PyCharmでCythonを試そうとしたらハマったのでメモ

概要

PyCharmでCythonを使おうとして、

1. Basic Tutorial — Cython 0.29a0 documentation
2. PyCharm上でCythonのビルドを簡単にするには – 長久手パラボラ日記

を参考に、setup.pyを設定して実行したら

/Users/username/PycharmProjects/cyyc/venv/bin/python3.6 /Users/username/PycharmProjects/cyyc/setup.py build_ext --inplace
Traceback (most recent call last):
  File "/Users/username/PycharmProjects/cyyc/setup.py", line 8, in <module>
    ext_modules=cythonize("helloworld.pyx")
  File "/Users/username/PycharmProjects/cyyc/venv/lib/python3.6/site-packages/Cython/Build/Dependencies.py", line 897, in cythonize
    aliases=aliases)
  File "/Users/username/PycharmProjects/cyyc/venv/lib/python3.6/site-packages/Cython/Build/Dependencies.py", line 777, in create_extension_list
    for file in nonempty(sorted(extended_iglob(filepattern)), "'%s' doesn't match any files" % filepattern):
  File "/Users/username/PycharmProjects/cyyc/venv/lib/python3.6/site-packages/Cython/Build/Dependencies.py", line 102, in nonempty
    raise ValueError(error_msg)
ValueError: 'helloworld.pyx' doesn't match any files

プロセスは終了コード 1 で完了しました

helloworld.pyxが見つからないと言われた。
("cyyc"はプロジェクト名)

環境

macOS High Sierra 10.13.6
PyCharm Professional 2018.2(Pleiadesで日本語化済)
Python3.6
virtualenv使用

やったこと

絶対パスを指定

.pyxファイルの場所を絶対パスにした。

setup.py

from distutils.core import setup
from Cython.Build import cythonize

setup(
    ext_modules=cythonize("/Users/username/PycharmProjects/cyyc/helloworld.pyx")
)

成功したけど、これでは不便。

作業ディレクトリを変える

外部ツールの設定を見直す。
PyCharm > Preferences > ツール > 外部ツール

作業ディレクトリが初期設定では/venv/binになっているが、ソースファイルのあるディレクトリに変える。
ここでは、とりあえずマクロでプロジェクトディレクトリ$Projectpath$を指定する。
後から気づいたが、参考にしたサイト2でもこのように設定していた。

setup.pyを元に戻した。

setup.py

from distutils.core import setup
from Cython.Build import cythonize

setup(
    ext_modules=cythonize("helloworld.pyx")
)

実行すると、.soファイルが生成された。

気づいたこと

外部ツールの設定で、引数の1つ目をFilePathとマクロで指定しているためか、setup.py以外のファイルを開いた状態で外部ツールの実行をするとそのファイルが引数に入れられて、実行に失敗する。