環境

MacOS mojave(10.14（18A391）)
MacBook Pro (Retina, 13-inch, Mid 2014)
Xcode 9.4.1(作業後アップデートしたので記憶によると)
ruby 2.3.7p456 (2018-03-28 revision 63024) [universal.x86_64-darwin18]

エラー

bundle install --clean --path vendor/bundle で下記のエラーが出る

Installing ruby-ll 2.1.2 with native extensions
Gem::Ext::BuildError: ERROR: Failed to build gem native extension.

    current directory: /Users/natsuki/Desktop/office/Project/vendor/bundle/ruby/2.3.0/gems/ruby-ll-2.1.2/ext/c
/System/Library/Frameworks/Ruby.framework/Versions/2.3/usr/bin/ruby -r ./siteconf20180930-30045-1vxexql.rb extconf.rb
creating Makefile

current directory: /Users/natsuki/Desktop/office/Project/vendor/bundle/ruby/2.3.0/gems/ruby-ll-2.1.2/ext/c
make "DESTDIR=" clean

current directory: /Users/natsuki/Desktop/office/Project/vendor/bundle/ruby/2.3.0/gems/ruby-ll-2.1.2/ext/c
make "DESTDIR="
make: *** No rule to make target
`/Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX10.13.sdk/System/Library/Frameworks/Ruby.framework/Versions/2.3/usr/include/ruby-2.3.0/universal-darwin18/ruby/config.h',
needed by `driver.o'.  Stop.

make failed, exit code 2

Gem files will remain installed in /Users/natsuki/Desktop/office/Project/vendor/bundle/ruby/2.3.0/gems/ruby-ll-2.1.2 for inspection.
Results logged to /Users/natsuki/Desktop/office/Project/vendor/bundle/ruby/2.3.0/extensions/universal-darwin-18/2.3.0/ruby-ll-2.1.2/gem_make.out

An error occurred while installing ruby-ll (2.1.2), and Bundler cannot continue.
Make sure that `gem install ruby-ll -v '2.1.2'` succeeds before bundling.

In Gemfile:
  danger-android_lint was resolved to 0.0.6, which depends on
    oga was resolved to 2.15, which depends on
      ruby-ll

自分の環境での解決法

Xcode 10をインストールして、コマンドラインツールを更新すること

確認した内容

深いところまで追えてないんですが…以前のOSアップデートでも似たようなエラーが出た。
Make sure thatgem install ruby-ll -v '2.1.2'succeeds before bundling. とあるので試してみる

Building native extensions.  This could take a while...
ERROR:  Error installing ruby-ll:
    ERROR: Failed to build gem native extension.

    current directory: /Library/Ruby/Gems/2.3.0/gems/ruby-ll-2.1.2/ext/c
/System/Library/Frameworks/Ruby.framework/Versions/2.3/usr/bin/ruby -r ./siteconf20180930-8289-7w85h9.rb extconf.rb
Ignoring curb-0.9.3 because its extensions are not built.  Try: gem pristine curb --version 0.9.3
creating Makefile

current directory: /Library/Ruby/Gems/2.3.0/gems/ruby-ll-2.1.2/ext/c
make "DESTDIR=" clean

current directory: /Library/Ruby/Gems/2.3.0/gems/ruby-ll-2.1.2/ext/c
make "DESTDIR="
make: *** No rule to make target `/Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX10.13.sdk/System/Library/Frameworks/Ruby.framework/Versions/2.3/usr/include/ruby-2.3.0/universal-darwin18/ruby/config.h', needed by `driver.o'.  Stop.

make failed, exit code 2

Gem files will remain installed in /Library/Ruby/Gems/2.3.0/gems/ruby-ll-2.1.2 for inspection.
Results logged to /Library/Ruby/Gems/2.3.0/extensions/universal-darwin-18/2.3.0/ruby-ll-2.1.2/gem_make.out

こんな感じのエラー出る
curb-0.9.3 ビルドできてないよ、って言われるので以前もこんなの出たな…ってことで入れようとしてみる
sudo gem install curb -v '0.9.3'
rubyのアンインストールとかしないとダメかな…とか思いつつログ読んでた
ログが全部は残ってないんですが下記みたいなやつがあった

Warning: Your Xcode (9.4.1) is outdated.
Please update to Xcode 10.0 (or delete it).
Xcode can be updated from
  https://developer.apple.com/download/more/

If 10.0 is installed, you may need to:
  sudo xcode-select --switch /Applications/Xcode.app
Current developer directory is:
  /Applications/Xcode.app/Contents/Developer

もしくはcommand line toolが古いのでアップデートしてね、みたいなログが出た。
要はOSは最新だけどコマンドラインツールが古いからgemの更新時に不具合が出ているらしい。
brew doctorとかやってもXcode古いってwarningが出るので、Xcodeのせいと判別

解決するためにやったこと

XcodeをAppStoreから10にアップデート(2時間くらいかかる)
Xcode起動→コマンドラインツールをインストールしたら直った

High SierraだかSierraにした時も起こったのでメモしておきます