powershellを活用すればIISのあらゆる処理をコマンド実行できます。
環境構築の自動化・効率化にご活用ください。
# 管理者として実行
Start-Process powershell.exe -Verb runas
# IISを操作するモジュールをインポート
Import-Module WebAdministration
# アプリケーションを作成
New-Item "IIS:\Sites\Default Web Site\YourSite" -PhysicalPath "C:\inetpub\wwwroot\YourSite" -type Application