- 「pydatasetについて ChatOpenAI に意見をもらう 第1部」
- 「pydatasetについて ChatOpenAI に意見をもらう 第2部」
- 「pydatasetについて ChatOpenAI に意見をもらう 第3部」
- 「pydatasetについて ChatOpenAI に意見をもらう 第4部」
- 「pydatasetについて ChatOpenAI に意見をもらう 第5部」
の続編です。PyDatasetには、756種類のデータがあり、全てを把握するのはとても大変です。ひとつひとつ ChatOpenAI に意見をもらいましたので、その結果の一部です。この結果を得るためのコードなどは「pydatasetについて ChatOpenAI に意見をもらう 第1部」 をご参照ください。
PD
A study of Parkinson's disease and APOE, LRRK2, SNCA makers
Data shape: (825, 22)
データの内容:
このデータは、パーキンソン病とAPOE、LRRK2、SNCA遺伝子に関する研究の結果を示しています。データには、遺伝子型や診断結果、性別、年齢などの情報が含まれています。
どのような解析手法が使えそうか:
このデータを分析するためには、以下のような解析手法が使えます。
- 遺伝子型とパーキンソン病の関連性を検討するために、クロス表やカイ二乗検定などの統計手法を使用する。
- パーキンソン病の発症リスクを予測するために、ロジスティック回帰分析やランダムフォレストなどの機械学習手法を使用する。
- パーキンソン病の進行度合いを予測するために、回帰分析や時系列解析などの予測モデルを使用する。
そのために使えるPythonライブラリは何か:
このデータを分析するためには、以下のPythonライブラリが役に立つでしょう。
- pandas: データの読み込みや前処理、統計解析を行うためのライブラリ。
- numpy: 数値計算や配列操作を行うためのライブラリ。
- matplotlib: データの可視化やグラフ作成を行うためのライブラリ。
- scikit-learn: 機械学習モデルの作成や評価を行うためのライブラリ。
- statsmodels: 統計モデルの作成や統計検定を行うためのライブラリ。
これらのライブラリを組み合わせて、データの分析や予測モデルの作成を行うことができます。
先頭10データ:
lab | apoe | rs10506151 | rs10784486 | rs1365763 | rs1388598 | rs1491938 | rs1491941 | m770 | int4 | snca | abc | diag | sex | race | aon | comments | pd | apoe234 | apoe2 | apoe3 | apoe4 | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 002-001 | NaN | 2/2 | 1/2 | 2/2 | 2/2 | 1/2 | 1/2 | NaN | NaN | NaN | Control | NaN | F | NaN | NaN | NaN | 0 | NaN | NaN | NaN | NaN |
2 | 008-015 | NaN | 2/2 | 2/2 | 2/2 | 2/2 | 1/2 | 2/2 | NaN | NaN | NaN | Control | NaN | F | NaN | NaN | NaN | 0 | NaN | NaN | NaN | NaN |
3 | 019-000 | 3/4 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | PD+ | NaN | M | NaN | NaN | NaN | 1 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 1.0 |
4 | 030-001 | 3/4 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | Control | NaN | F | NaN | NaN | NaN | 0 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 1.0 |
5 | 038-000 | 3/3 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | PD- | NaN | M | NaN | NaN | NaN | 1 | 0.0 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
6 | 064-000 | 3/3 | 2/2 | 2/2 | 2/2 | 2/2 | 1/2 | 1/2 | NaN | NaN | NaN | PD- | NaN | M | NaN | 60.0 | NaN | 1 | 0.0 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
7 | 070-011 | NaN | 2/2 | 1/2 | 1/2 | 2/2 | 1/1 | 1/2 | NaN | NaN | NaN | Control | NaN | F | NaN | NaN | NaN | 0 | NaN | NaN | NaN | NaN |
8 | 073-027 | NaN | 1/1 | 2/2 | 2/2 | 2/2 | 2/2 | 1/2 | NaN | NaN | NaN | Control | NaN | F | NaN | NaN | NaN | 0 | NaN | NaN | NaN | NaN |
9 | 099-002 | 2/3 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | Control | NaN | F | NaN | NaN | NaN | 0 | -1.0 | 1.0 | 0.0 | 0.0 |
10 | 125-010 | NaN | 2/2 | 2/2 | 2/2 | 2/2 | 2/2 | 2/2 | NaN | NaN | NaN | Control | NaN | M | NaN | NaN | NaN | 0 | NaN | NaN | NaN | NaN |
aldh2
ALDH2 markers and Alcoholism
Data shape: (263, 18)
データの内容:
- ALDH2遺伝子のマーカーとアルコール依存症の関連性のデータです。
- id: データのID
- y: アルコール依存症の有無(1: 有, 0: 無)
- D12S2070.a1, D12S2070.a2, D12S839.a1, D12S839.a2, D12S821.a1, D12S821.a2, D12S1344.a1, D12S1344.a2, EXON12.a1, EXON12.a2, EXON1.a1, EXON1.a2, D12S2263.a1, D12S2263.a2, D12S1341.a1, D12S1341.a2: ALDH2遺伝子のマーカーに関する値
解析手法の提案:
- ロジスティック回帰や決定木などの分類手法を用いて、ALDH2遺伝子のマーカーとアルコール依存症の関連性を分析することが考えられます。
使用可能なPythonライブラリの提案:
- データの読み込みや前処理には、Pandasライブラリが便利です。
- 分析手法には、scikit-learnライブラリが豊富な機械学習アルゴリズムを提供しています。
- 可視化や統計解析には、MatplotlibやSeaborn、Statsmodelsなどのライブラリが役立つでしょう。
先頭10データ:
id | y | D12S2070.a1 | D12S2070.a2 | D12S839.a1 | D12S839.a2 | D12S821.a1 | D12S821.a2 | D12S1344.a1 | D12S1344.a2 | EXON12.a1 | EXON12.a2 | EXON1.a1 | EXON1.a2 | D12S2263.a1 | D12S2263.a2 | D12S1341.a1 | D12S1341.a2 | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 2 | 1 | 4 | 4 | 3 | 4 | 3 | 7 | 8 | 10 | 2 | 2 | 2 | 2 | 6 | 8 | 5 | 8 |
2 | 4 | 1 | 4 | 4 | 4 | 5 | 5 | 6 | 3 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 8 | 9 | 3 | 5 |
3 | 6 | 1 | 4 | 4 | 3 | 5 | 3 | 5 | 3 | 8 | 2 | 2 | 2 | 2 | 7 | 10 | 8 | 8 |
4 | 12 | 1 | 4 | 4 | 4 | 5 | 3 | 4 | 8 | 8 | 2 | 2 | 0 | 0 | 6 | 7 | 5 | 7 |
5 | 13 | 1 | 4 | 4 | 5 | 5 | 5 | 6 | 3 | 3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 9 | 9 | 6 | 6 |
6 | 14 | 1 | 1 | 5 | 5 | 5 | 3 | 5 | 10 | 10 | 2 | 2 | 2 | 2 | 6 | 8 | 4 | 5 |
7 | 15 | 1 | 2 | 5 | 4 | 5 | 3 | 3 | 8 | 8 | 2 | 2 | 2 | 2 | 7 | 8 | 7 | 8 |
8 | 16 | 1 | 2 | 2 | 5 | 5 | 3 | 3 | 3 | 8 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 8 | 3 | 8 |
9 | 17 | 1 | 2 | 2 | 4 | 4 | 3 | 5 | 3 | 8 | 2 | 2 | 2 | 2 | 8 | 8 | 4 | 5 |
10 | 19 | 1 | 2 | 5 | 3 | 4 | 6 | 8 | 2 | 3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 7 | 10 | 1 | 3 |
apoeapoc
APOE/APOC1 markers and Alzheimer's
Data shape: (353, 8)
提案:
このデータはAPOE/APOC1マーカーとアルツハイマー病の関係についてのデータです。データセットには以下の変数が含まれています:id(ID番号)、y(アルツハイマー病の有無)、sex(性別)、age(年齢)、apoe.a1(APOE遺伝子のA1アリル)、apoe.a2(APOE遺伝子のA2アリル)、apoc.a1(APOC1遺伝子のA1アリル)、apoc.a2(APOC1遺伝子のA2アリル)。
このデータを解析するためには、以下のような手法やライブラリが使えそうです:
- ロジスティック回帰分析:アルツハイマー病の有無(y)を予測するために、性別(sex)、年齢(age)、APOE遺伝子のA1アリル(apoe.a1)、APOE遺伝子のA2アリル(apoe.a2)、APOC1遺伝子のA1アリル(apoc.a1)、APOC1遺伝子のA2アリル(apoc.a2)との関係を調べることができます。
使用できるPythonライブラリ:
- scikit-learn:ロジスティック回帰モデルを構築し、予測を行うために使用できます。
- pandas:データセットを読み込んで扱いやすい形式に変換するために使用できます。
- matplotlibやseaborn:可視化のために使用できます。
また、データの前処理や特徴量エンジニアリング、モデルの評価なども必要になるかもしれません。
先頭10データ:
id | y | sex | age | apoe.a1 | apoe.a2 | apoc.a1 | apoc.a2 | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 1 | 2 | 2 | 67 | 3 | 3 | 1 | 1 |
2 | 2 | 2 | 1 | 64 | 3 | 3 | 1 | 1 |
3 | 3 | 2 | 2 | 71 | 3 | 3 | 1 | 2 |
4 | 4 | 2 | 1 | 80 | 3 | 3 | 1 | 1 |
5 | 5 | 2 | 2 | 79 | 3 | 3 | 1 | 1 |
6 | 6 | 2 | 2 | 80 | 3 | 3 | 1 | 1 |
7 | 7 | 2 | 2 | 65 | 3 | 3 | 1 | 1 |
8 | 8 | 2 | 2 | 61 | 3 | 3 | 1 | 1 |
9 | 9 | 2 | 2 | 71 | 3 | 3 | 1 | 1 |
10 | 10 | 2 | 2 | 66 | 3 | 3 | 1 | 2 |
cf
Cystic fibrosis data
Data shape: (186, 24)
データの内容:
- データセットID: cf
- タイトル: Cystic fibrosis data
- データ: yとloc1〜loc23のデータが含まれている。yは目的変数で、loc1〜loc23は説明変数である。
解析手法の提案:
このデータセットは、Cystic fibrosis(嚢胞性線維症)という疾患に関連するデータであると推測される。嚢胞性線維症は遺伝性の疾患であり、各loc(遺伝子の位置)における遺伝子の変異が関与している可能性がある。よって、以下のような解析手法が使えそうである。
-
遺伝子変異の有無に基づく分類: yを目的変数として、loc1〜loc23を説明変数とした分類モデルを構築することができる。これにより、遺伝子の変異の有無に基づいて嚢胞性線維症の発症リスクを予測することができる。
-
遺伝子変異の関連性の解明: loc1〜loc23の各変数間の相関を調査し、嚢胞性線維症と関連する遺伝子の特定を試みることができる。
Pythonライブラリの提案:
-
機械学習モデル構築には、Scikit-learnライブラリを使用することができる。分類モデル(例えば、ランダムフォレストやロジスティック回帰)の構築やモデル評価に便利な機能が提供されている。
-
相関分析には、PandasライブラリとSeabornライブラリを使用することができる。Pandasはデータの操作や統計処理に便利であり、Seabornは美しいグラフィカルな可視化を提供している。これらのライブラリを組み合わせることで、変数間の相関を可視化したり解析したりすることができる。
以上の手法とライブラリを使用することで、嚢胞性線維症のデータ解析を行うことができる。
先頭10データ:
y | loc1 | loc2 | loc3 | loc4 | loc5 | loc6 | loc7 | loc8 | loc9 | loc10 | loc11 | loc12 | loc13 | loc14 | loc15 | loc16 | loc17 | loc18 | loc19 | loc20 | loc21 | loc22 | loc23 | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
2 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
3 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
4 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
5 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
6 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
7 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
8 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
9 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
10 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
crohn
Crohn's disease data
Data shape: (387, 212)
提案:
データの内容:
Crohn's disease(クローン病)に関するデータ。
解析手法:
Crohn's diseaseの発症リスクを予測するために、ロジスティック回帰分析やランダムフォレストなどの分類アルゴリズムを使用することができます。
Pythonライブラリ:
・データフレーム操作・可視化:Pandas, Matplotlib, Seaborn
・データ分析・機械学習:Scikit-learn
・統計解析:Statsmodels
・ランダムフォレスト:Scikit-learnのRandomForestClassifier
・ロジスティック回帰分析:Scikit-learnのLogisticRegression
先頭10データ:
