geopandas インストールはチェンネルに注意

実行環境 Windows10, conda 4.8.3, python 3.9.5, geopandas 0.9.0

はじめに

普段シェープファイルの処理は PyShp で間に合わせているのですが、Pandas-like な処理をしたいとか、大量のレコードを扱いたいとか多々あるので、GeoPandas に手を出すことにしました。

さっそく conda の仮想環境から GeoPandas をインストールして使おうとしたのですが、例によってつまづいた のでここに記します。

Qiita でも既に同様の内容の記事はいくつかありますが、記録という意味も込めて投稿しています。

要約すると以下の通り。

エラー内容: GeoPandas をインストールできない、またはインポートできない
原因: パッケージをインストールするチャンネルの混在
対応: 仮想環境でパッケージ経由チャンネルを conda-forge にそろえる

分かっている人には当たり前のことなのでしょうけれど。

以降詳細です。

Try 1

以下の条件で GeoPandas をインストールしてみる

Python: default チャンネルからインストール
GeoPandas: conda-forge チャンネルからインストール

インストールはできる

$ conda install -c conda-forge geopandas

インポートができない（エラーレコードを一部省略）

>>> import geopandas
    ...
    OSError: could not find or load spatialindex_c-64.dll

spatialindex_c-64.dll が見つからない、またはロードできませんと言われました。

失敗。

Try 2

以下の条件で GeoPandas をインストールしてみる

Python: default チャンネルからインストール
GeoPandas: default チャンネルからインストール

インストールできない（エラーレコードを一部省略）

$ conda install geopandas
  ...
  Found conflicts! Looking for incompatible packages.
  ...
  UnsatisfiableError: The following specifications were found to be incompatible with each other:

競合が見つかりました、仕様は互換性がありませんでした、みたいなことを言われます。

失敗。

Try 3

以下の条件で GeoPandas をインストールしてみる

Python: conda-forge チャンネルからインストール
GeoPandas: conda-forge チャンネルからインストール

まず、conda-forgeからPython本体をインストール

$ conda install -c conda-forge python

つぎに、GeoPandasをインストール

$ conda install -c conda-forge geopandas

GeoPandasをインポート

import geopandas

これでうまくいきました。

チャンネルとは

そもそも conda-forge とは何か、という今更な疑問に直面したので調べました。

conda-forge is a GitHub organization containing repositories of conda recipes.

（conda-forge のトップページからの抜粋）

つまり conda 公式リポジトリではなく、別の GitHub のリポジトリで管理されているPython パッケージ集の１つということですよね。

言ってしまえばその通り。

なお、conda info コマンドでデフォルトチャンネルの URL が出てきます。

一部のみ抜粋

$ conda info
  ...
  channel URLs : https://repo.anaconda.com/pkgs/main/win-64
                 https://repo.anaconda.com/pkgs/main/noarch
                 https://repo.anaconda.com/pkgs/r/win-64
                 https://repo.anaconda.com/pkgs/r/noarch
                 https://repo.anaconda.com/pkgs/msys2/win-64
                 https://repo.anaconda.com/pkgs/msys2/noarch
  ...

ちなみに、pip は PyPI がチャンネルになります。

さらにそもそもな話ですが、

GeoPandas 公式ホームページ -> Getting started -> Installation

の Using the conda-forge channel の Note に、

両方のチェンネルのパッケージの混在はインポートの問題を引き起こすので、デフォルトか conda-forge のどちらかから、すべてをインストールすることを強く勧めます

みたいなことがしっかり書いてありました。
反省。

最後に

Python 本体と GeoPandas をインストールするときのチャンネルを conda-forge に統一することで、GeoPandas を問題なく使えるようになりました。

conda を使う以上 pip は使わない、という基本的な心掛けはもっていましたが、conda の仮想環境のチャンネルの混在は気にしていませんでした。

これを機に仮想環境を再構築した次第です。

ということで GeoPandas 使っていきたいと思います。