EclipseだとjQueryの本体jsファイルが構文エラーになってしまう。
特に編集とかしていないオリジナルファイルが。
Eclipse上でjqueryのJSファイルの構文チェックを除外設定にすればOKです。
EclipseでのjQueryファイルを除外設定
プロジェクト右クリック、プロパティー
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[Javascript]
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[インクルードパス]、[ソース]タブ
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フォルダ指定、[除外]クリック、[編集]ボタンクリック
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除外パターンテキストボックス横の[追加]ボタンクリック
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[参照]ボタンクリックし、*/jquery.jsを指定しOK、完了
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念のため、更新、クリーン起動でOKなはず
（参考サイト）
eclipseで外部JSが構文エラーになるときの対処