pid | id | fid | mid | sex | crohn | loc1.a1 | loc1.a2 | loc2.a1 | loc2.a2 | loc3.a1 | loc3.a2 | loc4.a1 | loc4.a2 | loc5.a1 | loc5.a2 | loc6.a1 | loc6.a2 | loc7.a1 | loc7.a2 | loc8.a1 | loc8.a2 | loc9.a1 | loc9.a2 | loc10.a1 | loc10.a2 | loc11.a1 | loc11.a2 | loc12.a1 | loc12.a2 | loc13.a1 | loc13.a2 | loc14.a1 | loc14.a2 | loc15.a1 | loc15.a2 | loc16.a1 | loc16.a2 | loc17.a1 | loc17.a2 | loc18.a1 | loc18.a2 | loc19.a1 | loc19.a2 | loc20.a1 | loc20.a2 | loc21.a1 | loc21.a2 | loc22.a1 | loc22.a2 | loc23.a1 | loc23.a2 | loc24.a1 | loc24.a2 | loc25.a1 | loc25.a2 | loc26.a1 | loc26.a2 | loc27.a1 | loc27.a2 | loc28.a1 | loc28.a2 | loc29.a1 | loc29.a2 | loc30.a1 | loc30.a2 | loc31.a1 | loc31.a2 | loc32.a1 | loc32.a2 | loc33.a1 | loc33.a2 | loc34.a1 | loc34.a2 | loc35.a1 | loc35.a2 | loc36.a1 | loc36.a2 | loc37.a1 | loc37.a2 | loc38.a1 | loc38.a2 | loc39.a1 | loc39.a2 | loc40.a1 | loc40.a2 | loc41.a1 | loc41.a2 | loc42.a1 | loc42.a2 | loc43.a1 | loc43.a2 | loc44.a1 | loc44.a2 | loc45.a1 | loc45.a2 | loc46.a1 | loc46.a2 | loc47.a1 | loc47.a2 | loc48.a1 | loc48.a2 | loc49.a1 | loc49.a2 | loc50.a1 | loc50.a2 | loc51.a1 | loc51.a2 | loc52.a1 | loc52.a2 | loc53.a1 | loc53.a2 | loc54.a1 | loc54.a2 | loc55.a1 | loc55.a2 | loc56.a1 | loc56.a2 | loc57.a1 | loc57.a2 | loc58.a1 | loc58.a2 | loc59.a1 | loc59.a2 | loc60.a1 | loc60.a2 | loc61.a1 | loc61.a2 | loc62.a1 | loc62.a2 | loc63.a1 | loc63.a2 | loc64.a1 | loc64.a2 | loc65.a1 | loc65.a2 | loc66.a1 | loc66.a2 | loc67.a1 | loc67.a2 | loc68.a1 | loc68.a2 | loc69.a1 | loc69.a2 | loc70.a1 | loc70.a2 | loc71.a1 | loc71.a2 | loc72.a1 | loc72.a2 | loc73.a1 | loc73.a2 | loc74.a1 | loc74.a2 | loc75.a1 | loc75.a2 | loc76.a1 | loc76.a2 | loc77.a1 | loc77.a2 | loc78.a1 | loc78.a2 | loc79.a1 | loc79.a2 | loc80.a1 | loc80.a2 | loc81.a1 | loc81.a2 | loc82.a1 | loc82.a2 | loc83.a1 | loc83.a2 | loc84.a1 | loc84.a2 | loc85.a1 | loc85.a2 | loc86.a1 | loc86.a2 | loc87.a1 | loc87.a2 | loc88.a1 | loc88.a2 | loc89.a1 | loc89.a2 | loc90.a1 | loc90.a2 | loc91.a1 | loc91.a2 | loc92.a1 | loc92.a2 | loc93.a1 | loc93.a2 | loc94.a1 | loc94.a2 | loc95.a1 | loc95.a2 | loc96.a1 | loc96.a2 | loc97.a1 | loc97.a2 | loc98.a1 | loc98.a2 | loc99.a1 | loc99.a2 | loc100.a1 | loc100.a2 | loc101.a1 | loc101.a2 | loc102.a1 | loc102.a2 | loc103.a1 | loc103.a2 | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | PED054 | 430 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 | 3 | 3 | 1 | 4 | 1 | 4 | 2 | 2 | 1 | 3 | 1 | 2 | 4 | 3 | 2 | 3 | 3 | 4 | 2 | 4 | 2 | 2 | 1 | 2 | 1 | 3 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 2 | 1 | 1 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 4 | 3 | 3 | 2 | 3 | 2 | 4 | 2 | 2 | 1 | 4 | 2 | 3 | 1 | 3 | 1 | 2 | 1 | 4 | 2 | 3 | 2 | 2 | 2 | 3 | 1 | 3 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | 4 | 2 | 3 | 3 | 1 | 1 | 4 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 0 | 0 | 3 | 1 | 4 | 2 | 4 | 2 | 4 | 2 | 1 | 1 | 4 | 2 | 3 | 2 | 3 | 1 | 4 | 4 | 3 | 3 | 3 | 2 | 4 | 1 | 3 | 2 | 4 | 3 | 3 | 1 | 3 | 1 | 4 | 2 | 3 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 1 | 1 | 2 | 4 | 4 | 1 | 4 | 3 | 4 | 2 | 1 | 1 | 2 | 2 | 4 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 1 | 3 | 3 | 1 | 2 | 2 | 1 | 3 | 2 | 2 | 3 | 1 | 3 | 1 | 4 | 2 | 0 | 0 | 4 | 3 | 4 | 3 | 4 | 4 | 3 | 2 | 4 | 2 | 3 | 3 | 3 | 1 | 4 | 2 | 3 | 1 | 3 | 4 | 2 | 1 | 3 | 3 |
2 | PED054 | 412 | 430 | 431 | 2 | 2 | 1 | 3 | 1 | 3 | 4 | 1 | 4 | 2 | 2 | 1 | 3 | 1 | 4 | 2 | 3 | 2 | 3 | 3 | 2 | 4 | 2 | 4 | 2 | 1 | 1 | 2 | 1 | 3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 0 | 0 | 1 | 1 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 4 | 3 | 3 | 2 | 2 | 3 | 4 | 2 | 1 | 2 | 4 | 2 | 1 | 3 | 1 | 3 | 2 | 1 | 2 | 4 | 3 | 2 | 2 | 2 | 3 | 1 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | 4 | 4 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 4 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 1 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 2 | 4 | 1 | 1 | 4 | 2 | 2 | 3 | 1 | 3 | 4 | 4 | 3 | 3 | 3 | 2 | 4 | 1 | 2 | 3 | 3 | 4 | 1 | 3 | 1 | 3 | 4 | 2 | 3 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 1 | 1 | 2 | 4 | 1 | 4 | 3 | 4 | 4 | 2 | 1 | 1 | 2 | 2 | 4 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 1 | 1 | 3 | 0 | 0 | 3 | 1 | 2 | 2 | 1 | 3 | 3 | 1 | 4 | 2 | 0 | 0 | 4 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 3 | 2 | 2 | 4 | 3 | 3 | 3 | 1 | 2 | 4 | 3 | 1 | 3 | 4 | 2 | 1 | 3 | 3 |
3 | PED054 | 431 | 0 | 0 | 2 | 0 | 3 | 3 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 0 | 0 | 2 | 2 | 3 | 3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 1 | 1 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 2 | 2 | 3 | 3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 1 | 1 | 4 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 1 | 1 | 3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 2 | 3 | 3 | 1 | 1 | 4 | 4 | 2 | 2 | 0 | 0 | 2 | 2 | 4 | 4 | 3 | 3 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 3 | 3 | 2 | 2 | 1 | 1 | 3 | 3 | 4 | 4 | 3 | 3 | 3 | 3 | 2 | 2 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 1 | 1 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 2 | 2 | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 1 | 1 | 3 | 3 | 2 | 2 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 1 | 1 | 1 | 2 | 2 | 0 | 0 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 3 | 3 | 1 | 1 | 4 | 4 | 1 | 1 | 4 | 4 | 1 | 1 | 3 | 3 |
4 | PED058 | 438 | 0 | 0 | 1 | 0 | 3 | 3 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 2 | 4 | 2 | 2 | 1 | 2 | 1 | 3 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 2 | 1 | 1 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 4 | 3 | 3 | 2 | 3 | 2 | 4 | 2 | 2 | 1 | 4 | 2 | 3 | 1 | 3 | 1 | 2 | 1 | 4 | 2 | 3 | 2 | 2 | 2 | 3 | 1 | 3 | 2 | 0 | 0 | 1 | 1 | 4 | 2 | 3 | 1 | 2 | 1 | 4 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 4 | 3 | 3 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 3 | 3 | 2 | 2 | 1 | 1 | 3 | 3 | 4 | 4 | 3 | 3 | 3 | 3 | 2 | 2 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 1 | 1 | 4 | 4 | 4 | 1 | 4 | 3 | 2 | 2 | 1 | 1 | 2 | 2 | 4 | 2 | 3 | 1 | 4 | 1 | 4 | 4 | 0 | 0 | 1 | 3 | 3 | 3 | 2 | 2 | 1 | 3 | 4 | 2 | 3 | 1 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 1 | 4 | 4 | 3 | 3 | 4 | 4 | 3 | 3 | 4 | 2 | 3 | 1 | 3 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 2 | 2 | 3 | 3 |
5 | PED058 | 470 | 438 | 444 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 2 | 4 | 2 | 4 | 2 | 1 | 1 | 2 | 1 | 3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 2 | 3 | 1 | 1 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 4 | 2 | 3 | 2 | 3 | 4 | 2 | 1 | 2 | 4 | 2 | 1 | 3 | 1 | 3 | 1 | 2 | 2 | 4 | 3 | 2 | 2 | 2 | 3 | 1 | 2 | 3 | 2 | 2 | 1 | 1 | 2 | 4 | 1 | 3 | 1 | 2 | 4 | 4 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 4 | 2 | 3 | 3 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 3 | 3 | 2 | 2 | 1 | 1 | 3 | 3 | 4 | 4 | 3 | 3 | 3 | 3 | 2 | 2 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 1 | 1 | 4 | 4 | 1 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 1 | 1 | 2 | 3 | 2 | 4 | 1 | 3 | 1 | 4 | 4 | 4 | 0 | 0 | 3 | 1 | 3 | 3 | 2 | 2 | 3 | 1 | 4 | 2 | 1 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 0 | 0 | 4 | 4 | 3 | 3 | 4 | 2 | 3 | 3 | 2 | 4 | 3 | 1 | 3 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 2 | 2 | 3 | 3 |
6 | PED058 | 444 | 0 | 0 | 2 | 0 | 3 | 3 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 0 | 0 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 2 | 0 | 0 | 3 | 1 | 3 | 2 | 1 | 4 | 3 | 3 | 1 | 3 | 4 | 2 | 3 | 2 | 3 | 1 | 2 | 2 | 4 | 3 | 3 | 2 | 3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 2 | 1 | 4 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 1 | 1 | 3 | 2 | 2 | 2 | 1 | 1 | 4 | 2 | 3 | 1 | 2 | 1 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 2 | 3 | 3 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 3 | 3 | 2 | 2 | 1 | 1 | 3 | 3 | 4 | 4 | 3 | 3 | 3 | 3 | 2 | 2 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 1 | 1 | 4 | 4 | 4 | 1 | 4 | 3 | 2 | 2 | 1 | 1 | 3 | 3 | 4 | 2 | 3 | 3 | 4 | 1 | 4 | 4 | 0 | 0 | 1 | 1 | 3 | 3 | 2 | 2 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 1 | 3 | 1 | 4 | 2 | 0 | 0 | 4 | 4 | 3 | 3 | 4 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 2 | 2 | 3 | 3 |
