Gitはデフォルトでファイル名の大文字・小文字の変更は検知しない設定になっている。
(たとえば、hoge.htmlからHoge.htmlにしても検知しない)
$ git config -l --local | grep core.ignorecase
core.ignorecase=true
これをfalseにしてあげたらOK.
$ git config core.ignorecase false
確認。
$ git config -l --local | grep core.ignorecase
core.ignorecase=false