Galaxy Serverを手元のコンピューターで動作させてみよう
前回はGalaxyの公共サーバーで動作させる方法について触れたので、今回は手元のコンピューターで手軽にGalaxyを動作させる方法について紹介する
一からGalaxyをインストールして手元で動作させる方法に比べて、DockerやVirtual Machineを利用する方がずっと容易なので、ここではDockerを利用する方法に基づいて紹介する
DockerでGalaxyを利用しよう
Dockerを手元のコンピューターにインストール
まずはDockerを手元のコンピューターにインストールする
Docker Inc. で OS X用やWindows用のDockerを入手できる
ユーザー登録してインストールしよう
https://www.docker.com/products/docker-desktop
Dockerそのもののインストール手順については多くの人が書いているので、詳細はその記事を参照して欲しい
Galaxyの環境構築
OS XやLinux上で動作させるなら
@youyuh48 さんの記事バイオインフォマティクス解析環境のGalaxyをMacのDockerで動かしてみるを参照しよう
Windowsで動作させる場合も基本的には同じだがディレクトリの指定方法等が異なるので、Windows 上で Dockerを利用する解説に従って欲しい
Galaxyが動作したら必ずすること
admin のパスワードを変更する
まずはadminのパスワードを変更しよう
Docker imageを最初に起動した際には管理権限を持っているユーザーが
ID: admin@galaxy.org
password: admin
で利用できる
手元のPC以外からアクセスしたユーザーに上記の管理権限を利用されないために、adminユーザーのパスワードを変更しておこう
まずは上記のIDとpasswordでgalaxyにログイン
ログイン後上部メニューの
User => Preferenceをクリックし
表示されるウィンドウの"Change password"をクリックしてパスワードを変更しておく
これでとりあえず手元のコンピューターでGalaxyが動作するようになった
今回はここまで