起きた問題

マイグレーションファイルにrefereces型のカラムを追加したかったが、マイグレーションできなかった。

試したこと

全てロールバックした後、DBを削除し作り直し、マイグレーション。←ダメ
試しにreferenes型のカラムだけマイグレーションファイルから消してマイグレーション。　←できる

解決方法

参照先：箱のプログラミング日記。様
ありがとうございます

rails g migration Addカラム名Toテーブル名追加したいカラム名：カラム型でマイグレーションファイルを生成。

中身を以下の内容に書き換え。

class AdduserToPrototypes < ActiveRecord::Migration[6.0]
  def change
    change_table :Prototypes do |t|
      t.references :user, foreign_key: true, presence: true
    end
  end
end

これでマイグレーションできました。