Polymer要素をPolymer.dom() メソッドを使用せずに cloneNode() するとLocal DOM が入れ子で生成されてしまったため、以下の記述で解決
component-item.html
class Item {
get is() { return 'component-item'; }
cloneNode(deep) {
if (deep === undefined) {
deep = true;
}
return Polymer.dom(this).cloneNode(deep);
}
}
Polymer(Item.prototype);