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私のコード開発環境とGitのアップデート方法

Last updated at Posted at 2022-04-27
更新履歴
  • "git commit"の コメント(コードをどう変更したかを簡潔に) に""をつけ忘れていたので修正。
  • jupyter notebookをJupyterLabに訂正(現在は完全に乗り換えたため)。

これまで使用していたコードをいじる必要が出てきたので、現在のコード開発環境を記しておこうと思う。
あくまで一個人の一例であり、合う合わないはあると思う。
私のスタイルも今後変わる可能性がある。

以下のことについて記そうと思う。

  • エディタ(Atom)
  • バージョン管理(Git)
  • 研究ノート
  • ファイル管理
  • バックアップ

GitはHomebrewでアップデートも行ったので、その方法も記しておく。

はじめに

前提知識は以下の通りである。

  • 使用している言語はC, python
  • メインで使っている計算コードはfortranだったものをCに書き換えたもの
  • pythonはアウトプットデータの解析に使う
  • 図はjupyter notebookJupyterLabで作っている
  • コードを書くのはmacOSのノートパソコン
  • コードのコンパイルはcentOSの計算機

エディタの話

現在はAtomを使っている。
昔はEmacsを使っていたし、今でもcentOSの計算機上で少しコードをいじりたいときには、ターミナル上でEmacsを動かしている。

バージョン管理の話

Gitを使っている。
インストールはされている前提である。
新しいフォルダの場合、まずは初期化をする。

% cd <コードが置いてあるフォルダ>
% git init

あとは基本的に「ステータスの確認」→「ファイルの追加」→「コメントを付けてコミット」するだけである。

% git status
% git add <追加したいファイル>
% git commit -m "<コメント(コードをどう変更したかを簡潔に)>"

Gitのアップデート

随分としていなかった気がするので、この機会にしてみた。
なお、手探りでやっているのでこの順序が正しいとは思っていない。

% git --version
git version 2.13.0

最新バージョンは2.36.0らしい。
私はHomebrewを使っているので、以下のコマンドを入力。

% brew install git

無事できたみたいなので、バージョンを確認。

% git --version
git version 2.35.1

…最新バージョンになっていない?

Homebrewのアップデート

これを先にしなければいけなかったかも。

% brew --version
Homebrew 3.3.14
% brew update

時間がかかるので放置。

% brew upgrade

これもまた時間がかかるので放置。

% brew --version
Homebrew 3.4.9

Gitのアップデート(再)

% brew upgrade git

終わったらバージョンを確認。

% git --version
git version 2.36.0

Gitのグラフィカルインターフェース

前からgitkを使っている。

% gitk
zsh: command not found: gitk

…あれ?
ということでインストールした。

% brew install git-gui

これで、以下のコマンドでウィンドウが出てきて、コミットや変更箇所が非常にわかりやすく把握できる。

% gitk

研究ノート的なメモの話

紙のノートは無くしそう、検索できない、文字が汚い等の理由で全てノートパソコン上のtxtファイルに記している。
研究テーマごとに"memo.txt"を作っている。

ファイル管理の話

デバックを含めパラメータサーチをたくさんするので、アウトプットファイルは"case1", "case2"のようなフォルダにそれぞれ入れている。
"case100"は超えているので、それぞれで使ったパラメータなどを"memo.txt"にまとめている。
アウトプットデータから作った図のファイル名には"case"のあとの数字を入れるようにして、どのデータを使ったのかわかるようにしている。
例えば"mass_density_50.pdf", "mass_density_50-51-52.pdf"という感じである。

バックアップの話

大きく分けて、日々のバックアップ、ノートパソコン全体のバックアップの2種類に分けている。

日々のバックアップ

Dropboxの無料分(2GB)を使っている。
重要なものだけをピックアップしている。
少し面倒だが、お金がかけられないのでしょうがない。

ノートパソコン全体のバックアップ

HDDで定期的にバックアップを取っている。
1-2週間ごとにケーブルを繋いでTime machineを使ってバックアップを取っている。
D論前はもっと頻繁にバックアップを取っていた。

計算機のバックアップ

良くないと思うが取っていない。

おわりに

ノートパソコンを新しくすると、データは移行できるけど環境はもう一度整えないといけない。
ついでにアップデートもしていると本業の研究がなかなか進まない気がしてくる。
しかし必要な作業なので頑張るしかないのである。

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