gitについてはだいぶ理解したつもりだったが、初歩的なところに引っ掛かりましたので、備忘録として残しておく。
まず、git statusで中身を確認。
On branch master
No commits yet
Untracked files:
(use "git add <file>..." to include in what will be committed)
.DS_Store
.vagrant/
Vagrantfile
portfolio/
Untracked file を発見。
git add -i で選択し、個別で追加したらgit commit を実行。
これで完了。