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ChatGPTでscipyエラー解決:循環importとlapack問題

Last updated at Posted at 2025-05-12

user:

次のエラーを解決してください

cannot import name 'moduleTNC' from partially initialized module 'scipy.optimize' (most likely due to a circular import) (C:\Users\ikemen\AppData\Roaming\jupyterlab-desktop\envs\env\_1\Lib\site-packages\scipy\optimize\_init.py)

assistant:

このエラー:

cannot import name 'moduleTNC' from partially initialized module 'scipy.optimize' 
(most likely due to a circular import)

は、主に循環インポートまたは同名ファイルの競合によって発生します。以下の対処法を順番に試してください。


✅ 1. ファイル名が scipy.pyoptimize.py になっていないか確認

あなたのコードファイルが scipy.pyoptimize.py という名前になっていると、Python がそれを標準ライブラリの scipy.optimize と誤認してしまいます。

  • 例: optimize.py → ❌
  • 修正例: my_optimizer.py → ✅

また、同じディレクトリに scipy.pyoptimize.py という名前の別ファイルがないかも確認してください。


✅ 2. キャッシュの削除

一度Pythonのキャッシュを削除してみてください。次の手順で行えます:

# 実行中の JupyterLab や Python プロセスを全て終了
# 以下を実行(Anaconda Prompt や Terminal)

find . -type d -name "__pycache__" -exec rm -r {} +

Windowsなら手動で以下を削除してもOKです:

  • あなたのコードフォルダ内の __pycache__
  • Jupyterのキャッシュ:%APPDATA%\jupyterlab-desktop\envs\env_1\Lib\site-packages\scipy\optimize\__pycache__

✅ 3. scipyの再インストール

壊れたインストールが原因の可能性もあるので、再インストールを試します:

pip uninstall scipy -y
pip install scipy

あるいは、Anacondaを使っている場合:

conda uninstall scipy
conda install scipy

✅ 4. インポート部分のコードを確認

使っているインポートが不適切でないかを確認してください。

❌ 悪い例:

from scipy.optimize import moduleTNC  # ← 非公開モジュールを直接インポートしようとしている

✅ 良い例:

scipy.optimize は公開APIとして minimize, fmin_tnc などを提供しています。以下のように書いてください:

from scipy.optimize import fmin_tnc

moduleTNC は内部実装用モジュール(先頭に _ がつく)であり、直接インポートしてはいけません


✳ 補足:代替の関数を使いたい場合

もし TNC メソッドを使いたい場合は minimize を使ってください:

from scipy.optimize import minimize

res = minimize(fun, x0, method='TNC', bounds=bounds)

よろしければ、エラーを出しているインポート部分のコードも貼っていただければ、より具体的にアドバイスできます。コードを確認できますか?

user:

scipy 再インストールしたら解決したかに見えましたが、次のエラーになりました。

No module named 'scipy.linalg.lapack'

assistant:

ありがとうございます。新しいエラー:

No module named 'scipy.linalg.lapack'

は、scipy のインストールが不完全である場合に発生します。特に scipy.linalgscipy.optimize の一部では、内部で Fortranベースの lapack バインディングを利用しており、それが壊れているとこのエラーになります。


✅ 解決策一覧

✅ 1. scipy を完全にクリーン再インストールする

破損したモジュールを完全に削除した後、再インストールします。

(A)pip の場合:

pip uninstall scipy -y
pip cache purge  # pip のキャッシュを削除(pip >= 21.1)
pip install --no-cache-dir scipy

(B)conda の場合(Anaconda/Minicondaを使っているなら推奨):

conda uninstall scipy
conda clean -a  # キャッシュ削除
conda install scipy

できれば conda を使う方が安全です。lapack は C/Fortran バイナリに依存するため、pip より conda が依存解決に強いです。


✅ 2. 仮想環境を作り直す(最も確実)

今の仮想環境が壊れている可能性があるため、新しく環境を作り直すのが確実です。

# 仮想環境作成(venv or conda)
python -m venv new_env
# or
conda create -n new_env python=3.10 scipy

# 仮想環境に入る
# venvの場合(Windows)
.\new_env\Scripts\activate
# condaの場合
conda activate new_env

✅ 3. Lapack モジュールの存在確認

再インストール後、次で lapack が使えるか確認します:

from scipy.linalg import lapack
print(lapack.get_lapack_funcs('gesv'))

これで関数名が表示されれば、問題なくリンクされています。


🔎 もし上記でもうまくいかない場合

  • Pythonのバージョンと scipy のバージョンの組み合わせが合っていない可能性があります。
  • mkl 依存のバージョン(Intel系)と openblas 依存のバージョンで干渉していることも。

ご希望があれば、conda か pip のどちらで環境を整えるべきか、お使いの構成に応じて具体的にサポートできます。現在の Python 環境(conda / venv / pip のどれか)を教えてもらえますか?

user:

