未整理公開フォルダの書き方は忘れやすいので備忘として記載。
package.xml
<types>
<!-- 未整理公開フォルダのレポート -->
<members>unfiled$public/レポートの一意名</members>
<!-- 公開フォルダのレポート(未整理でない) -->
<members>レポートフォルダの一意名/レポートの一意名</members>
<name>Report</name>
</types>
参考
■Report | メタデータ API 開発者ガイド
https://developer.salesforce.com/docs/atlas.ja-jp.api_meta.meta/api_meta/meta_report.htm