uvとは
poetryやpipのようなバージョン管理ツールであり、他ツールより高速に扱える。
問題点
uv add pyradiomics
でダウンロードしようとしても以下のエラーが出る。
原因は以下の2点
- pyradiomcsの公式パッケージはpython3.9までしか対応していない
- 3.10以降に対応するために必要なclangというC言語のコンパイラが入っていない
error: command 'clang' failed: No such file or directory
私の環境では、権限でpipを使うことができないため、uvでpyradiomicsをインストールするように四苦八苦した。
試したこと
以下3点を試した。clangとpyradiomicsの手動ダウンロードで解決した。
- clangをuvでインストールする
- clangを手動でインストールする
- pyradiomicsを手動でインストールする
clangをuvでインストールする
以下のコマンドでpython内蔵のclangをインストールしたが、uvはあくまでもpythonパッケージをインストールするもので、clnagのようなCコンパイラを管理できない。
uv add clang
clangを手動でインストールする
上記理由から、clangをサイトからインストールした。
https://releases.llvm.org/download.html
そして、clangの環境パスを通した後、再度以下を実行した。
uv add pyradiomics
すると、このようなエラーが出た。
× Failed to build pyradiomics==3.1.0
├─▶ The build backend returned an error
╰─▶ Call to setuptools.build_meta.build_wheel failed (exit status: 1)
-------------------------------------------------------------------
hint: This error likely indicates that you need to install a library that provides "cmatrices.h" for pyradiomics@3.0.1a1
Pypl公式のpyradiomicsをダウンロードするパッケージには"cmatrices.h"が含まれていない？ようだ。
pyradiomicsを手動でインストールする
Githubからpyradiomcsを直接ダウンロードする。
git clone https://github.com/Radiomics/pyradiomics.git
cd pyradiomics
python setup.py build
python setup.py install
uv pip install .
でGithubから直接インストールすることができる。
その後、再度uv addを唱え、無事にインストールできた。
uv add clang
まとめ
pyradiomicsをuvでインストールする方法についての備忘録である。
pipが使える環境であれば、苦労することがないと思うが、Githubから直接ライブラリをインストールする方法を習得できたので僥倖である。