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ググったサイトを見ながら、RでSVMをやってみた。眼鏡の人とそれ以外の分類

Last updated at Posted at 2016-06-22

Background

探し物をしていたら、SVMのサイトに行き着いて、ちょうどソースが公開してあったので、試してみた。
眼鏡かけている人と眼鏡かけていない人の分類だった。

Summary

  1. 見つけたサイトを真似してR言語でSVMを使った分類してみた。(e1071)
  2. R言語の画像処理ライブラリ(biOps)が古くなっていてCRANから外れていた。(でも動かせた)
  3. オリジナルのソースの一部に不具合?があった。でも、あれこれやったら直った。
  4. 画像の集め方は、Windows版のフリーソフトが簡単

感想

  • 正解率 74% 画像の選び方など、あまり丁寧にやっていないけど、簡単なプログラムで、これだけできるってすごい。
  • R言語でちゃんとしたスクリプトを動かすのは初めてだったので、いろいろ遠回りして勉強にはなった。
  • 有名なライブラリがCRANから外れている。Rの書籍などでも使われているので、困る初学者が多そう。
  • 画像の収集、以前はGoogleのAPIとかで自由にできたみたいだけど、今はImageSpider(Windows版のフリーソフトが簡単)
  • R、遅い。でもライブラリやドキュメントは豊富。使い道次第。

References...1つだけ読むなら

  1. http://www.slideshare.net/tojimat/tokyor-41?next_slideshow=1

Details

RとRStudioをインストール。

ソースをダウンロード。Reference 2 (Github)からソースをダウンロード。Rのファイル一つだけなので、直接Rstudioに貼り付けた。

環境は以下
R version 3.3.0 (2016-05-03) -- "Supposedly Educational"
Copyright (C) 2016 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-apple-darwin13.4.0 (64-bit)

RStudio
Version 0.99.902 – © 2009-2016 RStudio, Inc.

ライブラリのインストール。

ライブラリが入っていなかったので、インストール。
e1071はCRANからインストールできたが、biOpsはメンテナンスされていないようで、CRANから外されていた。archiveにはtarballがあったので、それをインストール
(結局)Rのバージョンが上がって、古いライブラリが使えなくなったようだ。

画像用ディレクトリ作成

Reference 1に書いてあったが、画像ファイルがないので、そのままでは動かない。画像だけじゃなく、ディレクトリ構造もわからない。ソースを見ながらmkdir
ディレクトリ構造。

.
├── bin
├── data
│   ├── glasses
│   ├── no_glasses
│   ├── sample_glasses
│   └── sample_no_glasses
└── glasses_classifier.R

とにかく動かしてみる(その1)

> library(e1071)
警告メッセージ: 
R graphics engine version 11 is not supported by this version of RStudio. The Plots tab will be disabled until a newer version of RStudio is installed. 

対応方法はわからないので、気にせず、そのまま進む。

とにかく動かしてみる(その2)

‘cross’ must not exceed sampling size!
サンプル数が10以上ないとエラーになるらしい。
http://www.datasciencecentral.com/profiles/blogs/svm-in-practice

画像を集めてきて、先に進む。

ImageSpiderというWindows版フリーソフトがオススメ。
wgetとか、GoogleやBingのAPIとかより簡単。
http://www.vector.co.jp/soft/winnt/net/se425690.html

とにかく動かしてみる(その3)

エラーが出た。

TuneSVM(dataset, kRoughGammaRange, kRoughCostRange)
svm.default(x, y, scale = scale, ..., na.action = na.action) でエラー:
外部関数の呼び出し (引数 10) 中に NA/NaN/Inf があります
追加情報: 50 件以上の警告がありました (最初の 50 個の警告を見るには warnings() を使って下さい)

いろいろ探し回った結果、元のスクリプトの一部に不足があったみたい。
作者さんのところでは動いていたのかもしれないけど、自分の環境では動かなかった。

オリジナル: tunecontrol = tune.control(sampling="cross", nrow(dataset))
修正     : tunecontrol = tune.control(sampling="cross", cross = nrow(dataset))

Githubにライセンス表示がなかったので、問題の箇所だけ。
https://github.com/Salinger/glasses_classifier/blob/master/glasses_classifier.R

結果

パラメータ 正解率(%)
デフォルト 72.9
グリッドサーチ(粗) 74.9
グリッドサーチ(細) 73.6

画像の選び方など、あまり綺麗に統一していないのも一因かな?
簡単なプログラムで、これだけできるってすごい。

References

  1. http://www.slideshare.net/tojimat/tokyor-41?next_slideshow=1
  2. https://github.com/Salinger/glasses_classifier/blob/master/glasses_classifier.R
  3. https://cran.r-project.org/web/packages/e1071/index.html
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