Pydub (http://pydub.com/) とかいう音楽データを簡単に操作できるライブラリを見つけたので、
WAVファイルを合成して遊んでみた。
ffmpeg か avconv を入れつつ、 pip install pydub でインストール。
ソースコードはこんな感じ
#!/usr/bin/env python2.7
#-*- coding: utf-8 -*-
from pydub import AudioSegment
sound1 = AudioSegment.from_wav("path to wav file 1")
sound2 = AudioSegment.from_wav("path to wav file 2")
sound3 = AudioSegment.from_wav("path to wav file 3")
combined_sounds = sound1 + sound2 + sound3
combined_sounds.export("path to save path/combined_sounds.wav", format="wav")