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遺伝研スパコンでR（とRstudio）を使う

Last updated at 2019-12-13Posted at 2019-12-13

遺伝研スパコンでRを使うにはmoduleコマンドでR環境をロードします。

$ module load r/3.5.2
$ which Rscript

/opt/pkg/r/3.5.2/bin/Rscript

これでRのスクリプトを投げれば動くはず。
Rstudioを使いたいのだけど、Rstudio serverのインストールにはroot権限が必要なので一般ユーザには無理...
(トライはするので追記予定）

ちなみに
遺伝研スパコンでJupyter notebookを使いたいときはこちら↓
遺伝研スパコンでJupyter Notebookを利用する方法

遺伝研スパコンのデフォルトはPython2.7なので、
Jupyter notebookはminiconda3¹を入れてcondaからインストールしました。

＊2019-12-13 module名が間違っていたので修正しました。