fortranのコードをコンパイルしようとしたら、いろんなエラーがたくさん出てきたので、備忘録として記す。
そしてエラーに対処してたらなぜかターミナルベースのJupyterLabで図の保存ができなくなった(これまたたくさんのエラーを吐いた)ので、デスクトップアプリをダウンロードしてみた。
JupyterLabについてはおまけとして記す。
開発元を検証できないため開けない？
まず出てきたのは「"gfortran"は、開発元を検証できないため開けません」というメッセージ。
こちらを参考に対処する。
「システム環境設定」の「セキュリティとプライバシー」から手動で許可していく。
""の中身を変えてたくさん出てきたのでちまちまやる。
コンパイルエラー
ld: library not found for -lSystem
collect2: error: ld returned 1 exit status
こちらを参考に対処する。
% brew upgrade gcc
結構時間がかかる。しかし・・・
Error: Permission denied @ apply2files - /usr/local/share/ghostscript/9.10/Resource/Font/logo10.pfb
残念。
brew doctorで原因を探る
今度はこちらを参考に対処する。
% brew doctor
Warning: Your Command Line Tools are too outdated.
Warning: The following directories do not exist:
/usr/local/sbin
Warning: Broken symlinks were found. Remove them with `brew cleanup`:
指示通りやってみる。
% sudo rm -rf /Library/Developer/CommandLineTools
% sudo xcode-select --install
% sudo mkdir -p /usr/local/sbin
% sudo chown -R [ユーザ名] /usr/local/sbin
% brew cleanup
Error: Permission denied @ apply2files - /usr/local/share/ghostscript/9.10/Resource/Font/logo10.pfb
同じエラーが出てきた(ここまでこちらと同じ経過)。
% sudo chown -R [ユーザ名] /usr/local/share/ghostscript/9.10/Resource/Font/
...
同じようなエラーが出てくるたびにsudo chownをしていく。
% brew cleanup
ついに成功。
gccのupdrageをしたい
% brew upgrade gcc
Error: Cannot install in Homebrew on ARM processor in Intel default prefix (/usr/local)!
Please create a new installation in /opt/homebrew using one of the
"Alternative Installs" from:
https://docs.brew.sh/Installation
You can migrate your previously installed formula list with:
brew bundle dump
指示通りこちらを参考に対処する。
% sudo mkdir /opt/homebrew
% sudo chown -R [ユーザ名] /opt/homebrew
% git clone https://github.com/Homebrew/brew
% eval "$(brew shellenv)"
% brew update --force --quiet
% chmod -R go-w "$(brew --prefix)/share/zsh"
% brew bundle dump
なんかうまくいかないので、こちらを参考にする。
% echo $SHELL
/bin/zsh
% emacs ~/.zshrc
~/.zshrc
+ export PATH="/opt/homebrew/bin:$PATH"
% source ~/.zshrc
ちなみに/opt/homebrew/brew/bin/のようになっていたので、brew下のファイルとフォルダをhomebrew下に移動した。
% brew upgrade gcc
Error: gcc not installed
% brew install gcc
できた！
fortranのコンパイル
古い.oファイルを全部消して、コンパイルし直したら成功した！
おまけ: JupyterLabのデスクトップアプリ
その後ターミナルベースのJupyterLabでsavefigをするとたくさんのエラーを吐くようになった。
少し調べてみるとJupyterLabのデスクトップアプリがあるらしい。
こちらを参考に、公式サイトのDownloadからmacOS Installerをインストールする。
とても簡単にデスクトップアプリが使えるようになり、しかもエラーを吐かなくなった。