やったこと

「時系列分析と状態空間モデルの基礎 RとStanで学ぶ理論と実装」のstanの章のコードをpystanを用いて実装した

この記事の対象者

時系列分析を知りたくて隼本を読んだけどpythonしかわからない！pythonで書いてくれ！という人

はじめに

時系列分析の入門書で調べると必ず出てくるのが「時系列分析と状態空間モデルの基礎 RとStanで学ぶ理論と実装」，いわゆる隼本です。
この本では，「ARモデル，MAモデルといった時系列分析」，「ガウス線形状態空間モデル」「ベイズ推定による状態空間モデル」について非常に噛み砕いて説明されています。
本の中で使用されているのはR言語とstan言語であり，pythonしか使えない筆者のような人間にとってはそれが少し痛手です。

しかし，pythonでもstanを使用することも可能なので，本で紹介されていることと同じことが実装可能です。
そこで実際にpythonを用いて，隼本のstanによるベイズ推定を実装したので紹介します。

実装はgoogle colabを用いて行っています。google colabではpystanがimportするのみで使用可能です。つまり初期設定がいりません，非常に便利です。
コードはこちらから。
https://github.com/nakanakana12/hayabusa-bon

実装結果

コードはgithubを参照していただくとして，ここでは簡単に結果のみを紹介します。

Stanによるローカルレベルモデルの推定

ローカルレベルモデル(ランダムウォークにノイズが加わったもの)の状態空間を推定した結果が下記になります。

青が状態，オレンジが観測値です。stanを用いて推定した状態の95%区間が青網になります。本のグラフと比べると正しく実装できていそうです。

応用:複雑な観察方程式を持つモデル

次の章では，もう少し複雑な方程式をモデリングしています。
青線が観測値，オレンジ線が過程誤差がない場合の値になります。こちらも正しく実装できています。

まとめ

隼本のstan部分をpythonを用いて実装した。
本の結果と比較して正しく実装できていそうなことを確認した。

少しでも皆さんの役に立てれば幸いです。

参考サイト

隼本サポートページ:https://logics-of-blue.com/tsa-ssm-book-support/
Rとstanのコードとデータ:https://github.com/logics-of-blue/book-tsa-ssm-foundation