M1 Macでのpython環境の構築(pyenv + miniforge)

はじめに

これまでなんとなく利用してきた Mac での python 環境を見直し、pyenv + miniforge で環境構築し、気象ライブラリであるMetpyとJupiter Labを利用可能にしたため、その過程を記録する。

python環境見直しの一つのきっかけは、これまで利用していたpythonのpipを使ってMetPyがインストールできなかったことであった。

目標

• pyenv + miniforge で python 環境を構築する
• MetPyを Jupyter Lab で利用できるようにする

環境

• PC: Makbook Pro (13-inch, M1, 2020)
• OS: MacOS Big Sur (Version 11.5.2)

方針

• pyenv でpythonの実行環境を管理する
• miniconda のフォークである miniforge (3-4.10.1-5)を用いる
• miniforgeとはさまざまなCPUアーキテクチャ（intelのx86_64やppc64le、Apple M1を含むaarch64）のサポートに重点を置いたMiniconda。
• M1チップでは、pyenvを用いてpython(3.10.0や3.9.7)やanaconda3-2021.05がインストールできなかった。このため、M1チップで利用可能なminiforgeを用いることにした。
• パッケージ管理は conda で行う
  • miniforgeはconda 系のパッケージ管理ツールであるため

参考HP

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上記HPでは以下の3つの方法が記述されており、今回は2を選択した。

1. Homebrewで直接pythonをインストールする
2. Anaconda環境(miniforge)を使う
3. Dockerを使う

M1 Macの罠が詳しく書かれている

インストール

pyenv のインストール

git を利用して、ホームディレクトリ以下にpyenvをインストールした。

$ git clone https://github.com/pyenv/pyenv.git ~/.pyenv

.bashrcの設定と読み込み

$ echo 'export PYENV_ROOT="$HOME/.pyenv"' >> ~/.bashrc
$ echo 'export PATH="$PYENV_ROOT/bin:$PATH"' >> ~/.bashrc
$ echo -e 'if command -v pyenv 1>/dev/null 2>&1; then\n  eval "$(pyenv init -)"\nfi' >> ~/.bashrc
$ source .bashrc

pyenv の利用法

python や miniconda などのインストール可能なパッケージの表示

$ pyenv install --list

pyenv-virtualenvのインストール

現状まだ利用していないが、インストールしておく。

$ git clone https://github.com/pyenv/pyenv-virtualenv.git $(pyenv root)/plugins/pyenv-virtualenv
$  echo 'eval "$(pyenv virtualenv-init -)"' >> ~/.bashrc

miniforgeのインストール

インストール

$ pyenv install miniforge3-4.10.1-5

利用するパッケージ(miniforge)を指定する。

$ pyenv global miniforge3-4.10.1-5

global は自分がいるディレクトリに関わらず適用される設定。
（特定のディレクトリ以下に適用させるには global ではなく local とする。）

今現在インストールされているPythonやminiforgeのバージョンを確認

$ pyenv versions
  system
* miniforge3-4.10.1-5 (set by /Users/katon/.pyenv/version)

~/.pyenv 以下にインストールされた miniforgeが利用されていることを確認できる。
ここで、system というのはpyenvではなく、OS側で用意されているpythonになる。

condaコマンドを利用可能にする

$ conda activate

コマンドラインが以下の表示になる

(base) (miniforge3-4.10.1-5) katon@kyudai ~ %

conda コマンドは以下を参照。

metpyのインストール

$ conda install -c conda-forge metpy

jupyterのインストール

Jupyter Notebookの後継であるJupyterLabを利用するためには、jupyterをインストールすればよい。

インストール

$ conda install jupyter

以下のコマンドで jupiter lab が起動できた。

$ jupyter lab

MetPyの以下のサンプルコードがjupiter lab上で動くことが確認できた。

scikit image のインストール

conda install scikit-image