やりたいこと

例えば、あるノードの表示・非表示を動的に切り替えるときに、何も考えずに次のように実装したとする。

package sample.javafx;

import javafx.fxml.FXML;
import javafx.fxml.Initializable;
import javafx.scene.control.CheckBox;
import javafx.scene.control.Label;

import java.net.URL;
import java.util.ResourceBundle;

public class MainController implements Initializable {
    @FXML
    private CheckBox checkbox;
    @FXML
    private Label hogeLabel;

    @Override
    public void initialize(URL location, ResourceBundle resources) {
        hogeLabel.visibleProperty().bind(checkbox.selectedProperty());
    }
}

チェックボックスの選択と、 Hoge ラベルの表示を連動させている。

実行結果

Hoge ラベルが非表示になっても、 Fuga ラベルの位置はそのままになっている。
Hoge ラベルは見えなくなっているだけで、その領域を依然として占有した状態になっている。

これを、 Hoge ラベルが消えたら Fuga ラベルが上に詰まるようにしたい。

やり方

package sample.javafx;

import javafx.fxml.FXML;
import javafx.fxml.Initializable;
import javafx.scene.control.CheckBox;
import javafx.scene.control.Label;

import java.net.URL;
import java.util.ResourceBundle;

public class MainController implements Initializable {
    @FXML
    private CheckBox checkbox;
    @FXML
    private Label hogeLabel;

    @Override
    public void initialize(URL location, ResourceBundle resources) {
        hogeLabel.visibleProperty().bind(checkbox.selectedProperty());
        hogeLabel.managedProperty().bind(hogeLabel.visibleProperty());
    }
}

実行結果

説明

hogeLabel.managedProperty().bind(hogeLabel.visibleProperty());

managed プロパティを false にすれば、レイアウトの管理対象から外れ、領域の占有がなくなる。
なので、 managed プロパティと自身の visible プロパティを連動させれば、目的の動作を実現できる。

参考

java - JavaFX - setVisible doesn't "hide" the element - Stack Overflow