EditorWindowのOnGUIを好き勝手呼び出す

とは言ったものの、void Update() { OnGUI(); } のように直接呼び出すことはできません。

Repaintメソッドを使う

一番簡単なOnGUIの呼び出し方としては、EditorWindow.Repaintメソッドを呼び出す事だと思います。

#if UNITY_EDITOR
using UnityEngine;
using UnityEditor;

public class FrameCountWindow : EditorWindow
{
    [MenuItem("Window/FrameCountWindow")]
    public static void OpenWindow()
    {
        GetWindow<FrameCountWindow>();
    }

    void OnGUI ()
    {
        EditorGUILayout.LabelField ("Frame: " + Time.frameCount);
    }

    // 毎フレーム更新
    void Update()
    {
        Repaint();
    }
}
#endif

メニューバーからFrameCountWindowを開けます。
Playすると、下の画像の'Frame: xxx'が凄い勢いで回っていきます。

ただ、Repaintした瞬間に再描画が行われるわけではないでしょうね。
OnGUIの呼び出し自体は普通のフローで行われているでしょう。きっと。

イベントを発行する

Repaintメソッドを使わない方法としては、自分でEditorWindowに対して再描画関係のイベントを発行する、というものがあります。

#if UNITY_EDITOR
using UnityEngine;
using UnityEditor;

public class FrameCountWindow : EditorWindow
{
    [MenuItem("Window/FrameCountWindow")]
    public static void OpenWindow()
    {
        GetWindow<FrameCountWindow>();
    }

    void OnGUI ()
    {
        EditorGUILayout.LabelField ("Frame: " + Time.frameCount);
        Debug.Log(Event.current.commandName);
    }

    // 毎フレーム更新
    void Update()
    {
        var editorEvent = EditorGUIUtility.CommandEvent("Count" + Time.frameCount);
        editorEvent.type = EventType.Used;
        SendEvent(editorEvent);
    }
}
#endif

上記の例では、EditorGUIUtility.CommandEventメソッドでイベントを作成し、そのイベントを自身にSendEventして投げ込んでいます。

EditorGUIUtility.CommandEventメソッドの引数の文字列については、何でも大丈夫です。
この文字列は、OnGUIメソッド内ではEvent.current.commandNameで取り出すことができます。

editorEvent.type = EventType.Used;で設定しているEventTypeについては、ものによってはOnGUIが呼ばれない事がある点に注意して下さい。

またこの方法も、あくまでイベントを発行しているだけであり、SendEventした瞬間にOnGUIが呼ばれているわけではありません。きっと。

おわり

今回は、EditorWindow内で自身を再描画するという処理だったので、あんまりありがたみの無いサンプルになってしまいましたね。
ただ、EditorWindow.RepaintとEditorWindow.SendEventは共にpublicなメソッドなので、どこからでも呼び出すことができます。
「エディタでPlay中にリアルタイムでEditorWindowを更新したい！」なんて状況で使えるかもしれません。