mlpyをwindows 64bit環境でビルド
mlpyのwindows用バイナリは32bit用しか提供されないので、自力でビルドします
使用環境：
- python3.3.5(64bit)
- windows7 64bit sp1
- Visual Studio 2010
準備
必要なライブラリを入手
- numpy
- scipy
- GSL
numpy, scipyのインストール
mlpyを使おうとしているなら既にインストールされていると思います。
ない場合は、pip install numpy scipyでインストールしてください
GSLのビルド
スタティックライブラリが必要になります。
私は半年以上前に別件でGSLをビルドしていたのですが、現在は状況が変わっているようです。
以前
私がやった時は、以下のリンクを参考にしました。意外と簡単に出来ました。
現在
現在では、visual studioのプロジェクトへのリンクが消滅しています。
バージョンが少し古いですが、gsl-1.15-vc10.zipを配布しているページは見つかりました。
また、All in Oneパッケージらしきもの(gnu-gsl-for-windows)がありました。
どちらも利用していないので、本当に利用可能かはわかりません。
※2014/7/3追記：gnu-gsl-for-windowsは予想通り使えました。
mlpyの修正
64bit環境用にソースコードを修正します。
setup.pyの"win32"を"win-amd64"に変更。ただし、25行目はそのまま
before
setup.py(29-41行)
#### libs
if get_platform() == "win32":
gsl_lib = ['gsl', 'cblas']
math_lib = []
else:
gsl_lib = ['gsl', 'gslcblas']
math_lib = ['m']
#### Extra compile args
if get_platform() == "win32":
extra_compile_args = []
else:
extra_compile_args = ['-Wno-strict-prototypes']
after
setup.py(29-41行)
#### libs
if get_platform() == "win-amd64":
gsl_lib = ['gsl', 'cblas']
math_lib = []
else:
gsl_lib = ['gsl', 'gslcblas']
math_lib = ['m']
#### Extra compile args
if get_platform() == "win-amd64":
extra_compile_args = []
else:
extra_compile_args = ['-Wno-strict-prototypes']
コメントの２バイト文字を修正。Θと二重引用符(”)を削除
before
mlpy/fastcluster/fastcluster/src/fastcluster.cpp(630-632行)
// Complexity: Θ(size)
// Reference: Cormen, Leiserson, Rivest, Stein, Introduction to Algorithms,
// 3rd ed., 2009, Section 6.3 “Building a heap”
after
コメントを削除
np.int_tをnp.int64_tに変更
修正をしないとint型とlong long型の不一致による実行時エラーが発生してTutorialすら実行できません。
他にも修正が必要な個所があるかもしれませんが、今のところ発見できていません
before
mlpy/libsvm/libsvm.pyx(28-32行)
# array 1D to svm node
cdef svm_node *array1d_to_node(np.ndarray[np.float64_t, ndim=1] x):
cdef int i, k
cdef np.ndarray[np.int_t, ndim=1] nz
cdef svm_node *ret
after
mlpy/libsvm/libsvm.pyx(28-32行)
# array 1D to svm node
cdef svm_node *array1d_to_node(np.ndarray[np.float64_t, ndim=1] x):
cdef int i, k
cdef np.ndarray[np.int64_t, ndim=1] nz
cdef svm_node *ret
before
mlpy/adatron/adatron.pyx(69-73行)
cdef np.ndarray[np.int_t, ndim=1] ynew
cdef np.ndarray[np.float_t, ndim=2] K_arr
cdef np.ndarray[np.float_t, ndim=1] alpha_arr
cdef double margin
after
mlpy/adatron/adatron.pyx(69-73行)
cdef np.ndarray[np.int64_t, ndim=1] ynew
cdef np.ndarray[np.float_t, ndim=2] K_arr
cdef np.ndarray[np.float_t, ndim=1] alpha_arr
cdef double margin
mlpyのビルド
お待たせしました
あとは
set LIB=%LIB%;(gsl.lib,cblas.libがあるディレクトリ)
python setup.py build_ext --include-dirs=(gslのインクルードディレクトリ)
python setup.py install
もしくは(anacondaをインストールした場合)
python setup.py build_ext --include-dirs=(gslのインクルードディレクトリ) --compiler=msvc install
で完了です。
お疲れ様でした。