺らしたい前髪
│├その他の前髪
│├右横髪
│└左横髪
│
├<顔>
│├右眉毛
│├左眉毛
│├鼻
│├頬
││
│├<右目>
││├まつ毛
││├眉毛_上の方
││├眉毛_右の方
││├ハイライト
││├瞳
││└白目
││
│├<左目>
││├まつ毛
││├眉毛_上の方
││├眉毛_左の方
││├ハイライト
││├瞳
││└白目
││
│├<口>
││├上唇
││├下唇
││└口の中
││
│├顔(肌の部分)
│├右耳
│└左耳
│
└<体>
│├襟部分
│├服
│├首
│├<右腕>
││├二の腕
││├腕
││└手
││
│├<左腕>
││├二の腕
││├腕
││└手
││
│└<足>
│　├<右足>
│　│├太もも
│　│├ふくらはぎ
│　└靴
│　│
│　└<左足>
│　　├太もも
│　　├ふくらはぎ
│ 　　└靴
└後ろ髪

この他に動かしたい部分を想像してイラストを描いてみるといいかもしれない
例えば服をひらひらさせたかったら服の表と裏を描いて交互に表示させるとか。
考え方次第でどんな動きもできるのがLive2Dなので頑張って考えてみてください！