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Pythonでファイル名に目的の文字列を含むデータファイルを取得

Last updated at Posted at 2023-09-09

背景

他チームからデータファイルを連携されて集計や分析を依頼されることがある。
その際にファイルが1つにまとまっていると扱いやすいが、データの種類でファイルが分かれていたり、データ件数が多いために分割されて連携されることがあるので、それらをひとまとめにする作業の備忘録。
ファイル名を直接打ち込むことなく、条件に合ったファイルのみ取得しまとめることで、入力ミスや読み込みの漏れを解消することが目的。
ここでは簡易的に、Google Driveに格納されたIDごとのスコアのデータファイル複数とセグメントのデータファイル複数をひとまとめにすることを考える。
data.png

コード

import pandas as pd
import os
# データの格納場所を設定
PATH = '/content/drive/MyDrive/data'
# データの格納場所からファイル名の一覧を取得
files = os.listdir(PATH)
files

['data_score_1_20.csv',
'data_score_21_40.csv',
'data_score_41_80.csv',
'data_segment_41_80.csv',
'data_segment_1_20.csv',
'data_segment_21_40.csv']

# scoreのデータファイルのみファイル名を取得
target = 'score'
file_name_list = [file for file in files if target in file]
file_name_list.sort()
file_name_list

['data_score_1_20.csv', 'data_score_21_40.csv', 'data_score_41_80.csv']

# scoreのデータのみ読み込み、縦結合、id列をインデックスに設定
score_data = pd.DataFrame()
for read_file in file_name_list:
    tmp = pd.read_csv(os.path.join(PATH, read_file))
    score_data = pd.concat([score_data, tmp])

score_data.set_index('id', inplace=True)
score_data
id score
1 14
2 32
3 24
4 10
5 60
... ...
76 51
77 32
78 80
79 26
80 49
# segmentのデータファイルのみファイル名を取得
target = 'segment'
file_name_list = [file for file in files if target in file]
file_name_list.sort()
file_name_list

['data_segment_1_20.csv', 'data_segment_21_40.csv', 'data_segment_41_80.csv']

# segmentのデータのみ読み込み、縦結合、id列をインデックスに設定
segment_data = pd.DataFrame()
for read_file in file_name_list:
    tmp = pd.read_csv(os.path.join(PATH, read_file))
    segment_data = pd.concat([segment_data, tmp])

segment_data.set_index('id', inplace=True)
segment_data
id segment
1 5
2 1
3 2
4 4
5 5
... ...
76 2
77 3
78 5
79 5
80 5
# scoreのデータとsegmentのデータを横結合
merge_data = pd.concat([score_data, segment_data], axis=1)
merge_data
id score segment
1 14 5
2 32 1
3 24 2
4 10 4
5 60 5
... ... ...
76 51 2
77 32 3
78 80 5
79 26 5
80 49 5
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