7 | PED069 | 543 | 0 | 0 | 1 | 0 | 3 | 3 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 0 | 0 | 2 | 2 | 3 | 3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 1 | 1 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 2 | 2 | 3 | 3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 1 | 1 | 4 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 1 | 1 | 3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 2 | 3 | 3 | 1 | 1 | 4 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 4 | 3 | 3 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 3 | 3 | 2 | 2 | 1 | 1 | 0 | 0 | 4 | 4 | 3 | 3 | 3 | 3 | 2 | 2 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 1 | 1 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 3 | 2 | 2 | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 1 | 3 | 3 | 3 | 0 | 0 | 1 | 3 | 2 | 2 | 3 | 1 | 3 | 1 | 4 | 2 | 1 | 1 | 4 | 3 | 4 | 3 | 4 | 4 | 3 | 2 | 4 | 4 | 3 | 1 | 1 | 1 | 4 | 4 | 3 | 1 | 3 | 4 | 2 | 1 | 3 | 3 |
8 | PED069 | 516 | 543 | 513 | 1 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 0 | 0 | 4 | 4 | 4 | 4 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 2 | 4 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 2 | 1 | 1 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 4 | 2 | 3 | 3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 1 | 2 | 4 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 4 | 3 | 3 | 1 | 1 | 4 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 2 | 3 | 1 | 2 | 4 | 4 | 2 | 4 | 2 | 1 | 1 | 2 | 4 | 3 | 2 | 3 | 1 | 4 | 4 | 3 | 3 | 2 | 3 | 1 | 4 | 0 | 0 | 4 | 3 | 3 | 1 | 3 | 1 | 2 | 4 | 1 | 3 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 1 | 1 | 4 | 2 | 4 | 1 | 3 | 4 | 2 | 4 | 1 | 1 | 2 | 3 | 2 | 4 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 1 | 3 | 1 | 2 | 2 | 3 | 1 | 2 | 2 | 1 | 3 | 1 | 3 | 0 | 0 | 1 | 1 | 3 | 4 | 3 | 4 | 4 | 4 | 2 | 3 | 4 | 4 | 3 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 | 3 | 4 | 3 | 1 | 2 | 3 | 3 |
9 | PED069 | 513 | 0 | 0 | 2 | 0 | 3 | 3 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 0 | 0 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 2 | 1 | 1 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 4 | 3 | 3 | 2 | 3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 2 | 1 | 4 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 1 | 1 | 3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 2 | 3 | 3 | 1 | 1 | 4 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 2 | 3 | 1 | 4 | 2 | 4 | 2 | 4 | 2 | 1 | 1 | 4 | 2 | 3 | 2 | 3 | 1 | 4 | 4 | 3 | 3 | 3 | 2 | 4 | 1 | 3 | 2 | 4 | 3 | 3 | 1 | 3 | 1 | 4 | 2 | 3 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 1 | 1 | 2 | 4 | 4 | 1 | 4 | 3 | 4 | 2 | 1 | 1 | 3 | 2 | 4 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 1 | 3 | 3 | 1 | 2 | 2 | 1 | 3 | 2 | 2 | 3 | 1 | 3 | 1 | 4 | 2 | 3 | 1 | 4 | 3 | 4 | 3 | 4 | 4 | 3 | 2 | 4 | 4 | 0 | 0 | 1 | 1 | 4 | 2 | 3 | 1 | 3 | 4 | 2 | 1 | 3 | 3 |
10 | PED076 | 573 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 3 | 1 | 4 | 1 | 4 | 2 | 2 | 1 | 3 | 1 | 2 | 4 | 3 | 2 | 0 | 0 | 4 | 2 | 4 | 2 | 2 | 1 | 2 | 1 | 3 | 1 | 4 | 2 | 3 | 2 | 3 | 1 | 2 | 2 | 1 | 4 | 3 | 3 | 1 | 3 | 4 | 2 | 3 | 2 | 3 | 1 | 0 | 0 | 4 | 4 | 3 | 3 | 0 | 0 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 2 | 2 | 4 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 0 | 0 | 3 | 3 | 0 | 0 | 2 | 2 | 4 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 1 | 1 | 4 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 1 | 1 | 4 | 4 | 2 | 2 | 1 | 1 | 4 | 4 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 2 | 2 | 3 | 3 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4 | 4 | 3 | 3 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 3 | 1 | 2 | 2 | 1 | 1 | 4 | 4 | 4 | 4 | 1 | 1 | 3 | 3 | 4 | 4 | 3 | 3 | 4 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 0 | 0 | 4 | 4 | 3 | 3 | 4 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4 | 2 | 3 | 1 | 3 | 4 | 2 | 1 | 3 | 3 |
fa
Friedreich Ataxia data
Data shape: (127, 13)
データの内容:
このデータセットは、フリードライヒ運動失調症(Friedreich Ataxia)に関するデータです。患者の遺伝子座(loci1〜loci12)とそれに対応する特定の遺伝子の値が含まれています。
解析手法:
このデータセットでは、患者の遺伝子座とフリードライヒ運動失調症の関連性を調べることができます。具体的な解析手法としては、以下の手法が考えられます。
- 相関分析:遺伝子座間の相関関係を調べることで、フリードライヒ運動失調症と関連する遺伝子を特定することができます。
- 分類モデル:患者の遺伝子座の値から、フリードライヒ運動失調症の有無を予測するモデルを構築することができます。
Pythonライブラリ:
上記の解析手法を実現するためには、以下のPythonライブラリが利用できます。
- pandas:データセットを読み込み、データの整理と前処理を行うために使用します。
- numpy:数値計算を行うために使用します。
- seaborn:相関分析の結果を可視化するために使用します。
- scikit-learn:分類モデルの構築や評価を行うために使用します。
以上の手法とライブラリを使用して、フリードライヒ運動失調症に関する遺伝子データの解析を行うことができます。
先頭10データ:
y | loci1 | loci2 | loci3 | loci4 | loci5 | loci6 | loci7 | loci8 | loci9 | loci10 | loci11 | loci12 | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 1 | 2 | 7 | 8 | 2 | 5 | 9 | 2 | 2 | 2 | 2 | 6 | 3 |
2 | 1 | 3 | 7 | 8 | 2 | 5 | 9 | 2 | 2 | 2 | 2 | 6 | 3 |
3 | 1 | 3 | 1 | 8 | 2 | 5 | 9 | 2 | 2 | 2 | 2 | 14 | 5 |
4 | 1 | 2 | 5 | 7 | 2 | 5 | 9 | 2 | 2 | 2 | 2 | 14 | 3 |
5 | 1 | 14 | 7 | 8 | 5 | 6 | 2 | 3 | 2 | 2 | 2 | 14 | 9 |
6 | 1 | 8 | 4 | 7 | 7 | 3 | 2 | 3 | 4 | 2 | 2 | 14 | 9 |
7 | 1 | 8 | 4 | 8 | 2 | 5 | 9 | 2 | 1 | 3 | 1 | 14 | 11 |
8 | 1 | 8 | 4 | 8 | 2 | 5 | 9 | 2 | 1 | 3 | 1 | 14 | 11 |
9 | 1 | 3 | 2 | 8 | 2 | 5 | 9 | 2 | 2 | 2 | 2 | 6 | 3 |
10 | 1 | 8 | 4 | 8 | 2 | 5 | 9 | 2 | 2 | 2 | 2 | 10 | 6 |
fsnps
A case-control data involving four SNPs with missing genotype
Data shape: (432, 10)
データの内容:
- サイト1、サイト2、サイト3、サイト4の4つのSNPに関するケースコントロールデータ
- id: データのID
- y: ケース(1)かコントロール(2)かを示すターゲット変数
- site1.a1, site1.a2, site2.a1, site2.a2, site3.a1, site3.a2, site4.a1, site4.a2: 各SNPの遺伝子型
解析手法の提案:
- このデータはケースコントロールデータであり、SNPの遺伝子型とyの関連性を調べることが目的となります。遺伝子型の組み合わせとケース・コントロールの関係を統計的に解析することが求められます。具体的な解析手法としては、ロジスティック回帰分析やカイ二乗検定などが考えられます。
使えるPythonライブラリの提案:
- データの前処理や統計解析には、PandasやNumPyが便利です。これらのライブラリを使ってデータを読み込み、整形することができます。
- ロジスティック回帰分析には、Scikit-learnのLogisticRegressionモジュールを使うことができます。これを使うと、ケース・コントロールの関連性を統計的に評価することができます。
- カイ二乗検定には、SciPyのchi2_contingency関数を使うことができます。これを使えば、遺伝子型とケース・コントロールの関連性をカイ二乗検定で検証することができます。
先頭10データ:
id | y | site1.a1 | site1.a2 | site2.a1 | site2.a2 | site3.a1 | site3.a2 | site4.a1 | site4.a2 | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 1 | 1 | A | C | C | T | T | T | A | G |
2 | 2 | 2 | C | C | T | T | T | T | G | G |
3 | 3 | 1 | A | C | Z | Z | G | T | A | G |
4 | 4 | 1 | A | A | C | C | G | G | A | A |
5 | 5 | 1 | A | A | C | C | T | T | A | G |
6 | 6 | 1 | A | A | C | C | Z | Z | A | A |
7 | 7 | 1 | A | A | C | C | G | T | A | A |
8 | 8 | 1 | A | C | C | C | G | G | A | A |
9 | 9 | 1 | A | A | C | T | T | T | A | G |
10 | 10 | 2 | C | C | T | T | T | T | G | G |
hla
The HLA data
Data shape: (271, 8)
データの内容:
- id: データの識別子
- y: ターゲット変数
- DQR.a1, DQR.a2: 特徴量1の値
- DQA.a1, DQA.a2: 特徴量2の値
- DQB.a1, DQB.a2: 特徴量3の値
解析手法の提案:
このデータは、識別子やターゲット変数、および特徴量の値から成るデータセットです。解析手法としては、識別子やターゲット変数との関連性を調べるための分析や、特徴量同士の関係性を把握するための分析が考えられます。
具体的な解析手法としては、以下のようなものがあります:
- 識別子やターゲット変数との関連性を調べるための分析方法として、クロス集計やグループ別の統計量の比較などがあります。これにより、識別子やターゲット変数と特徴量との関連性を把握することができます。
- 特徴量同士の関係性を把握するための分析方法として、相関行列の作成や散布図行列の可視化などがあります。これにより、特徴量同士の相関やパターンを確認することができます。
Pythonライブラリの提案:
上記の解析手法を実施するためには、Pythonのデータ分析や可視化に利用されるライブラリが有用です。以下にいくつかのライブラリを提案します:
- pandas: データの読み込みや整形、集計などの機能を提供します。
- numpy: 数値計算や行列操作などの機能を提供します。
- matplotlib: グラフやプロットの作成などの機能を提供します。
- seaborn: データの可視化や相関行列の作成などの機能を提供します。
これらのライブラリを使ってデータの読み込みや前処理、解析手法の実施、結果の可視化などを行うことで、データの特徴や関係性を把握することができます。
先頭10データ:
id | y | DQR.a1 | DQR.a2 | DQA.a1 | DQA.a2 | DQB.a1 | DQB.a2 | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | CTR | 0 | 4 | 9 | 4 | 8 | 1 | 1 |
2 | CTR | 0 | 4 | 7 | 5 | 8 | 1 | 3 |
3 | CTR | 0 | 22 | 21 | 1 | 2 | 12 | 9 |
4 | CTR | 0 | 6 | 6 | 5 | 5 | 2 | 3 |
5 | CTR | 0 | 9 | 21 | 1 | 4 | 1 | 9 |
6 | CTR | 0 | 22 | 17 | 2 | 3 | 12 | 13 |
7 | CTR | 0 | 6 | 9 | 4 | 5 | 1 | 2 |
8 | CTR | 0 | 6 | 14 | 5 | 8 | 2 | 3 |
9 | CTR | 0 | 8 | 8 | 5 | 5 | 2 | 3 |
10 | CTR | 0 | 1 | 18 | 1 | 2 | 7 | 14 |
hr1420
An example data for Manhattan plot with annotation
Data shape: (147849, 5)
/home/kotera/.local/lib/python3.10/site-packages/pydataset/datasets_handler.py:48: DtypeWarning: Columns (1) have mixed types. Specify dtype option on import or set low_memory=False.
