DESC　とか　ASC　でソートじゃ物足りない時。

テーブル名.フィールド名が[2]の時、4番目
テーブル名.フィールド名が[0]の時、2番目
テーブル名.フィールド名が[3]の時、1番目
その他の時、3番目

のような並び順にしたい。↓

$query->order(function ($exp, $q) {
    return $exp->addCase(
    [
        $q->newExpr()->eq('テーブル名.フィールド名', 2),
        $q->newExpr()->eq('テーブル名.フィールド名', 0),
        $q->newExpr()->eq('テーブル名.フィールド名', 3),
    ],
    [4, 2, 1, 3],
    ['integer', 'integer', 'integer', 'integer']
);

参考・参照
https://stackoverflow.com/questions/47032368/how-to-implement-case-when-under-order-by-using-cakephp-3