SublimeTextとJapaneseIMでショートカットが被っててうざかったので、
まったく使わんJapaneseIMのほうを消すことにした。

SublimeText
- Focus Group → Ctrl+数字
JapaneseIM
- 関連文字に変換 → Ctrl+1
- 部品の共通な感じを検索 → Ctrl+2

調べたらショートカットの設定ファイルがあるとのこと。
/System/Library/Input Methods/JapaneseIM.app/Contents/Resources/KeySetting_Default.plist

こいつの該当部分をコメントアウトしてMacを再起動する

<!--
  <key>control+&apos;1&apos;</key>
  <dict>
    <key>command</key>
    <string>show_related_characters</string>
    <key>menu_item</key>
    <true/>
  </dict>
  <key>control+&apos;2&apos;</key>
  <dict>
    <key>command</key>
    <string>show_similar_characters</string>
    <key>menu_item</key>
    <true/>
  </dict>
-->

無事、ショートカットの消失を確認をし、事なきを得た。
めでたしめでたし。