df = pd.read_csv(path, index_col=0)
データの内容:
- ゲノムの位置(CHR、POS)と関連する遺伝子(gene)との関係性を示すデータ
- 各遺伝子に対しての統計的な有意性(P)が与えられている
解析手法:
- マンハッタンプロットを使用して遺伝子の関連性を可視化することができる
- マンハッタンプロットは、染色体上の位置(X軸)と統計的有意性(-log10(P))を表す点(Y軸)をプロットする手法であり、遺伝子の関連性を探索するためによく用いられる
Pythonライブラリの提案:
- matplotlibやseabornなどのデータ可視化ライブラリを使用してマンハッタンプロットを作成することができる
- pandasなどのデータ操作ライブラリを使用してデータの前処理や整形を行うことができる
- numpyなどの数値計算ライブラリを使用してデータの統計的な処理を行うことができる
先頭10データ:
gene | P | CHR | POS | colour | |
---|---|---|---|---|---|
2020311 | NaN | 0.76980 | 14 | 18416362 | NaN |
2020312 | NaN | 0.96790 | 14 | 18689850 | NaN |
2020313 | NaN | 0.72020 | 14 | 18859146 | NaN |
2020314 | NaN | 0.99580 | 14 | 18859574 | NaN |
2020315 | NaN | 0.06893 | 14 | 19160961 | NaN |
2020316 | NaN | 0.81890 | 14 | 19218338 | NaN |
2020317 | NaN | 0.88860 | 14 | 19264716 | NaN |
2020318 | NaN | 0.51680 | 14 | 19266920 | NaN |
2020319 | NaN | 0.40220 | 14 | 19269283 | NaN |
2020320 | NaN | 0.13350 | 14 | 19272965 | NaN |
l51
An example pedigree data
Data shape: (51, 6)
提案:
このデータセットは、家族の系譜データのようです。以下に提案する解析手法とPythonライブラリをご紹介します。
- データの内容:
- id: 個体のID
- fid: 父親のID
- mid: 母親のID
- sex: 性別 (1: 男性, 2: 女性)
- aff: 影響を受けているかどうか (1: 影響あり, 0: 影響なし)
- qt: 数値データ
- 解析手法の提案:
- 特徴量の相関関係の調査やクラスタリング分析:データセットの中の数値データに対して、特徴量間の関係性を調査したり、類似した特徴量をグループ化したりすることができます。
- 欠損値の処理:データセットに欠損値が含まれているため、欠損値の補完や削除を行うことができます。
- Pythonライブラリの提案:
- pandas: データフレーム形式でデータを扱う際に使用します。データの読み込み、前処理、欠損値の処理などに便利です。
- NumPy: 数値計算や行列演算などに使用します。特に、欠損値の処理や特徴量の相関関係の計算に役立ちます。
- matplotlib / seaborn: データの可視化に使用します。相関関係や分布を視覚化することで、データの理解や解析結果の可視化が容易になります。
- scikit-learn: 機械学習アルゴリズムの実装やモデル評価など、機械学習の手法を使用する場合に便利です。
以上の手法やライブラリを使用することで、このデータセットの特徴を把握し、関連する分析を行うことができるでしょう。
先頭10データ:
id | fid | mid | sex | aff | qt | |
---|---|---|---|---|---|---|
1 | 1 | 0 | 0 | 1 | 1 | -0.9642 |
2 | 2 | 0 | 0 | 2 | 1 | 1.0865 |
3 | 3 | 0 | 0 | 1 | 1 | -0.5363 |
4 | 4 | 0 | 0 | 2 | 1 | 0.4514 |
5 | 5 | 1 | 2 | 1 | 1 | 0.0538 |
6 | 6 | 1 | 2 | 1 | 1 | -1.2667 |
7 | 7 | 3 | 4 | 2 | 1 | NaN |
8 | 8 | 3 | 4 | 2 | 1 | 0.1743 |
9 | 9 | 0 | 0 | 2 | 1 | 0.2923 |
10 | 10 | 0 | 0 | 1 | 1 | NaN |
lukas
An example pedigree
Data shape: (85, 4)
データの内容:
このデータは家系図の一部を表しており、id、father、mother、sexの4つのカラムから構成されています。各行は個々の人物を表しており、idはその人物の一意の識別子、fatherとmotherはその人物の親のid、sexはその人物の性別を示しています。
どのような解析手法が使えそうか:
このデータは家族関係を表しているため、家族の構成や遺伝的な関連性を分析する手法が使えます。具体的には、家系図の可視化や家族内の特定の特徴の遺伝パターンの解析などが考えられます。
そのために使えるPythonライブラリは何か:
このような解析にはグラフ理論やネットワーク分析のライブラリが有用です。Pythonでは、NetworkXやigraphなどのライブラリを使用することで、グラフ構造を解析し、家族関係の可視化や特定のパターンの検出が可能です。また、MatplotlibやSeabornなどの可視化ライブラリを組み合わせることで、分析結果をグラフや図表として視覚化することもできます。
以上のことから、このデータの解析にはNetworkXやigraphなどのグラフ理論ライブラリと、MatplotlibやSeabornなどの可視化ライブラリが役立つでしょう。
先頭10データ:
id | father | mother | sex | |
---|---|---|---|---|
1 | 2 | 0 | 0 | F |
2 | 88 | 0 | 0 | F |
3 | 8 | 0 | 0 | F |
4 | 10 | 0 | 0 | F |
5 | 20 | 0 | 0 | F |
6 | 22 | 0 | 0 | F |
7 | 24 | 0 | 0 | F |
8 | 26 | 0 | 0 | F |
9 | 18 | 0 | 0 | F |
10 | 34 | 0 | 0 | F |
mao
A study of Parkinson's disease and MAO gene
Data shape: (340, 19)
データの内容:
- Parkinson's disease(パーキンソン病)に関する研究データ
- MAO(モノアミン酸化酵素)に関連したデータ
解析手法の提案:
-
パーキンソン病に関するデータの分析:
-
パーキンソン病の有無に対する予測モデルの構築
-
パーキンソン病の重症度を予測する回帰モデルの構築
-
パーキンソン病の特徴的な症状や要因の特定
-
MAOに関連したデータの分析:
-
MAO遺伝子の変異とパーキンソン病の関連性の検討
-
MAO活性や遺伝子型とパーキンソン病の症状や進行度の関連性の検討
Pythonライブラリの提案:
- パーキンソン病に関するデータ分析には、scikit-learnやXGBoostなどの機械学習ライブラリが活用できます。
- データの前処理や可視化には、pandasやmatplotlibなどのライブラリが有用です。
先頭10データ:
id | type | gender | age | aao | aad | updrs | maoai2 | ai2code | maobi2 | bi2code | gtbex3 | bex3code | maoavntr | vntrcode | vntrcod2 | maoa31 | mao31cod | mao31co2 | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 2341.00 | 0 | 0 | 69.0 | NaN | NaN | NaN | 116 | 7 | 179 | 6 | 255 | 4 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
2 | 2342.00 | 0 | 0 | NaN | NaN | NaN | NaN | 122 | 10 | 179 | 6 | 255 | 4 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
3 | 2343.00 | 0 | 0 | NaN | NaN | NaN | NaN | 112 | 5 | 175 | 4 | 255 | 4 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
4 | 2344.00 | 0 | 0 | NaN | NaN | NaN | NaN | 114 | 6 | 179 | 6 | 255 | 4 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
5 | 2345.00 | 0 | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | 112/112 | 5/5 | 181/181 | 7/7 | 251/255 | 2/4 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
6 | 2346.00 | 0 | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | 112/114 | 5/6 | 181/181 | 7/7 | 255/255 | 4/4 | 349/349 | 4/4 | 4/4 | 336/336 | C/C | 3/3 |
7 | 2347.00 | 0 | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | 110/112 | 4/5 | 177/181 | 5/7 | 255/255 | 4/4 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
8 | 2348.00 | 0 | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | 112/112 | 5/5 | 177/181 | 5/7 | 255/255 | 4/4 | 349/349 | 4/4 | 4/4 | 336/336 | C/C | 3/3 |
9 | 2349.00 | 0 | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | 112/112 | 5/5 | 175/175 | 4/4 | 255/255 | 4/4 | 349/349 | 4/4 | 4/4 | 338/338 | C/C | 3/3 |
10 | 2350.00 | 0 | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | 126/126 | 12/12 | 179/179 | 6/6 | 255/255 | 4/4 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
mfblong
Example data for ACEnucfam
Data shape: (3000, 10)
データの内容:
- bwt: 胎児の出生時の体重
- male: 性別(男性:1、女性:0)
- first: 母親の初産かどうか(初産:1、非初産:0)
- midage: 母親の年齢が中年かどうか(中年:1、非中年:0)
- highage: 母親の年齢が高年かどうか(高年:1、非高年:0)
- birthyr: 出生年(1年生まれ:1、それ以外:0)
- var1, var2, var3: 追加の変数
- familyid: 家族ID
解析手法の提案:
このデータセットは胎児の出生時の体重とその他の要素(性別や母親の特徴など)の関係を分析するのに適しています。具体的な解析手法の提案としては、以下のようなものが考えられます。
-
線形回帰分析:胎児の体重を予測するための回帰モデルを構築します。bwtを目的変数として、male、first、midage、highage、birthyr、var1、var2、var3を説明変数として使用します。
-
特徴選択:胎児の体重との関連が強いと考えられる特徴を選択します。例えば、相関係数や特徴の重要度を計算し、重要な特徴のみをモデル構築に使用します。
-
クラスタリング:データのクラスタを特定し、胎児の体重とその他の要素の関係を視覚化するために、クラスタリング手法を使用します。
Pythonライブラリの提案:
上記の解析手法を実装するためには、以下のPythonライブラリが役立ちます。
- NumPy: 数値計算ライブラリであり、データの処理や数学的な操作に使用します。
- pandas: データフレームを扱うためのライブラリであり、データの読み込みや前処理、特徴選択などに使用します。
- scikit-learn: 機械学習ライブラリであり、線形回帰分析や特徴選択、クラスタリングなどの解析手法を提供しています。
- Matplotlib: データの可視化のためのライブラリであり、クラスタリング結果のプロットなどに使用します。
これらのライブラリを組み合わせてデータの解析を行うことで、胎児の出生時の体重とその他の要素との関係を深堀りすることができます。
先頭10データ:
bwt | male | first | midage | highage | birthyr | var1 | var2 | var3 | familyid | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 3520 | 0 | 1 | 0 | 0 | 5 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 1 |
2 | 3660 | 0 | 0 | 1 | 0 | 5 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 2 |
3 | 3790 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 3 |
4 | 2765 | 0 | 0 | 1 | 0 | 3 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 4 |
5 | 3650 | 0 | 0 | 1 | 0 | 4 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 5 |
6 | 3800 | 0 | 0 | 1 | 0 | 4 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 6 |
7 | 3140 | 0 | 0 | 1 | 0 | 5 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 7 |
8 | 3100 | 0 | 0 | 1 | 0 | 5 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 8 |
9 | 3420 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 9 |
10 | 3000 | 0 | 1 | 1 | 0 | 4 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 10 |
mhtdata
An example data for Manhattan plot
Data shape: (159312, 8)
データの内容:
このデータは、マンハッタンプロットの例として使用されるもので、rsn(遺伝子座のID)、gene(遺伝子の名前)、pos(遺伝子座の位置)、p(統計的有意性)、chr(染色体番号)などの情報が含まれています。
解析手法:
このデータは、遺伝子の関連性や遺伝子座の位置と統計的有意性の関係を調べるために使用できます。具体的な解析手法としては、遺伝子の関連性を調べるための相関分析や差異解析、遺伝子座の位置と統計的有意性の関係を調べるための回帰分析などが考えられます。
Pythonライブラリ:
この解析には、以下のPythonライブラリが役立ちます。
- pandas: データの読み込みや操作に使用します。
- numpy: 数値演算や配列操作に使用します。
- seaborn: データの可視化に使用します。
- statsmodels: 統計的な解析に使用します。
- scikit-learn: 機械学習モデルを使用した解析に使用します。
これらのライブラリを使用して、データの読み込み、前処理、解析、可視化を行うことができます。具体的なコード例は以下の通りです。
import pandas as pd
import numpy as np
import seaborn as sns
import statsmodels.api as sm
from sklearn.linear_model import LinearRegression
# データの読み込み
df = pd.read_csv('mhtdata.csv')
# データの確認
print(df.head())
# 相関分析
correlation_matrix = df[['gene', 'p']].corr()
print(correlation_matrix)
# 回帰分析
X = df['pos']
y = df['p']
X = sm.add_constant(X)
model = sm.OLS(y, X)
results = model.fit()
print(results.summary())
# データの可視化
sns.scatterplot(x='pos', y='p', data=df)
# 機械学習モデルの作成
X = df[['pos']]
y = df['p']
model = LinearRegression()
model.fit(X, y)
これらのコードを使用して、データの解析や可視化を行うことができます。
先頭10データ:
rsn | gene | pos | p | chr | _freq_ | start | end | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | rs10907175 | TTLL10 | 1120590 | 0.043280 | 1 | 1 | 1104458 | 1123090 |
2 | rs3813199 | SDF4 | 1148140 | 0.029670 | 1 | 2 | 1142754 | 1154036 |
3 | rs3766186 | SDF4 | 1152298 | 0.027900 | 1 | 2 | 1142754 | 1154036 |
4 | rs17160669 | NaN | 1295424 | 0.016100 | 1 | 55300 | 43382 | 247085757 |
5 | rs1781145 | ATAD3C | 1378152 | 0.032070 | 1 | 1 | 1375926 | 1393773 |
