daemonの略でしょ。と勝手に思っていたのですが、上記公式サイトのSpellingの章に書いてありました。
翻訳すると、
Spelling
はい、それはsystemdと書きます。system DでもSystem DでもSytemdDでもありません。そしてsystem dでもありません。なぜか？なぜならそれはsystem daemonで、Unix/Linuxのもとではsystem daemonは小文字であり、小文字dでsuffixされるからです。そしてsystemdはシステムを管理するので、systemdと呼ばれます。シンプルでしょ。とは言うものの、もしあまりにもシンプルに見えたら、Dはローマ数字で500なので（これはSystem Vとの関係も明確にしています）、System Five Hundredと呼んでください（そうは綴らないけど！）。名前に大文字を使用しても良い唯一のシチュエーションは、systemdで文章を始めるときだけです（どちらも好きじゃないけど）。high holidays（訳者注：ユダヤ教の祭日？）の日にはsÿstëmdと綴っても良いでしょう。とは言っても、Système Dは受け入れられないし、完全に別物です（ちょっとフィッティングがあるけど）。
やっぱりdaemonの略でした。