最新版OpenPBSをCentOS6にインストールしてクライアントノードとして動かす

前提

• 既にあるPBSサーバ (192.168.1.1 : pon) に新しいクライアントノード (192.168.1.2 : suke) を追加する
• サーバはCentOS7だが（あまり関係ない）追加したいクライアントはCentOS6
• 最新版のOpenPBSを想定
• pon と suke は 必ず 同一サブネットにいること　

以下、新規PBSクライアント suke での作業

Python>=3.6 を IUS Community Project リポジトリ からインストール

• リポジトリ追加して python36-devel インストール
• CentOS6 のpython は /usr/bin に 2.6 だかが入ってるけど、これを上書きしてしまうとyum自体やらなんやらが動かなくなる可能性有り
• /usr/local/bin と /usr/local/lib に python36 として置くことにする

# yum install -y https://repo.ius.io/ius-release-el6.rpm
# yum install -y python36-devel.x86_64
# cd /usr/local/bin
# ln -s /usr/bin/python3* .
# ln -s python36 python3
# cd /usr/local/lib
# ln -s /usr/lib/python3* .

swig 3 を python36 に絡めてインストール

• ソースを取得　http://swig.sourceforge.net/download.html

$ cd swig-3.0.12
$ ./configure --with-python3=/usr/local/bin
$ make
# make install

OpenPBSのソースを取得

• サーバ pon のPBSと同じバージョンを入手、バージョン確認の方法はサーバ上で qstat --version
• https://github.com/openpbs/openpbs/releases

INSTALL を読んで依存関係をチェックし、足りないのを入れる

$ cd openpbs-master
$ less INSTALL

• For CentOS-7 systems you should run the following command as root: とか書いてあるけどCentOS6でも同じ
• 今回の場合、自分が入れたのは

# yum install -y libtool hwloc-devel autoconf libX11-devel \
      libXt-devel libedit-devel libical-devel postgresql-devel \
      tcl-devel tk-devel expat-devel openssl-devel libXext libXft

OpenPBS インストール！

• --prefix=/opt/pbs とかが流行ってるようだけど面倒なのでしない。お好きに。

$ ./configure --with-python=/usr/local --with-swig=/usr/local

• もし checking for libical... configure: error: libical headers not found. 等のエラーが出たら、ical.h が、/usr/include でなく、/usr/include/libical に入っているのかも。下記のようにしてから再度 ./configire

$ cd /usr/include
$ ln -s /usr/include/libical/* .

configure が通ったら

$ make
# make install
# /usr/local/libexec/pbs_postinstall

• 最後の libexec/pbs_postinstall で、/etc/pbs.conf, /etc/init.d/pbsや、/var/spool/pbs ディレクトリが作られる

OpenPBS設定

# vi /etc/pbs.conf
 ... 省略 ...
# cat /etc/pbs.conf
  PBS_SERVER=pon
  PBS_START_SERVER=0
  PBS_START_SCHED=0
  PBS_START_COMM=0
  PBS_START_MOM=1
  PBS_EXEC=/usr/local
  PBS_HOME=/var/spool/pbs
  PBS_CORE_LIMIT=unlimited
  PBS_SCP=/usr/bin/scp

# vi /var/spool/pbs/mom_priv/config
 ... 省略 ...
# cat /var/spool/pbs/mom_priv/config
  $clienthost pon

# cat /etc/hosts
  192.168.1.1    pon

OpenPBS起動

# /etc/init.d/pbs start
$ /usr/local/bin/qstat     ### test

以下、PBSサーバ pon での作業

• クライアントノード suke を追加
• 導通がちゃんとしてればマシンの情報を自動で取れる

# cat /etc/hosts
  192.168.1.2   suke
# qmgr
Qmgr: create node suke
Qmgr: p n suke
  create node suke
  set node suke state = free
  set node suke resources_available.arch = linux
  set node suke resources_available.host = suke
  set node suke resources_available.mem = 99194464kb
  set node suke resources_available.ncpus = 24
  set node suke resources_available.vnode = suke
  set node suke resv_enable = True
  set node suke sharing = default_shared

• suke が待つべきキューを追加してあげよう

Qmgr: set node suke resources_available.Qlist = SMALL

以上