今時のノートPCは高解像度（High DPI)があたりまえとなって久しいわけですが、相変わらずWindows系のソフトは対応がおくれていました。Eclipseなんかもその1つなわけですが、苦節数年ようやくまともにHigh DPI対応されそうな予感です。

以下、4.6M6のリリースノートですが、「SWT provides resolution-based auto-scaling」がサポートされたようです。
http://www.eclipse.org/eclipse/news/4.6/M6/

注意事項として、

以下、スクリーンショット例。奥が4.5 Mars で、手前が4.6 Neonです。