aptとapt-getについて

aptはapt-getを内包しています。

そもそも、apt-getの不便さを解消したのがaptです。
なので基本的にはaptを使用するのが良さそう。
ちなみに、aptとapt-getの混用も問題ありません。
参考：公式ドキュメント

apt update/apt upgrade/apt install

apt update

パッケージリストの更新を行います。

apt upgrade

パッケージの更新を行います。
環境に入っているものを最新化したい時に使用します。

apt install

パッケージリストを使用してインストールします。