6 | rs867207 | NaN | 1701274 | 0.032000 | 1 | 55300 | 43382 | 247085757 |
7 | rs12132341 | PRKCZ | 2084392 | 0.028650 | 1 | 1 | 2065637 | 2106308 |
8 | rs6673129 | SKI | 2192634 | 0.005362 | 1 | 1 | 2150065 | 2228064 |
9 | rs2843127 | MORN1 | 2305577 | 0.032500 | 1 | 1 | 2242681 | 2312832 |
10 | rs4233033 | NaN | 2358092 | 0.042140 | 1 | 55300 | 43382 | 247085757 |
nep499
A study of Alzheimer's disease with eight SNPs and APOE
Data shape: (499, 23)
データの内容:
このデータセットは、アルツハイマー病に関する研究データで、8つのSNP(シングルヌクレオチド多型)とAPOE遺伝子に関連しています。データセットには、被験者の性別、年齢、SNPとAPOEの遺伝子型、APOE4の有無、疾患の進行状況などが含まれています。
解析手法の提案:
このデータセットを分析するためには、以下の解析手法が使えそうです。
- 目的変数(status)と説明変数(SNP、APOE、性別、年齢など)の関係性を調べるための回帰分析
- 目的変数(status)と説明変数(SNP、APOE、性別、年齢など)の関係性を調べるためのロジスティック回帰分析
- 目的変数(status)を予測するための分類モデル(ランダムフォレスト、サポートベクターマシンなど)
Pythonライブラリの提案:
- 回帰分析やロジスティック回帰分析には、scikit-learnライブラリが便利です。
- 分類モデルの構築には、scikit-learnライブラリの他にも、XGBoostやLightGBMなどの高性能な機械学習ライブラリを活用することも有益です。
- データの可視化には、matplotlibやseabornなどの可視化ライブラリを使用することができます。
以上の手法とPythonライブラリを使用して、このデータセットの解析や予測モデルの構築を行うことができます。
先頭10データ:
id | sex | age | APOE.a1 | APOE.a2 | apoe4 | status | R6.a1 | R6.a2 | N4.a1 | N4.a2 | N6.a1 | N6.a2 | N11.a1 | N11.a2 | N15.a1 | N15.a2 | N18.a1 | N18.a2 | N22.a1 | N22.a2 | N24.a1 | N24.a2 | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 1 | 1 | 68 | 2 | 3 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | 2 | 1 | 2 |
2 | 2 | 1 | 77 | 3 | 4 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 |
3 | 3 | 1 | 71 | 3 | 3 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 |
4 | 4 | 1 | 74 | 3 | 3 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 |
5 | 5 | 1 | 66 | 3 | 3 | 0 | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | 2 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | 2 | 1 | 2 |
6 | 6 | 1 | 69 | 3 | 4 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 |
7 | 7 | 1 | 81 | 3 | 3 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 | 1 | 2 |
8 | 8 | 1 | 77 | 3 | 3 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
9 | 9 | 1 | 77 | 2 | 3 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 |
10 | 10 | 1 | 74 | 3 | 3 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
diamonds
Prices of 50,000 round cut diamonds
Data shape: (53940, 10)
データの内容:
このデータは50,000個のラウンドカットのダイヤモンドの価格に関する情報を含んでいます。データには以下の特徴量が含まれています:carat(カラット数)、cut(カットの品質)、color(ダイヤモンドの色)、clarity(ダイヤモンドの透明度)、depth(深度)、table(テーブル幅)、x(縦の長さ)、y(横の長さ)、z(高さ)、price(価格)。
解析手法の提案:
このデータを分析するためには、以下のような解析手法が使えそうです:
- 相関分析:特徴量間の相関関係を調べることで、価格に影響を与える主な要因を特定することができます。例えば、caratとpriceの間には正の相関があるかもしれません。
- 回帰分析:価格を予測するために、他の特徴量を使って回帰モデルを作成することができます。これにより、新しいダイヤモンドの価格を推定することができます。
Pythonライブラリの提案:
データの分析には、以下のPythonライブラリが使えます:
- pandas:データの読み込みや前処理、特徴量の選択などに便利な機能があります。
- seaborn:データの可視化や相関行列の作成などに使用できます。
- scikit-learn:回帰分析や特徴量のスケーリングなど、機械学習に関連する機能があります。
- statsmodels:統計モデルの構築や統計テストなどに使用できます。
以上の手法とライブラリを使用して、ダイヤモンドの価格に関する洞察を得ることができます。
先頭10データ:
carat | cut | color | clarity | depth | table | price | x | y | z | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 0.23 | Ideal | E | SI2 | 61.5 | 55.0 | 326 | 3.95 | 3.98 | 2.43 |
2 | 0.21 | Premium | E | SI1 | 59.8 | 61.0 | 326 | 3.89 | 3.84 | 2.31 |
3 | 0.23 | Good | E | VS1 | 56.9 | 65.0 | 327 | 4.05 | 4.07 | 2.31 |
4 | 0.29 | Premium | I | VS2 | 62.4 | 58.0 | 334 | 4.20 | 4.23 | 2.63 |
5 | 0.31 | Good | J | SI2 | 63.3 | 58.0 | 335 | 4.34 | 4.35 | 2.75 |
6 | 0.24 | Very Good | J | VVS2 | 62.8 | 57.0 | 336 | 3.94 | 3.96 | 2.48 |
7 | 0.24 | Very Good | I | VVS1 | 62.3 | 57.0 | 336 | 3.95 | 3.98 | 2.47 |
8 | 0.26 | Very Good | H | SI1 | 61.9 | 55.0 | 337 | 4.07 | 4.11 | 2.53 |
9 | 0.22 | Fair | E | VS2 | 65.1 | 61.0 | 337 | 3.87 | 3.78 | 2.49 |
10 | 0.23 | Very Good | H | VS1 | 59.4 | 61.0 | 338 | 4.00 | 4.05 | 2.39 |
economics
US economic time series.
Data shape: (478, 6)
データの内容は、1967年6月から1968年3月までのアメリカの経済指標データです。データには日付、個人消費支出(pce)、人口(pop)、個人貯蓄率(psavert)、失業者数(uempmed)、失業率(unemploy)が含まれています。
このデータセットには、時間の経過に伴う経済指標の変化を分析することができます。具体的には、個人消費支出と他の指標の関係性や、失業者数と失業率の関係性を調べることができます。
このような時系列データの解析には、ARIMAモデルやSARIMAモデルが適しています。ARIMAモデルは自己回帰モデルであり、過去のデータを使用して未来の値を予測します。また、SARIMAモデルは季節性を考慮したARIMAモデルです。
PythonでARIMAモデルやSARIMAモデルを実装するためには、statsmodelsライブラリを使用することができます。このライブラリには、ARIMAモデルやSARIMAモデルのクラスが含まれており、容易にモデルを構築することができます。
具体的な手法としては、データセット内の個人消費支出(pce)の時間に対する変動パターンを分析し、ARIMAモデルやSARIMAモデルを使用して将来の個人消費支出を予測することができます。また、失業者数(uempmed)と失業率(unemploy)の関係性を調べるために、相関係数や散布図を使用することもできます。
先頭10データ:
date | pce | pop | psavert | uempmed | unemploy | |
---|---|---|---|---|---|---|
1 | 1967-06-30 | 507.8 | 198712 | 9.8 | 4.5 | 2944 |
2 | 1967-07-31 | 510.9 | 198911 | 9.8 | 4.7 | 2945 |
3 | 1967-08-31 | 516.7 | 199113 | 9.0 | 4.6 | 2958 |
4 | 1967-09-30 | 513.3 | 199311 | 9.8 | 4.9 | 3143 |
5 | 1967-10-31 | 518.5 | 199498 | 9.7 | 4.7 | 3066 |
6 | 1967-11-30 | 526.2 | 199657 | 9.4 | 4.8 | 3018 |
7 | 1967-12-31 | 532.0 | 199808 | 9.0 | 5.1 | 2878 |
8 | 1968-01-31 | 534.7 | 199920 | 9.5 | 4.5 | 3001 |
9 | 1968-02-29 | 545.4 | 200056 | 8.9 | 4.1 | 2877 |
10 | 1968-03-31 | 545.1 | 200208 | 9.6 | 4.6 | 2709 |
midwest
Midwest demographics.
Data shape: (437, 28)
データの内容:
Midwestのデモグラフィック情報。各郡(county)の人口(poptotal)や人種別の人口割合(percwhite, percblack, percasian)などが含まれています。
解析手法:
このデータセットでは、各郡の人口統計情報や人種情報が含まれているため、以下のような解析手法が使えそうです。
- 郡ごとの人口密度の比較
- 人種別の人口割合の比較
- 貧困率や子供の貧困率といった社会経済的な指標の分析
Pythonライブラリの提案:
このデータセットを解析するためには、以下のようなPythonライブラリが使えます。
- pandas: データフレーム形式でデータを扱い、集計や統計処理を行うために使用します。
- matplotlib: グラフの描画に使用します。人口密度の比較や人種別の人口割合の可視化などに役立ちます。
- seaborn: matplotlibのラッパーライブラリであり、グラフを美しく描画するために使用します。
- scikit-learn: 機械学習モデルを構築し、データの予測やクラスタリングなどを行うために使用します。
以上の手法やライブラリを活用することで、Midwestのデモグラフィック情報を効果的に分析することができます。
先頭10データ:
PID | county | state | area | poptotal | popdensity | popwhite | popblack | popamerindian | popasian | popother | percwhite | percblack | percamerindan | percasian | percother | popadults | perchsd | percollege | percprof | poppovertyknown | percpovertyknown | percbelowpoverty | percchildbelowpovert | percadultpoverty | percelderlypoverty | inmetro | category | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 561 | ADAMS | IL | 0.052 | 66090 | 1270.961540 | 63917 | 1702 | 98 | 249 | 124 | 96.712059 | 2.575276 | 0.148283 | 0.376759 | 0.187623 | 43298 | 75.107395 | 19.631392 | 4.355859 | 63628 | 96.274777 | 13.151443 | 18.011717 | 11.009776 | 12.443812 | 0 | AAR |
2 | 562 | ALEXANDER | IL | 0.014 | 10626 | 759.000000 | 7054 | 3496 | 19 | 48 | 9 | 66.384340 | 32.900433 | 0.178807 | 0.451722 | 0.084698 | 6724 | 59.726353 | 11.243308 | 2.870315 | 10529 | 99.087145 | 32.244278 | 45.826514 | 27.385647 | 25.228976 | 0 | LHR |
3 | 563 | BOND | IL | 0.022 | 14991 | 681.409091 | 14477 | 429 | 35 | 16 | 34 | 96.571276 | 2.861717 | 0.233473 | 0.106731 | 0.226803 | 9669 | 69.334988 | 17.033819 | 4.488572 | 14235 | 94.956974 | 12.068844 | 14.036061 | 10.852090 | 12.697410 | 0 | AAR |
4 | 564 | BOONE | IL | 0.017 | 30806 | 1812.117650 | 29344 | 127 | 46 | 150 | 1139 | 95.254171 | 0.412257 | 0.149322 | 0.486918 | 3.697332 | 19272 | 75.472188 | 17.278954 | 4.197800 | 30337 | 98.477569 | 7.209019 | 11.179536 | 5.536013 | 6.217047 | 1 | ALU |
5 | 565 | BROWN | IL | 0.018 | 5836 | 324.222222 | 5264 | 547 | 14 | 5 | 6 | 90.198766 | 9.372858 | 0.239890 | 0.085675 | 0.102810 | 3979 | 68.861523 | 14.475999 | 3.367680 | 4815 | 82.505140 | 13.520249 | 13.022889 | 11.143211 | 19.200000 | 0 | AAR |
6 | 566 | BUREAU | IL | 0.050 | 35688 | 713.760000 | 35157 | 50 | 65 | 195 | 221 | 98.512105 | 0.140103 | 0.182134 | 0.546402 | 0.619256 | 23444 | 76.629415 | 18.904624 | 3.275891 | 35107 | 98.372002 | 10.399635 | 14.158819 | 8.179287 | 11.008586 | 0 | AAR |
7 | 567 | CALHOUN | IL | 0.017 | 5322 | 313.058824 | 5298 | 1 | 8 | 15 | 0 | 99.549042 | 0.018790 | 0.150319 | 0.281849 | 0.000000 | 3583 | 62.824449 | 11.917388 | 3.209601 | 5241 | 98.478016 | 15.149781 | 13.787761 | 12.932331 | 21.085271 | 0 | LAR |
8 | 568 | CARROLL | IL | 0.027 | 16805 | 622.407407 | 16519 | 111 | 30 | 61 | 84 | 98.298126 | 0.660518 | 0.178518 | 0.362987 | 0.499851 | 11323 | 75.951603 | 16.197121 | 3.055727 | 16455 | 97.917287 | 11.710726 | 17.225462 | 10.027037 | 9.525052 | 0 | AAR |
9 | 569 | CASS | IL | 0.024 | 13437 | 559.875000 | 13384 | 16 | 8 | 23 | 6 | 99.605567 | 0.119074 | 0.059537 | 0.171169 | 0.044653 | 8825 | 72.271955 | 14.107649 | 3.206799 | 13081 | 97.350599 | 13.875086 | 17.994784 | 11.914343 | 13.660180 | 0 | AAR |
10 | 570 | CHAMPAIGN | IL | 0.058 | 173025 | 2983.189660 | 146506 | 16559 | 331 | 8033 | 1596 | 84.673313 | 9.570293 | 0.191302 | 4.642682 | 0.922410 | 95971 | 87.499349 | 41.295808 | 17.757448 | 154934 | 89.544286 | 15.572437 | 14.132234 | 17.562728 | 8.105017 | 1 | HAU |
movies
Movie information and user ratings from IMDB.com.
