ビルド済みアプリ(クライアント)とUnity Editor上でのアプリ（サーバ）で疎通する際に、

IndexOutOfRangeException: NetworkReader:ReadByte out of range:NetBuf sz:0 pos:0
  at UnityEngine.Networking.NetBuffer.ReadByte () [0x0004c] in

というエラーが出ました。SyncTime　という時間を同期するライブラリを使っていたのですが、そこのReadMessageでメッセージが空になっている？ためか、メッセージのデシリアライズ処理（文字列から構造体に戻す処理）で失敗する というのが、エラーの内容でした。

var msg = netMsg.ReadMessage<SyncTimeMessage>();

結局、 Multiplayer HLAPI (通称UNET)のバージョンを1.0.8から1.1.1に更新することで上記のエラーが消えました。以下は、manifest.jsonで変更した内容。

"com.unity.multiplayer-hlapi": "1.1.1",

また、ややこしいですが、Multiplayer HLAPIはなぜかキャッシュがのこってしまっていて、1.1.1から1.0.8に戻すとエラーが起こらないので、Libraryフォルダのライブラリキャッシュを消す必要があります。

最後に

UNETの互換性のあるMirror に移行するのが主流ですので、みなさん、なるべく、そっちに移行しましょう。（自分の場合はどうしても直近で必要だったので、このような対応としましたが）

Mirrorは1フレームごとに送れるバイト数が大きく、バグもUNETと比べてかなり少なく、コミュニティも大きいのでおすすめです。