本題

Eclipseを強制終了した際など、次に起動するときにこんなメッセージが表示されて起動できないことがあります。

An error has occurred. See the log file[workspace]\.metadata\.log.

続いて、何はともあれとりあえず記載のログを確認してみると、こんな内容が書いてあることがあります。

!MESSAGE Job found still running after platform shutdown. Jobs should be canceled by the plugin that scheduled them during shutdown

なにやら、「まだJOBが動いているので止めろ」的なようです。

この場合、てっとりばやく直すには、.metadataをフォルダごと削除するのがいいです。
削除しようとして怒られたら、移動させてやります。

内容の理解と注意

.metadataとは
.metadataはワークスペースの設定内容を保持しています。
よって、こいつを削除するということは、同時にワークスペースを失い、ウィンドウに設定していた環境設定などが消えてしまうことになります。
なので、削除すると解決はしますが、結構困ったことになるので、.metadataの中で原因を頑張って突き止めつつ、嫌になったらエイヤと削除するのがいいのではないでしょうか。