ありがとうございます。「scipy を完全にクリーン再インストールする」で解決したようです。今回の会話をブログに書き残したいのですが、タイトル案をいくつか提案していただけませんか?

assistant:

解決してよかったです!ブログ用タイトル案をいくつか目的別に提案しますね。


🔧 技術的なトラブルシューティング重視

  1. 「scipy.optimizeの謎エラーと戦う:ImportErrorとlapack不明エラーを解決するまで」
  2. 「Python環境で発生したScipyの循環インポート&lapackエラーを徹底解決」
  3. 「No module named 'scipy.linalg.lapack':破損したscipyをクリーン再インストールで救う」

🧑‍💻 Jupyterユーザー向け

  1. 「JupyterLabで発生したscipy.optimizeの循環インポート問題とその解決法」
  2. 「仮想環境×Jupyterでのscipyトラブルシューティング実録」

✍️ 読みやすさ・ストーリー性重視

  1. 「Scipyが動かない!? ImportErrorと格闘した1時間の記録」
  2. 「ChatGPTに助けられてscipyエラー解決:循環importとlapack問題に挑む」

🧪 再発防止・環境管理系

  1. 「Scipyが壊れた!? pip/condaでクリーン再インストールするベストプラクティス」
  2. 「Python仮想環境で発生するscipyトラブルとその回避策」

ご希望があれば、本文の構成案もお手伝いできます。タイトルはどの方向性が一番しっくりきそうですか?

user:

「ChatGPTでscipyエラー解決:循環importとlapack問題」で行こうと思います。最後に、今回のまとめを詳しく書いてください。

assistant:

了解しました!
以下に「ChatGPTでscipyエラー解決:循環importとlapack問題」というブログタイトルにふさわしい詳しいまとめを書きました。Jupyter仮想環境やPythonユーザー向けに、再現性のある技術メモとしてご活用ください。


🔧 今回のまとめ:scipy エラーの原因と対処法

Python仮想環境(JupyterLab Desktop内)で scipy.optimize を使おうとした際に、以下の2段階のエラーに遭遇しました。


❶ エラー1:循環インポート(Circular Import)

cannot import name 'moduleTNC' from partially initialized module 'scipy.optimize'

✅ 原因

  • scipy.optimize 内部の非公開モジュール(moduleTNC)を直接インポートしようとしていた
  • または、ファイル名やパスが scipy.pyoptimize.py などと被っており、Pythonが誤って自作ファイルを読み込んでいた
  • scipy インストールが壊れていた

✅ 解決方法

  • ファイル名を optimize.pyscipy.py など標準ライブラリと重ならないように変更
  • __pycache__ を削除してキャッシュをクリア
  • scipy を再インストール(後述)

❷ エラー2:scipy.linalg.lapack が見つからない

No module named 'scipy.linalg.lapack'

✅ 原因

  • scipy の内部コンパイル済みコンポーネント(特に Fortranベースの LAPACK バインディング)が壊れていた
  • 特に pip でインストールした場合、バイナリの依存関係が欠損していることがある

✅ 解決方法:scipy の完全クリーン再インストール

pip uninstall scipy -y
pip cache purge
pip install --no-cache-dir scipy

補足:Anacondaユーザーであれば、以下の方がより安定です:

conda uninstall scipy
conda clean -a
conda install scipy

💡 教訓とおすすめ

  • scipy.optimize の非公開モジュール(例:moduleTNC)を直接インポートしない
    → 使いたいメソッドは from scipy.optimize import fmin_tncminimize を利用
  • ライブラリ名と同名のファイルを作らない(scipy.py, optimize.py など)
  • ライブラリエラーが連鎖する場合は、仮想環境を新しく作り直すのが最も安全
  • pipインストールよりも conda環境の方が scipy, numpy, pandas などC/Fortran系ライブラリは安定

🧑‍💻 最後に

今回のエラーは一見すると単なるインポートミスに見えますが、内部のビルド済みバイナリが壊れていたことが根本原因でした。scipy のように依存関係が複雑なライブラリは、一度壊れると意外な箇所でエラーが出るので、クリーン再インストールと仮想環境の整理が重要です。

私自身、ChatGPTに相談しながら原因を特定し、環境を整え直すことで無事に問題を解決できました。同じようなエラーで悩んでいる方の参考になれば幸いです。


ご希望であれば、上記まとめをMarkdown形式に変換したり、ブログ本文の構成案(見出し・導入・本文・結び)もお手伝いできます!投稿予定の媒体(はてなブログ、Qiita、Zennなど)は決まっていますか?

user:

ありがとうございます。これで大丈夫です。また今後もよろしくお願いします!

assistant:

こちらこそ、いつでもお力になります!無事に解決&記事化のお手伝いができてうれしいです😊
またエラー対応や技術記事の構成・アイデア出しなど、何でもご相談ください。

今後ともよろしくお願いします!
よい開発&執筆ライフを!✍️🚀

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