matlab プログラムは mex プログラムと比べて遅い？
matlabプログラムは、if文や、for文を多用すると、途端に遅くなります。
「mexプログラムに置き換えたら、100倍速くなった！」なんてことは珍しくないです。
では、単純な計算処理についてはどうでしょうか？
mex化＆最適化すると早くなるでしょうか？
matlabも内部的には、mexでの高速化が行われいます。
果たして、それがどのくらいの最適化なのでしょうか。
今回は、その調査をしてみます。
比較は、vector と vector の内積計算速度で行います。
メモリ位置などの考慮をほとんど必要としない単純な処理です。
matlabのみでの計算、mexでの計算、openmp使用、SIMD使用と色々試してみます。
プログラムは以下です。
実験条件は以下です。
・CPU：Intel(R) Core(TM) i7-4700MQ CPU @ 2.40GHz [core数:4、thread数:8]
・OS：Windows10 64bit
・MATLAB：2016a
・mex compiler：Microsoft Windows SDK 7.1 (C++)
・実験条件：vector長64,000,000 の内積演算 y = wTx を、100回実施する時間を測定
実験結果と考察
動かしてみた結果は以下です。
| condition | time (sec) | cpu usage(%) |
|---|---|---|
| matlab | 6.00 | 50% |
| mex | 10.54 | 12% |
| mex + openmp | 6.03 | 100% |
| mex + openmp + SSE | 3.32 | 100% |
| mex + openmp + AVX | 4.03 | 100% |
（※openmpはフルスレッド指定で、CPUメーターでは100%パンパンです）
（※SSE：single×4並列、AVX：single×8並列）
以上。
「頑張れば、matlabを凌げる！」という感じ。
面白いポイントとしては、openmpを使って並列演算を行っただけでは、
matlab単体での演算速度と同程度とまでしか行かないところです。
きっと、matlab単体計算に、SIMDが使われているか、
Intel compilerとか優秀なコンパイラを使ってるんでしょう。
コードの最適化で早くする余地は、もう無い気がします。
また、もう一つ面白いポイントとして、
Microsoft Windows SDK 7.1 (C++) コンパイラによる、
SIMD命令（SSE、AVX）の最適化はちょっと甘そうです。
こちらも、コードに問題は無いと思うのですが、高速化度合いがいまいちです。
これについては、また別途検証を行えれば、と思いますが、
網羅的にやると、CPU複数種類試すとか、Intel Compiler買うとか、お金かかりそう、、、
という訳で、今日は以上となります。
ここまで読んで下さった方、ありがとうございました。orz...