2点の座標と角度の中間を求める

Vector3.Lerp と Quaternion.Lerp が便利

BlendedPosition.cs

using UnityEngine;
using System.Collections;

public class BlendedPosition : MonoBehaviour
{
    [SerializeField] private Transform a;
    [SerializeField] private Transform b;

    void Start ()
    {

    }

    void Update ()
    {
        transform.position = Vector3.Lerp(a.position, b.position, 0.5f);
        transform.rotation = Quaternion.Lerp(a.rotation, b.rotation, 0.5f);
    }
}

追記：2015/11/08

そもそも２点間の中間をもとめるには、補間方法が違う Lerp と Slerp があります。
http://docs.unity3d.com/jp/current/ScriptReference/Vector3.Lerp.html
http://docs.unity3d.com/jp/current/ScriptReference/Vector3.Slerp.html

パフォーマンスと精度に違いあるようですが、試してないので不明です。
http://forum.unity3d.com/threads/what-is-the-difference-of-quaternion-slerp-and-lerp.101179/

補間の違いについては下記コメントの @Ushio@github さんのコードがすごく分かりやすいです。