http://developer.android.com/intl/ja/training/system-ui/navigation.html に書いてありました。
サンプルではステータスバーも消すようなコードが書かれていますが、ナビゲーションバーだけを消したいだけなら以下で大丈夫そうです。
View decorView = getWindow().getDecorView(); decorView.setSystemUiVisibility(View.SYSTEM_UI_FLAG_HIDE_NAVIGATION);
但し、上記のコードだと1回どこかをタップなどすると再度ナビゲーションバーが表示されてしまうのでそのあたりの調整は別途行う必要がありそうです。