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GemのNokogiriを使おうとしたら`version `GLIBC_2.29' not found`エラーが出たときのことを調べた

Last updated at 2022-05-20Posted at 2022-05-20

はじめに

以前、M1 Mac で Rails のセットアップをしているときに、

ERROR: It looks like you're trying to use Nokogiri as a precompiled native gem on a system with glibc < 2.17:

  /lib/aarch64-linux-gnu/libm.so.6: version `GLIBC_2.29' not found (required by /usr/local/bundle/gems/nokogiri-1.13.6-aarch64-linux/lib/nokogiri/2.7/nokogiri.so) - /usr/local/bundle/gems/nokogiri-1.13.6-aarch64-linux/lib/nokogiri/2.7/nokogiri.so

  If that's the case, then please install Nokogiri via the `ruby` platform gem:
      gem install nokogiri --platform=ruby
  or:
      bundle config set force_ruby_platform true

  Please visit https://nokogiri.org/tutorials/installing_nokogiri.html for more help.

のようなエラーが発生しているのを見たので、調べてみた。

僕はM1 Macを持っていないので、ARMアーキテクチャのインスタンスで動かしているUbuntuで試してみた。

解決方法

Nokogiri のインストール時に、--platform=rubyをつけると解決する。

$ gem install nokogiri --platform=ruby

bundler を使っている場合は、

$ bundle config set force_ruby_platform true

を設定すると解決する。

↓ を参照。

何が起こっているのか

Nokogiri の1.11.0からプリコンパイル済みでパッケージが配布されているのが原因そう。

エラーを見ると、

ERROR: It looks like you're trying to use Nokogiri as a precompiled native gem on a system with glibc < 2.17:

と自分の環境とは別の環境でコンパイルされたのが原因であると書いている。

Nokogiri のソースコードを読んでみると、
https://github.com/sparklemotion/nokogiri/blob/main/lib/nokogiri/extension.rb

lib/nokogiri/extension.rb

# load the C or Java extension
begin
  # native precompiled gems package shared libraries in <gem_dir>/lib/nokogiri/<ruby_version>
  ::RUBY_VERSION =~ /(\d+\.\d+)/
  require_relative "#{Regexp.last_match(1)}/nokogiri"
rescue LoadError => e
  if /GLIBC/.match?(e.message)
    warn(<<~EOM)

      ERROR: It looks like you're trying to use Nokogiri as a precompiled native gem on a system
             with an unsupported version of glibc.

      # 略...
    EOM
    raise e
  end

  # 略...
end

lib/nokogiri配下に現在使っている Ruby のバージョンのディレクトリがあり、その中にプリコンパイルされた共有ライブラリがある。

$ pwd
/usr/local/bundle/gems/nokogiri-1.13.6-aarch64-linux/lib/nokogiri/2.7

$ ls -la
total 2376
drwxr-xr-x  2 root root    4096 May 20 00:00 .
drwxr-xr-x 14 root root    4096 May 20 00:00 ..
-rwxrwxr-x  1 root root 2422072 May 20 00:00 nokogiri.so

エラーではglibcが2.17未満でプリコンパイルされたとのことなので、自分の環境のglibcを確認してみると、2.28。

$ pwd
/usr/local/bundle/gems/nokogiri-1.13.6-aarch64-linux/lib/nokogiri/2.7

$ ldd nokogiri.so
./nokogiri.so: /lib/aarch64-linux-gnu/libm.so.6: version `GLIBC_2.29' not found (required by ./nokogiri.so)
	linux-vdso.so.1 (0x0000ffff8fbcd000)
	libm.so.6 => /lib/aarch64-linux-gnu/libm.so.6 (0x0000ffff8f881000)
	libc.so.6 => /lib/aarch64-linux-gnu/libc.so.6 (0x0000ffff8f70f000)
	/lib/ld-linux-aarch64.so.1 (0x0000ffff8fb9f000)

$ /lib/aarch64-linux-gnu/libc.so.6
GNU C Library (Debian GLIBC 2.28-10) stable release version 2.28.
Copyright (C) 2018 Free Software Foundation, Inc.
This is free software; see the source for copying conditions.
There is NO warranty; not even for MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A
PARTICULAR PURPOSE.
Compiled by GNU CC version 8.3.0.
libc ABIs: UNIQUE ABSOLUTE
For bug reporting instructions, please see:
<http://www.debian.org/Bugs/>.

--platform=rubyをつけることで、プリコンパイル済みのパッケージを使わずにネイティブビルドをしてインストールすることができる。

--platform=rubyをつけてインストールしたあとに、見てみるとネイティブビルドされていることが確認できる。

$ pwd
/usr/local/bundle/gems/nokogiri-1.13.6/ext/nokogiri

$ ls nokogiri.so
nokogiri.so

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