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@shu65(Shuji Suzuki)

NCBI BLASTをローカルでコンパイル

C++

Last updated at 2015-08-23Posted at 2015-08-23

手元の環境でバイナリの実行時にエラーがでて動かせないので仕方なくローカルでコンパイル。

実行環境

OS: CentOS 5.1
gcc : 4.4.6
NCBI BLAST: 2.2.31+

コンパイル

tar xvf ncbi-blast-2.2.31+-src.tar.gz 
cd ncbi-blast-2.2.31+-src/c++
./configure --without-debug --with-mt --with-build-root=ReleaseMT --with-64 --with-static 
make

これでReleaseMT/binにblast関係のバイナリができている。

注意点

原因はわかっていないがmakeのあとにmake installをするとatic.aがないといわれる。ただ、現状makeblastdbとblastxは動いているようなので調査は保留

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