[Python3 / pandas] colaboratory上で、pandas_profilingのProfileReportを実行するとエラーコンボが発生

Summary(概要)

発生したエラーはこれら。

# 1. join_axesなんて引き数は知らないよ
TypeError: concat() got an unexpected keyword argument 'join_axes'

# 2. pandas_profiling.mplstyleってファイルが見つからないよ
FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: '/usr/local/lib/python3.7/dist-packages/pandas_profiling/pandas_profiling.mplstyle'

# 3. 新しいバージョン使いたかったらruntime再起動してね
WARNING: The following packages were previously imported in this runtime:
  [pandas_profiling]
You must restart the runtime in order to use newly installed versions.

この対処法を書いていく。

Environment(環境)

Target	Versionなど
colabortory	(2021/11/13現在)
pandas-profiling	3.1.0

pandas-profiling のバージョンはこうやって確認した

Detail

サンプルとして、scikit-learnのirisのデータでやるね。

import pandas as pd
from sklearn.datasets import load_iris
x, t = load_iris(return_X_y=True)
df = pd.DataFrame(x)
df

0   1   2   3
0   5.1 3.5 1.4 0.2
1   4.9 3.0 1.4 0.2
2   4.7 3.2 1.3 0.2
3   4.6 3.1 1.5 0.2
4   5.0 3.6 1.4 0.2
... ... ... ... ...
145 6.7 3.0 5.2 2.3
146 6.3 2.5 5.0 1.9
147 6.5 3.0 5.2 2.0
148 6.2 3.4 5.4 2.3
149 5.9 3.0 5.1 1.8
150 rows × 4 columns

1. エラー1個目

1-1. エラー内容

from pandas_profiling import ProfileReport
report = ProfileReport(df)
report

/usr/local/lib/python3.7/dist-packages/pandas_profiling/describe.py in describe(df, bins, check_correlation, correlation_threshold, correlation_overrides, check_recoded, pool_size, **kwargs)
    390             if name not in names:
    391                 names.append(name)
--> 392     variable_stats = pd.concat(ldesc, join_axes=pd.Index([names]), axis=1)
    393     variable_stats.columns.names = df.columns.names
    394 

TypeError: concat() got an unexpected keyword argument 'join_axes'

ぷわーｗ

1-2. 対処法

この、1個目のエラーの対処法はこちらの記事に記載されているよ。

!pip install -U pandas_profiling

を実行すればよいとのこと。

2. エラー2個目

2-1. エラー内容

!pip install -U pandas_profiling

from pandas_profiling import ProfileReport
report = ProfileReport(df)
report

FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: '/usr/local/lib/python3.7/dist-packages/pandas_profiling/pandas_profiling.mplstyle'

During handling of the above exception, another exception occurred:

OSError                                   Traceback (most recent call last)
/usr/local/lib/python3.7/dist-packages/matplotlib/style/core.py in use(style)
    118                     "{!r} not found in the style library and input is not a "
    119                     "valid URL or path; see `style.available` for list of "
--> 120                     "available styles".format(style))
    121 
    122 

OSError: '/usr/local/lib/python3.7/dist-packages/pandas_profiling/pandas_profiling.mplstyle' not found in the style library and input is not a valid URL or path; see `style.available` for list of available styles

(^ワ^#)イラッ☆彡

2-2. 対処法

今度はこっちに書かれていた。

pandas_profilingを1回アンインストールしろということらしい。¹
OK。

これでどうや！

!pip uninstall pandas_profiling
!pip install -U pandas_profiling
from pandas_profiling import ProfileReport
report = ProfileReport(df)
report

なんか出たけど処理が止まった。

実は、この点滅しているところをクリックすると、文字を入力できる。

Proceed (y/n)?: 進めていい？ (yes or no)

と聞かれているので、yesの意味の y(半角) を入力してEnterキーを押す。

すると処理が進む

Found existing installation: pandas-profiling 3.1.0
Uninstalling pandas-profiling-3.1.0:
  Would remove:
    /usr/local/bin/pandas_profiling
    /usr/local/lib/python3.7/dist-packages/pandas_profiling-3.1.0.dist-info/*
    /usr/local/lib/python3.7/dist-packages/pandas_profiling/*
Proceed (y/n)? y
  Successfully uninstalled pandas-profiling-3.1.0
Collecting pandas_profiling
  Using cached pandas_profiling-3.1.0-py2.py3-none-any.whl (261 kB)
Requirement already satisfied: jinja2>=2.11.1 in /usr/local/lib/python3.7/dist-packages (from pandas_profiling) (2.11.3)

~ 略 ~

Requirement already satisfied: PyWavelets in /usr/local/lib/python3.7/dist-packages (from imagehash->visions[type_image_path]==0.7.4->pandas_profiling) (1.2.0)
Installing collected packages: pandas-profiling
Successfully installed pandas-profiling-3.1.0

そしてこんな感じのが出る。

ん～～～全然先に進めませんねぇ(^ワ^##)

3. エラー3個目(warning)

3-1. エラー内容

WARNING: The following packages were previously imported in this runtime:
[pandas_profiling]
You must restart the runtime in order to use newly installed versions.

3-2. 対処法

大人しく言われた通り、RESTART RUNTIMEする。
表示されている灰色のボタンを押せばOK。

そして、先ほどまで行ってきたことを再度実行する。

すると、次のような結果が表示される!(^ワ^*)

おしまい！！

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1. 実は、一つ目のエラーの対処法の記事にも同じことが書かれていたが、自分がその条件に該当するとは気が付かなかった。自分でインストールした覚えはなかったので「インストールしてる人は」と書かれていてもスルーしてしまったが、実際にはcolaboratoryには最初からインストールされていたので、colaboratoryを使う人はおそらく全員「インストールしてる人は」に該当する。 ↩