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Galaxy ToolsのXML Schema について

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Galaxy Toolsの推奨コーディングスタイル

planemoのBest Practices for Creating Galaxy Toolsより

  • インデントには4文字のspaceを利用する
  • XML要素の記述の順序は次の通り
    • description
    • macros
    • requirements
    • [code]
    • stdio
    • version_command
    • command
    • environment_variables
    • configfiles
    • inputs
    • outputs
    • tests
    • help
    • citations
  • Cheetahのコード部分はPEP8に準拠する
  • Large XML tags should be broken into several lines
    • label and help can be on a new line
  • paramの名前は読みやすいものにする
    • ツールの長い名前のオプションを利用するなど
  • Cheetahの変数はダブルコーテーションで囲む
    • 例えば “${var_name}”
  • パラメータのアトリビュートは次の順に記述する
    • name
    • type
    • value | truevalue | falsevalue
    • [checked]
    • label
    • help

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