前提

以下のURLを参考にgit-remote-codecommitのセットアップを行い、remote-codecommit形式でgit cloneできる状態にします。
https://docs.aws.amazon.com/ja_jp/codecommit/latest/userguide/setting-up-git-remote-codecommit.html

fastlane matchで使う

git_url に remote-codecommit形式のURLを指定します。
app_certificatesというCodeCommitのリポジトリを使うとすると以下のようになります。

export CERT_REPO=codecommit::ap-northeast-1://app_certificates
bundle exec fastlane match development -a $MAIN_BUNDLE_ID --verbose --git_url=$CERT_REPO

ちなみにSwitchRoleなどを使っておりプロファイル名を指定する必要がある場合は以下のようにリポジトリを指定します。

export CERT_REPO=codecommit::ap-northeast-1://{プロファイル名}@app_certificates