Mayaを複数立ち上げた時、非アクティブな方のウインドウを触って切り替わってあーもうってなりませんか私はなります。

こちらを参考にランダムでメニューバーに色を付けるスクリプトを書きました。
http://myara.blog.fc2.com/blog-entry-218.html
Pyside2なので2017以降向けです。
Maya立ち上げてる間だけ有効です。

# -*- coding: utf-8 -*-
from PySide2.QtWidgets import *
import random

def changeUIColor():
    collist = [(165, 0, 33),(11, 120, 0),(38, 104, 255),(255, 135, 75),(225, 120, 200)]
    app = QApplication.instance()
    num = random.randint(0, 4)
    col = str(collist[num])
    app.setStyleSheet("QMenuBar {background: rgb" + col + "; color: white;}")
changeUIColor()

色を変えたり追加したい時はcollistの中をいじってください。
追加したらnum = random.randint(0, 4)の引数を変更してください。

メニューバーない自作ウインドウがある場合はここを参考にセレクタを追加してください。
https://doc.qt.io/qtforpython/overviews/stylesheet-examples.html?highlight=stylesheet
自分はQTabBar追加しました。