Data shape: (58788, 24)
このデータセットはIMDB.comからの映画情報とユーザーの評価データです。以下は提案です。
データの内容:
- 映画のタイトル、年、長さ、予算、評価、投票数、詳細な評価データ、MPAAレーティング、ジャンルの情報が含まれています。
解析手法の提案:
- 映画の評価やジャンルの関連性を調査したい場合には、相関分析やクラスタリング分析が有用です。
- 映画の予算と評価の関係を調べたい場合には、回帰分析や散布図行列の作成が有用です。
- 映画のMPAAレーティングとジャンルの関係を調べたい場合には、カイ二乗検定やクロス集計表の作成が有用です。
使用できるPythonライブラリの提案:
- データの前処理や可視化にはpandasやmatplotlibが有用です。
- 相関分析やクラスタリング分析にはscikit-learnが有用です。
- 回帰分析や散布図行列の作成にはstatsmodelsやseabornが有用です。
- カイ二乗検定やクロス集計表の作成にはscipyやpandasが有用です。
先頭10データ:
title | year | length | budget | rating | votes | r1 | r2 | r3 | r4 | r5 | r6 | r7 | r8 | r9 | r10 | mpaa | Action | Animation | Comedy | Drama | Documentary | Romance | Short | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | $ | 1971 | 121 | NaN | 6.4 | 348 | 4.5 | 4.5 | 4.5 | 4.5 | 14.5 | 24.5 | 24.5 | 14.5 | 4.5 | 4.5 | NaN | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 |
2 | $1000 a Touchdown | 1939 | 71 | NaN | 6.0 | 20 | 0.0 | 14.5 | 4.5 | 24.5 | 14.5 | 14.5 | 14.5 | 4.5 | 4.5 | 14.5 | NaN | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
3 | $21 a Day Once a Month | 1941 | 7 | NaN | 8.2 | 5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 24.5 | 0.0 | 44.5 | 24.5 | 24.5 | NaN | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
4 | $40,000 | 1996 | 70 | NaN | 8.2 | 6 | 14.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 34.5 | 45.5 | NaN | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
5 | $50,000 Climax Show, The | 1975 | 71 | NaN | 3.4 | 17 | 24.5 | 4.5 | 0.0 | 14.5 | 14.5 | 4.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 24.5 | NaN | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
6 | $pent | 2000 | 91 | NaN | 4.3 | 45 | 4.5 | 4.5 | 4.5 | 14.5 | 14.5 | 14.5 | 4.5 | 4.5 | 14.5 | 14.5 | NaN | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
7 | $windle | 2002 | 93 | NaN | 5.3 | 200 | 4.5 | 0.0 | 4.5 | 4.5 | 24.5 | 24.5 | 14.5 | 4.5 | 4.5 | 14.5 | R | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
8 | '15' | 2002 | 25 | NaN | 6.7 | 24 | 4.5 | 4.5 | 4.5 | 4.5 | 4.5 | 14.5 | 14.5 | 14.5 | 4.5 | 14.5 | NaN | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 |
9 | '38 | 1987 | 97 | NaN | 6.6 | 18 | 4.5 | 4.5 | 4.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 34.5 | 14.5 | 4.5 | 24.5 | NaN | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
10 | '49-'17 | 1917 | 61 | NaN | 6.0 | 51 | 4.5 | 0.0 | 4.5 | 4.5 | 4.5 | 44.5 | 14.5 | 4.5 | 4.5 | 4.5 | NaN | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
mpg
Fuel economy data from 1999 and 2008 for 38 popular models of car
Data shape: (234, 11)
データの内容:
このデータは1999年と2008年における38種類の人気車モデルの燃費データです。データにはメーカー、モデル、排気量、製造年、シリンダー数、トランスミッションのタイプ、駆動方式、都市部での燃費、高速道路での燃費、燃料の種類、車のクラスが含まれています。
どのような解析手法が使えそうか:
このデータセットでは、さまざまな要素が含まれているため、いくつかの解析手法が使えそうです。以下はいくつかの例です。
- データの可視化と探索的データ分析(EDA): データの特徴を視覚化し、相関関係や傾向を探索することで、車の燃費に影響を与える要素を特定することができます。
- 線形回帰: 探索的データ分析の結果を基に、車の燃費と他の要素との関係をモデル化することができます。
- クラスタリング: 車のクラスや他の要素を基に、類似した特性を持つ車をグループ化することができます。
そのために使えるPythonライブラリは何か:
上記の解析手法を実装するために、以下のPythonライブラリが役立ちます:
- pandas: データセットの読み込み、データの操作、データフレームの作成などのための強力なツールです。
- MatplotlibやSeaborn: データの可視化に使用されるライブラリで、さまざまなグラフやプロットを作成できます。
- scikit-learn: 機械学習モデルの構築や評価に使用されるライブラリです。回帰やクラスタリングなどのアルゴリズムが含まれています。
以上の手法とライブラリを使用して、このデータセットを分析し、車の燃費に影響を与える要素を特定することができます。
先頭10データ:
manufacturer | model | displ | year | cyl | trans | drv | cty | hwy | fl | class | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | audi | a4 | 1.8 | 1999 | 4 | auto(l5) | f | 18 | 29 | p | compact |
2 | audi | a4 | 1.8 | 1999 | 4 | manual(m5) | f | 21 | 29 | p | compact |
3 | audi | a4 | 2.0 | 2008 | 4 | manual(m6) | f | 20 | 31 | p | compact |
4 | audi | a4 | 2.0 | 2008 | 4 | auto(av) | f | 21 | 30 | p | compact |
5 | audi | a4 | 2.8 | 1999 | 6 | auto(l5) | f | 16 | 26 | p | compact |
6 | audi | a4 | 2.8 | 1999 | 6 | manual(m5) | f | 18 | 26 | p | compact |
7 | audi | a4 | 3.1 | 2008 | 6 | auto(av) | f | 18 | 27 | p | compact |
8 | audi | a4 quattro | 1.8 | 1999 | 4 | manual(m5) | 4 | 18 | 26 | p | compact |
9 | audi | a4 quattro | 1.8 | 1999 | 4 | auto(l5) | 4 | 16 | 25 | p | compact |
10 | audi | a4 quattro | 2.0 | 2008 | 4 | manual(m6) | 4 | 20 | 28 | p | compact |
msleep
An updated and expanded version of the mammals sleep dataset.
Data shape: (83, 11)
データの内容:
- 動物の名前(name)
- 動物の属(genus)
- 食性(vore)
- 動物の分類(order)
- 保護状況(conservation)
- 総睡眠時間(sleep_total)
- REM睡眠時間(sleep_rem)
- 睡眠周期(sleep_cycle)
- 起きている時間(awake)
- 脳の重さ(brainwt)
- 体の重さ(bodywt)
解析手法の提案:
このデータセットでは、動物の睡眠パターンと関連する情報が含まれています。以下のような解析手法が使えそうです。
- 睡眠時間と体の重さの関係の分析:睡眠時間と体の重さの相関関係を調べることで、動物の体の大きさと睡眠時間の関係を明らかにすることができます。これにより、動物の進化や生態についての洞察が得られる可能性があります。
- 睡眠パターンのクラスタリング:睡眠時間、REM睡眠時間、睡眠周期などの特徴量を使用して、動物の睡眠パターンをクラスタリングすることができます。これにより、類似した睡眠パターンを持つ動物のグループを特定することができます。
- 保護状況と睡眠パターンの関連性の分析:保護状況と睡眠パターンの関係を調べることで、野生動物の生息地や環境の変化が睡眠に与える影響を理解することができます。
Pythonライブラリの提案:
上記の解析手法を実施するためには、以下のPythonライブラリが役立つでしょう。
- NumPy:数値計算やデータ操作を行うためのライブラリです。
- Pandas:データの読み込みや処理を行うためのライブラリです。データのフィルタリングや集計、結合などの操作が可能です。
- Matplotlib:データの可視化を行うためのライブラリです。グラフや図表の作成やカスタマイズができます。
- Scikit-learn:機械学習モデルの構築やクラスタリングを行うためのライブラリです。クラスタリング手法や相関分析などの機能があります。
これらのライブラリを使用してデータの読み込み、前処理、解析、可視化を行うことで、動物の睡眠パターンに関する洞察を得ることができます。
先頭10データ:
name | genus | vore | order | conservation | sleep_total | sleep_rem | sleep_cycle | awake | brainwt | bodywt | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | Cheetah | Acinonyx | carni | Carnivora | lc | 12.1 | NaN | NaN | 11.9 | NaN | 50.000 |
2 | Owl monkey | Aotus | omni | Primates | NaN | 17.0 | 1.8 | NaN | 7.0 | 0.01550 | 0.480 |
3 | Mountain beaver | Aplodontia | herbi | Rodentia | nt | 14.4 | 2.4 | NaN | 9.6 | NaN | 1.350 |
4 | Greater short-tailed shrew | Blarina | omni | Soricomorpha | lc | 14.9 | 2.3 | 0.133333 | 9.1 | 0.00029 | 0.019 |
5 | Cow | Bos | herbi | Artiodactyla | domesticated | 4.0 | 0.7 | 0.666667 | 20.0 | 0.42300 | 600.000 |
6 | Three-toed sloth | Bradypus | herbi | Pilosa | NaN | 14.4 | 2.2 | 0.766667 | 9.6 | NaN | 3.850 |
7 | Northern fur seal | Callorhinus | carni | Carnivora | vu | 8.7 | 1.4 | 0.383333 | 15.3 | NaN | 20.490 |
8 | Vesper mouse | Calomys | NaN | Rodentia | NaN | 7.0 | NaN | NaN | 17.0 | NaN | 0.045 |
9 | Dog | Canis | carni | Carnivora | domesticated | 10.1 | 2.9 | 0.333333 | 13.9 | 0.07000 | 14.000 |
10 | Roe deer | Capreolus | herbi | Artiodactyla | lc | 3.0 | NaN | NaN | 21.0 | 0.09820 | 14.800 |
presidential
Terms of 10 presidents from Eisenhower to Bush W.
Data shape: (10, 4)
データの内容:
- 大統領の名前(name)
- 大統領の任期開始日(start)
- 大統領の任期終了日(end)
- 大統領の所属政党(party)
解析手法の提案:
- 大統領の任期の長さや連続して同じ政党が政権を担っている期間など、任期と政党の関係を分析することができます。
- 時系列データとして扱うことで、特定の時期における政党の勢力や大統領の交代の傾向を見ることができます。
Pythonライブラリの提案:
- pandas: データフレーム形式でデータを扱い、集計やフィルタリングを行うのに適しています。
- matplotlib: グラフを描画するためのライブラリで、時系列データの可視化に利用できます。
- numpy: 数値計算に特化したライブラリで、データの集計や統計処理に利用できます。
以上のライブラリを組み合わせて、大統領の任期と政党の関係を可視化したり、統計処理を行ったりすることができます。
先頭10データ:
name | start | end | party | |
---|---|---|---|---|
1 | Eisenhower | 1953-01-20 | 1961-01-20 | Republican |
2 | Kennedy | 1961-01-20 | 1963-11-22 | Democratic |
3 | Johson | 1963-11-22 | 1969-01-20 | Democratic |
4 | Nixon | 1969-01-20 | 1974-08-09 | Republican |
5 | Ford | 1974-08-09 | 1977-01-20 | Republican |
6 | Carter | 1977-01-20 | 1981-01-20 | Democratic |
7 | Reagan | 1981-01-20 | 1989-01-20 | Republican |
8 | Bush | 1989-01-20 | 1993-01-20 | Republican |
9 | Clinton | 1993-01-20 | 2001-01-20 | Democratic |
10 | Bush | 2001-01-20 | 2009-01-20 | Republican |
seals
Vector field of seal movements.
Data shape: (1155, 4)
データの内容:
このデータは、アザラシの移動に関する情報を含んでいます。緯度、経度、経度の変化、緯度の変化の情報が記録されています。
どのような解析手法が使えそうか:
このデータを用いて、アザラシの移動パターンや行動範囲の解析が可能です。また、アザラシの移動速度や方向の解析も行えます。
そのために使えるPythonライブラリは何か:
このデータの解析には、pandasやNumPyを使用することができます。これらのライブラリを使用してデータの読み込みや加工、統計解析を行うことができます。また、MatplotlibやSeabornを使用してデータの可視化も行えます。さらに、SciPyやscikit-learnを使用して、アザラシの移動パターンのクラスタリングや予測モデルの構築も可能です。
先頭10データ:
lat | long | delta_long | delta_lat | |
---|---|---|---|---|
1 | 29.7 | -172.8 | -0.915046 | 0.143475 |
2 | 30.7 | -172.8 | -0.867013 | 0.128389 |
3 | 31.7 | -172.8 | -0.818925 | 0.113232 |
4 | 32.7 | -172.8 | -0.770776 | 0.098020 |
5 | 33.7 | -172.8 | -0.722560 | 0.082766 |
6 | 34.7 | -172.8 | -0.674268 | 0.067484 |
7 | 35.7 | -172.8 | -0.625894 | 0.052187 |
8 | 36.7 | -172.8 | -0.577431 | 0.036890 |
9 | 37.7 | -172.8 | -0.528872 | 0.021606 |
10 | 38.7 | -172.8 | -0.480209 | 0.006350 |
Arbuthnot
Arbuthnot's data on male and female birth ratios in London from 1629-1710.
