#結論
サブネットのACLが原因でした。
ACLのポート制御を1024-65535に設定後、解消されました。
#遭遇した事例
・LambdaからS3へのファイルアップロードが10回に1回くらいエラーになる
・LambdaからCloudwatch metricsへのputが3回に1回くらいエラーになる
#この事象が発生するLambdaの条件
VPCサブネット内に構築しているLambda
#なぜ起こったか
ACLのポート制御の設定範囲がAWSのリソースが使用する一時ポートを許可していなかった。
AWSのリソースは一時ポートを使用しているものがあり、その一時ポートの疎通を許可してあげないといけませんでした。
https://docs.aws.amazon.com/ja_jp/vpc/latest/userguide/vpc-network-acls.html#nacl-ephemeral-ports
一時ポート
前のセクションでは、ネットワーク ACL の例に 32768～65535 という一時ポートの範囲を使用しています。ただし、使用または通信しているクライアントの種類によっては、ネットワーク ACL に別の範囲を使用してもかまいません。
リクエストを開始するクライアントは、一時ポートの範囲を選択します。範囲は、クライアントのオペレーティングシステムによって変わります。
多くの Linux カーネル (Amazon Linux カーネルを含む) は、ポート 32768～61000 を使用します。
Elastic Load Balancing からのリクエストは、ポート 1024-65535 を使用します。
Windows Server 2003 を介する Windows オペレーティングシステムは、ポート 1025～5000 を使用します。
Windows Server 2008 以降のバージョンでは、ポート 49152～65535 を使用します。
NAT ゲートウェイはポート 1024～65535 を使用します。
AWS Lambda 関数は、ポート 1024-65535 を使用します。
#最後に
エラーを検索しても出てこなかったので、同様のエラーに困っているかたの参考になれば幸いです。