Matlab => Python 移行メモ

序

• MATLABユーザーがPythonを触るメモ
• 順次改稿

環境

• spyder 重い，見た目わるい気がする Rstudioとかに完成度で劣る気がする
• Enthought canopy 覚えてない
• visual studio 重い，windows
• emacs + jedi.el + ipython で補完は充分だと思う
• Atom, Subime + ipython 試していないけど外部モジュールも補完してくれるなら充分では

startup

MATLABでstartup.mというのを MATLAB/ においてると起動時に実行してくれるので，そこでパスの設定をしていたんだけど ipython では "~/.ipython/profile_default/startup/00-hoge.py" とかに書けば良いらしい．以下READMEより．windowsは知らん．

This is the IPython startup directory
.py and .ipy files in this directory will be run *prior* to any code or files specified
via the exec_lines or exec_files configurables whenever you load this profile.

Files will be run in lexicographical order, so you can control the execution order of files
with a prefix, e.g.
    00-first.py
    50-middle.py
    99-last.ipy
    

とりあえずこれだけ書いといた

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

感想

• 最近のMATLABでは改善してるけど名前空間がわかりやすくて良い
• 文字コード，とくにエスケープがややこしい
• ipythonが時々補完してくれなくてこまる
• スクレイピングはまぁ楽
• グラフはMATLABの方が色々融通が利いて良い気がする

文法

インデックス

• a(1:end) => a[0:]
• a(1:end-1) => a[0:-1]

関数関連

標準的な処理ともかく統計や画像処理のパッケージの定番が最初よくわからなかった

システム

• mkdir => os.mkdir
• tic => t = time.time()
• toc => time.time()-t
• disp => print "Hello"

行列

大体 numpyでなんとかなるぽい

• A(:) => A.ravel()
• num2str => "{0:04d}".format(A[i])

統計

簡単な関数はnumpyに入ってる．あとは大体scipy.statsで足りそう

• median(A) => numpy.median(A)
• mean(A) => numpy.mean(A)
• std(A) => numpy.std(A)
• corrcoef => numpy.corrcoef
• signrank => scipy.stats.wilcoxon
• zscore => scipy.stats.mstats.zscore

画像処理関連

skimageが一位番IPTに近い？

• imadjust => skimage.transform.rescale_intensity
• imresize => skimage.transform.resize
• imread => skimage.io.imread
• imwrite => skimage.io.imsave