Data shape: (82, 7)
データの内容:
- ロンドンにおける1629年から1710年までの男女の出生比率に関するデータ
- 年、男性の出生数、女性の出生数、ペストの発生数、死亡率、男女の出生比、総出生数のデータが含まれています。
解析手法の提案:
- 時系列データの性質を考慮すると、時系列解析や回帰分析が有効な手法となります。
- また、男女の出生比や死亡率といった指標の変動を調べるために、統計的な検定やグラフ化も有用です。
Pythonライブラリの提案:
- 時系列解析には、statsmodelsやpandasなどのライブラリが利用できます。
- 回帰分析には、scikit-learnやstatsmodelsなどのライブラリが利用できます。
- 統計的な検定には、scipyやstatsmodelsなどのライブラリが利用できます。
- グラフ化には、matplotlibやseabornなどのライブラリが利用できます。
先頭10データ:
Year | Males | Females | Plague | Mortality | Ratio | Total | |
---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 1629 | 5218 | 4683 | 0 | 8771 | 1.114243 | 9.901 |
2 | 1630 | 4858 | 4457 | 1317 | 10554 | 1.089971 | 9.315 |
3 | 1631 | 4422 | 4102 | 274 | 8562 | 1.078011 | 8.524 |
4 | 1632 | 4994 | 4590 | 8 | 9535 | 1.088017 | 9.584 |
5 | 1633 | 5158 | 4839 | 0 | 8393 | 1.065923 | 9.997 |
6 | 1634 | 5035 | 4820 | 1 | 10400 | 1.044606 | 9.855 |
7 | 1635 | 5106 | 4928 | 0 | 10651 | 1.036120 | 10.034 |
8 | 1636 | 4917 | 4605 | 10400 | 23359 | 1.067752 | 9.522 |
9 | 1637 | 4703 | 4457 | 3082 | 11763 | 1.055194 | 9.160 |
10 | 1638 | 5359 | 4952 | 363 | 13624 | 1.082189 | 10.311 |
Bowley
Bowley's data on values of British and Irish trade, 1855-1899
Data shape: (45, 2)
データの内容:
年ごとのイギリスとアイルランドの貿易の値を示すデータです。
どのような解析手法が使えそうか:
時系列データの傾向や変化を分析するために、時系列解析が有用です。具体的には、トレンドや季節性の分析、予測モデルの構築などが考えられます。
そのために使えるPythonライブラリは何か:
このデータを分析するためには、主に以下のPythonライブラリが使えます。
- pandas: データの読み込みや前処理、データフレームの操作が容易に行えるライブラリです。
- matplotlib: グラフの描画に使用します。時系列データの可視化に適しています。
- statsmodels: 時系列解析に特化したライブラリで、トレンドや季節性の分析、ARIMAモデルの構築などが可能です。
- scikit-learn: 予測モデルの構築や評価に使用します。例えば、回帰モデルや時系列予測モデルの構築が可能です。
- seaborn: matplotlibをベースにした可視化ライブラリで、データの傾向や関係性を見るために使用できます。
以上のライブラリを使って、時系列データの傾向や変化を分析し、予測モデルを構築することが可能です。
先頭10データ:
Year | Value | |
---|---|---|
1 | 1855 | 95.7 |
2 | 1856 | 115.8 |
3 | 1857 | 122.0 |
4 | 1858 | 116.6 |
5 | 1859 | 130.4 |
6 | 1860 | 135.9 |
7 | 1861 | 125.1 |
8 | 1862 | 124.0 |
9 | 1863 | 146.5 |
10 | 1864 | 160.4 |
Cavendish
Cavendish's Determinations of the Density of the Earth
Data shape: (29, 3)
データの内容:
このデータは、Cavendishによる地球の密度の決定方法に関するものです。測定結果はdensity、density2、density3の3つの列に記録されています。
解析手法の提案:
このデータセットは、密度の測定結果を含んでいるため、統計解析や可視化、推測統計などの手法が使えそうです。また、欠損値があるため、欠損値処理の手法も必要です。
Pythonライブラリの提案:
データの統計解析や可視化には、PandasやMatplotlib、Seabornなどのライブラリが使えます。欠損値処理には、PandasやNumPyの機能を使うことができます。また、推測統計にはSciPyやStatsmodelsなどのライブラリが有用です。
先頭10データ:
density | density2 | density3 | |
---|---|---|---|
1 | 5.50 | 5.50 | NaN |
2 | 5.61 | 5.61 | NaN |
3 | 4.88 | 5.88 | NaN |
4 | 5.07 | 5.07 | NaN |
5 | 5.26 | 5.26 | NaN |
6 | 5.55 | 5.55 | NaN |
7 | 5.36 | 5.36 | 5.36 |
8 | 5.29 | 5.29 | 5.29 |
9 | 5.58 | 5.58 | 5.58 |
10 | 5.65 | 5.65 | 5.65 |
ChestSizes
Chest measurements of 5738 Scottish Militiamen
Data shape: (16, 2)
このデータは、5738人のスコットランド民兵隊員の胸囲の測定結果です。
解析手法としては、胸囲の分布を調べるためのヒストグラムや箱ひげ図を作成することが考えられます。また、胸囲の平均や中央値、分散などの統計量を求めることも有用です。
このためには、Pythonのデータ分析ライブラリであるPandasとMatplotlibを使用することができます。Pandasを使ってデータを読み込み、Matplotlibを使って可視化や統計量の計算を行うことができます。
以下は、PandasとMatplotlibを使った例です。
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
# データの読み込み
data = {
'chest': [33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42],
'count': [3, 18, 81, 185, 420, 749, 1073, 1079, 934, 658]
}
df = pd.DataFrame(data)
# ヒストグラムの作成
plt.hist(df['chest'], bins=10)
plt.xlabel('Chest Sizes')
plt.ylabel('Count')
plt.title('Histogram of Chest Sizes')
plt.show()
# 箱ひげ図の作成
plt.boxplot(df['chest'])
plt.xlabel('Chest Sizes')
plt.ylabel('Measurement')
plt.title('Boxplot of Chest Sizes')
plt.show()
# 統計量の計算
mean = df['chest'].mean()
median = df['chest'].median()
variance = df['chest'].var()
print(f"Mean: {mean}")
print(f"Median: {median}")
print(f"Variance: {variance}")
このコードを実行すると、ヒストグラムと箱ひげ図が表示され、また平均・中央値・分散が出力されます。これにより、胸囲の分布や特徴を把握することができます。
先頭10データ:
chest | count | |
---|---|---|
1 | 33 | 3 |
2 | 34 | 18 |
3 | 35 | 81 |
4 | 36 | 185 |
5 | 37 | 420 |
6 | 38 | 749 |
7 | 39 | 1073 |
8 | 40 | 1079 |
9 | 41 | 934 |
10 | 42 | 658 |
CushnyPeebles
Cushny-Peebles Data: Soporific Effects of Scopolamine Derivatives
Data shape: (11, 4)
データの内容:
このデータは、Cushny-Peeblesという研究において、スコポラミン誘導体の睡眠導入効果を調査した結果です。4種類の薬剤(Control、L_hyoscyamine、L_hyoscine、DL_hyoscine)による睡眠導入効果の値が10回の試行で測定されています。
解析手法:
このデータは、薬剤ごとの睡眠導入効果の比較を行うための分析に適しています。各薬剤の効果の違いを明らかにするために、平均値や各薬剤間の差異の統計的検定を行うことができます。
Pythonライブラリの提案:
このようなデータの解析には、主にNumPy、Pandas、Matplotlib、SciPyなどのライブラリが使用されます。
具体的な手順としては、まずNumPyを使用してデータを配列形式に変換し、各薬剤の平均値や標準偏差などの基本統計量を計算します。次に、Matplotlibを使用して薬剤ごとの効果を可視化し、効果の違いを視覚的に把握します。
さらに、SciPyの統計モジュールを使用して、各薬剤間の差異を統計的に検定することができます。例えば、t検定やANOVAなどの統計的検定を行い、各薬剤の効果に有意な差があるかどうかを判断します。
以上の手法とPythonライブラリを使用することで、このデータセットから薬剤の睡眠導入効果について詳細な分析が可能です。
先頭10データ:
Control | L_hyoscyamine | L_hyoscine | DL_hyoscine | |
---|---|---|---|---|
1 | 0.6 | 1.3 | 2.5 | 2.1 |
2 | 3.0 | 1.4 | 3.8 | 4.4 |
3 | 4.7 | 4.5 | 5.8 | 4.7 |
4 | 5.5 | 4.3 | 5.6 | 4.8 |
5 | 6.2 | 6.1 | 6.1 | 6.7 |
6 | 3.2 | 6.6 | 7.6 | 8.3 |
7 | 2.5 | 6.2 | 8.0 | 8.2 |
8 | 2.8 | 3.6 | 4.4 | 4.3 |
9 | 1.1 | 1.1 | 5.7 | 5.8 |
10 | 2.9 | 4.9 | 6.3 | 6.4 |
CushnyPeeblesN
Cushny-Peebles Data: Soporific Effects of Scopolamine Derivatives
Data shape: (11, 4)
このデータセットは、薬物の効果を調査するための実験結果を示しています。各行は、コントロールグループと3つの異なる薬物処理グループの効果を示しています。
解析手法としては、各薬物処理グループの効果を比較し、統計的な有意差を評価することが考えられます。また、薬物の効果に関する相関や傾向を調べるために、データの可視化や回帰分析も有用です。
このために使えるPythonライブラリとしては、以下のものがあります。
- pandas: データの読み込みと整形、データフレームの操作に使用します。
- numpy: 数値計算や配列操作に使用します。
- matplotlib: データの可視化に使用します。
- scipy: 統計解析や仮説検定に使用します。
- scikit-learn: 機械学習モデルの作成や評価に使用します。
これらのライブラリを組み合わせて、データの解析と結果の可視化を行うことができます。また、必要に応じて他のライブラリや手法も活用することができます。
先頭10データ:
Control | L_hyoscyamine | L_hyoscine | DL_hyoscine | |
---|---|---|---|---|
1 | 9 | 6 | 6 | 6 |
2 | 9 | 6 | 6 | 6 |
3 | 8 | 6 | 6 | 6 |
4 | 9 | 3 | 3 | 3 |
5 | 9 | 3 | 3 | 3 |
6 | 8 | 4 | 3 | 3 |
7 | 8 | 3 | 3 | 3 |
8 | 7 | 6 | 6 | 5 |
9 | 8 | 5 | 6 | 5 |
10 | 9 | 5 | 5 | 6 |
Dactyl
Edgeworth's counts of dactyls in Virgil's Aeneid
Data shape: (60, 3)
データの内容:
このデータは、エジュワースがウェルギリウスの『アエネイス』におけるダクテュルスの数をカウントしたものです。
どのような解析手法が使えそうか:
このデータは、ダクテュルスの数に関する情報を含んでいます。ダクテュルスは詩のメーターの一種であり、このデータを解析することでウェルギリウスの詩のリズムやパターンを理解することができます。具体的には、ダクテュルスの出現頻度や行数との関係、またはダクテュルスの出現位置に関する分析が考えられます。
そのために使えるPythonライブラリは何か:
このデータを解析するためには、以下のPythonライブラリが使えます。
- Pandas:データの読み込みやデータフレームの操作に使用します。
- Matplotlib:ダクテュルスの出現頻度や行数との関係を可視化するために使用します。
- NumPy:数値計算や統計処理を行うために使用します。
- NLTK(Natural Language Toolkit):テキストの解析や自然言語処理に使用します。ダクテュルスの出現位置やパターンを解析する際に役立つかもしれません。
以上のライブラリを使用して、ダクテュルスの数に関する情報を分析し、ウェルギリウスの詩のリズムやパターンを探求することができます。
先頭10データ:
Foot | Lines | count | |
---|---|---|---|
1 | 1 | 1:5 | 3 |
2 | 1 | 6:10 | 3 |
3 | 1 | 11:15 | 5 |
4 | 1 | 16:20 | 5 |
5 | 1 | 21:25 | 4 |
6 | 1 | 26:30 | 4 |
7 | 1 | 31:35 | 2 |
8 | 1 | 36:40 | 2 |
9 | 1 | 41:45 | 2 |
10 | 1 | 46:50 | 1 |
DrinksWages
Elderton and Pearson's (1910) data on drinking and wages
Data shape: (70, 6)
データの内容:
- クラス(A)ごとの職種(trade)と飲酒量(drinks)と賃金(wage)が記録されている。
解析手法の提案:
- 職種(trade)と飲酒量(drinks)と賃金(wage)の関係性を調べるために、相関分析や回帰分析が有効であると考えられます。
使えるPythonライブラリの提案:
- データの読み取りや整理にはpandasライブラリを使用します。
- 相関分析や回帰分析には、scipy.statsモジュールやstatsmodelsモジュールを使用します。
先頭10データ:
class | trade | sober | drinks | wage | n | |
---|---|---|---|---|---|---|
1 | A | papercutter | 1 | 1 | 24.000000 | 2 |
2 | A | cabmen | 1 | 10 | 18.416667 | 11 |
3 | A | goldbeater | 2 | 1 | 21.500000 | 3 |
4 | A | stablemen | 1 | 5 | 21.166667 | 6 |
5 | A | millworker | 2 | 0 | 19.000000 | 2 |
6 | A | porter | 9 | 8 | 20.500000 | 17 |
7 | A | warehouse | 8 | 2 | 24.333333 | 10 |
8 | A | maltmen | 3 | 5 | 23.000000 | 8 |
9 | A | chimneysweep | 0 | 7 | 17.333333 | 7 |
10 | A | carter | 12 | 23 | 22.166667 | 35 |
Fingerprints
Waite's data on Patterns in Fingerprints
Data shape: (36, 3)
データの内容:
このデータセットは指紋のパターンに関するデータです。指紋の種類(Whorls、Loops)とその指紋のパターンが出現した回数(count)が含まれています。
解析手法:
このデータを分析するためには、指紋のパターンごとの出現頻度を比較することが考えられます。具体的には、指紋のパターンごとに出現頻度の違いを調べるために、棒グラフや積み上げ棒グラフを作成することができます。また、指紋のパターンごとに出現頻度の関係を調べるために、散布図や相関係数の計算も行えます。
Pythonライブラリの提案:
このデータセットの分析には、PandasとMatplotlibを使用することができます。Pandasを使用してデータを読み込み、データの整理や集計を行い、Matplotlibを使用して可視化を行います。また、相関係数を計算するためには、NumPyを使用することもできます。
先頭10データ:
Whorls | Loops | count | |
---|---|---|---|
1 | 0 | 0 | 78.0 |
2 | 1 | 0 | 106.0 |
3 | 2 | 0 | 130.0 |
4 | 3 | 0 | 125.0 |
5 | 4 | 0 | 104.0 |
6 | 5 | 0 | 50.0 |
7 | 0 | 1 | 144.0 |
8 | 1 | 1 | 153.0 |
9 | 2 | 1 | 92.0 |
10 | 3 | 1 | 38.0 |
Galton
Galton's data on the heights of parents and their children
Data shape: (928, 2)
データの内容:
このデータセットは、親と子供の身長に関するガルトンのデータです。
解析手法:
親の身長と子供の身長の関係性を調べるために、回帰分析を使用することができます。具体的には、親の身長を説明変数、子供の身長を目的変数として、線形回帰モデルを構築することができます。
Pythonライブラリの提案:
この解析手法には、scikit-learnライブラリのLinearRegressionモジュールを使用することができます。また、データの可視化にはmatplotlibライブラリを使用することができます。
先頭10データ:
parent | child | |
---|---|---|
1 | 70.5 | 61.7 |
2 | 68.5 | 61.7 |
3 | 65.5 | 61.7 |
4 | 64.5 | 61.7 |
5 | 64.0 | 61.7 |
6 | 67.5 | 62.2 |
7 | 67.5 | 62.2 |
8 | 67.5 | 62.2 |
9 | 66.5 | 62.2 |
10 | 66.5 | 62.2 |
GaltonFamilies
Galton's data on the heights of parents and their children, by child
Data shape: (934, 8)
データの内容:
このデータはGalton'sのデータセットで、親と子供の身長データが含まれています。データには家族の情報(family)、父親の身長(father)、母親の身長(mother)、両親の身長の平均値(midparentHeight)、子供の数(children)、子供の番号(childNum)、子供の性別(gender)、子供の身長(childHeight)が含まれています。
解析手法の提案:
このデータセットでは、親と子供の身長の関係性を探ることができます。以下の解析手法が使えそうです。
-
回帰分析:親の身長と子供の身長の関係性を調べるために、回帰分析を行うことができます。
-
相関分析:親の身長と子供の身長の相関関係を調べるために、相関分析を行うことができます。
-
グループ別分析:子供の性別によって親の身長と子供の身長の関係性が異なるか調べるために、グループ別分析を行うことができます。
Pythonライブラリの提案:
この解析には以下のPythonライブラリが利用できます。
-
pandas:データの読み込みやデータの整形に利用できます。
-
numpy:数値計算や配列操作に利用できます。
-
matplotlib:データの可視化に利用できます。
-
seaborn:より高度なデータ可視化や統計解析に利用できます。
-
scikit-learn:回帰分析や相関分析などの機械学習手法を利用できます。
以上のライブラリを活用して、データの解析を行うことができます。
先頭10データ:
family | father | mother | midparentHeight | children | childNum | gender | childHeight | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 001 | 78.5 | 67.0 | 75.43 | 4 | 1 | male | 73.2 |
2 | 001 | 78.5 | 67.0 | 75.43 | 4 | 2 | female | 69.2 |
3 | 001 | 78.5 | 67.0 | 75.43 | 4 | 3 | female | 69.0 |
4 | 001 | 78.5 | 67.0 | 75.43 | 4 | 4 | female | 69.0 |
5 | 002 | 75.5 | 66.5 | 73.66 | 4 | 1 | male | 73.5 |
6 | 002 | 75.5 | 66.5 | 73.66 | 4 | 2 | male | 72.5 |
7 | 002 | 75.5 | 66.5 | 73.66 | 4 | 3 | female | 65.5 |
8 | 002 | 75.5 | 66.5 | 73.66 | 4 | 4 | female | 65.5 |
9 | 003 | 75.0 | 64.0 | 72.06 | 2 | 1 | male | 71.0 |
10 | 003 | 75.0 | 64.0 | 72.06 | 2 | 2 | female | 68.0 |
Guerry
Data from A.-M. Guerry, "Essay on the Moral Statistics of France"
Data shape: (86, 23)
データの内容:
- データはフランスの各県(Department)に関する統計情報であり、犯罪率、識字率、寄付金、人口などが含まれています。
解析手法:
- データの内容からは、県ごとの犯罪率や識字率の関係性を探ることができます。具体的には、犯罪率と識字率の相関を調べたり、犯罪率の予測モデルを構築することが考えられます。
Pythonライブラリ:
- データの操作や可視化には、pandasやMatplotlibを使うことができます。
- 統計分析には、scikit-learnやStatsModelsを使用することができます。
- 線形モデルや回帰分析には、scikit-learnやStatsModelsのlinear regressionモジュールを使うことができます。
- 相関関係の調査には、pandasのcorrメソッドを使用することができます。
以上の手法やライブラリを使って、フランスの各県における犯罪率と識字率の関係性を分析し、予測モデルを構築することができます。
先頭10データ:
dept | Region | Department | Crime_pers | Crime_prop | Literacy | Donations | Infants | Suicides | MainCity | Wealth | Commerce | Clergy | Crime_parents | Infanticide | Donation_clergy | Lottery | Desertion | Instruction | Prostitutes | Distance | Area | Pop1831 | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 1 | E | Ain | 28870 | 15890 | 37 | 5098 | 33120 | 35039 | 2:Med | 73 | 58 | 11 | 71 | 60 | 69 | 41 | 55 | 46 | 13 | 218.372 | 5762 | 346.03 |
2 | 2 | N | Aisne | 26226 | 5521 | 51 | 8901 | 14572 | 12831 | 2:Med | 22 | 10 | 82 | 4 | 82 | 36 | 38 | 82 | 24 | 327 | 65.945 | 7369 | 513.00 |
3 | 3 | C | Allier | 26747 | 7925 | 13 | 10973 | 17044 | 114121 | 2:Med | 61 | 66 | 68 | 46 | 42 | 76 | 66 | 16 | 85 | 34 | 161.927 | 7340 | 298.26 |
4 | 4 | E | Basses-Alpes | 12935 | 7289 | 46 | 2733 | 23018 | 14238 | 1:Sm | 76 | 49 | 5 | 70 | 12 | 37 | 80 | 32 | 29 | 2 | 351.399 | 6925 | 155.90 |
5 | 5 | E | Hautes-Alpes | 17488 | 8174 | 69 | 6962 | 23076 | 16171 | 1:Sm | 83 | 65 | 10 | 22 | 23 | 64 | 79 | 35 | 7 | 1 | 320.280 | 5549 | 129.10 |
6 | 7 | S | Ardeche | 9474 | 10263 | 27 | 3188 | 42117 | 52547 | 1:Sm | 84 | 1 | 28 | 76 | 47 | 67 | 70 | 19 | 62 | 1 | 279.413 | 5529 | 340.73 |
7 | 8 | N | Ardennes | 35203 | 8847 | 67 | 6400 | 16106 | 26198 | 2:Med | 33 | 4 | 50 | 53 | 85 | 49 | 31 | 62 | 9 | 83 | 105.694 | 5229 | 289.62 |
8 | 9 | S | Ariege | 6173 | 9597 | 18 | 3542 | 22916 | 123625 | 1:Sm | 72 | 60 | 39 | 74 | 28 | 63 | 75 | 22 | 77 | 3 | 385.313 | 4890 | 253.12 |
9 | 10 | E | Aube | 19602 | 4086 | 59 | 3608 | 18642 | 10989 | 2:Med | 14 | 3 | 42 | 77 | 54 | 9 | 28 | 86 | 15 | 207 | 83.244 | 6004 | 246.36 |
10 | 11 | S | Aude | 15647 | 10431 | 34 | 2582 | 20225 | 66498 | 2:Med | 17 | 35 | 15 | 80 | 35 | 27 | 50 | 63 | 48 | 1 | 370.949 | 6139 | 270.13 |
Jevons
W. Stanley Jevons' data on numerical discrimination
Data shape: (50, 4)
提案:
データの内容:
このデータセットは、W. Stanley Jevonsによる数値の識別に関するデータです。実際の値と推定値、出現頻度、誤差の情報が含まれています。
解析手法の提案:
このデータセットでは、実際の値と推定値の関係や誤差のパターンを分析することが求められています。以下の解析手法が使えそうです。
- 散布図:実際の値と推定値の関係を可視化することで、どの程度の誤差があるかや傾向を把握することができます。
- ヒストグラム:出現頻度の分布を確認することで、データの偏りや特徴を把握することができます。
- 統計的仮説検定:実際の値と推定値の差が統計的に有意なのかどうかを検定することで、推定の精度を評価することができます。
Pythonライブラリの提案:
この解析手法を実施するために、以下のPythonライブラリが利用できます。
- Pandas: データの読み込みやデータフレームの操作に便利なライブラリです。
- Matplotlib: 散布図やヒストグラムの可視化に利用できるライブラリです。
- NumPy: 統計的な計算や仮説検定に利用できるライブラリです。
以上の手法とライブラリを組み合わせることで、このデータセットの分析を行うことができます。
先頭10データ:
actual | estimated | frequency | error | |
---|---|---|---|---|
1 | 3 | 3 | 23 | 0 |
2 | 4 | 4 | 65 | 0 |
3 | 5 | 5 | 102 | 0 |
4 | 6 | 5 | 7 | 1 |
5 | 5 | 6 | 4 | -1 |
6 | 6 | 6 | 120 | 0 |
7 | 7 | 6 | 18 | 1 |
8 | 5 | 7 | 1 | -2 |
9 | 6 | 7 | 20 | -1 |
10 | 7 | 7 | 113 | 0 |
Langren.all
van Langren's Data on Longitude Distance between Toledo and Rome
Data shape: (61, 4)
データの内容:
- データは、ローマとトレドの間の経度の距離に関する情報を提供しています。
- データには、著者名、年、名前、経度の列が含まれています。
解析手法の提案:
- このデータセットは、異なる著者によって提供されたトレドとローマの経度の距離を比較することができます。これにより、経度の測定方法や精度に関する洞察が得られるかもしれません。
Pythonライブラリの提案:
- データの可視化や統計解析には、Pandas、Matplotlib、Seaborn、NumPyなどのPythonライブラリを使用することができます。
- 可視化には、MatplotlibやSeabornを使用して、経度の距離の分布や著者ごとの比較をプロットすることができます。
- 統計解析には、PandasやNumPyを使用して、経度の距離の平均、中央値、分散などの統計量を計算することができます。
先頭10データ:
Author | Year | Name | Longitude | |
---|---|---|---|---|
1 | Langren | 1628 | Langren | 17.6907 |
2 | Langren | 1628 | Mercator | 19.6701 |
3 | Langren | 1628 | Schonerus | 20.7835 |
4 | Langren | 1628 | Orontius | 24.2474 |
5 | Langren | 1628 | Regiomontanus | 25.5464 |
6 | Langren | 1628 | Clavius | 26.5361 |
7 | Langren | 1628 | Ptolomeus | 27.7732 |
8 | Langren | 1632 | Algunos1 | 17.6744 |
9 | Langren | 1632 | Maginus | 18.2060 |
10 | Langren | 1632 | Ortelius | 19.1694 |
Langren1644
van Langren's Data on Longitude Distance between Toledo and Rome
Data shape: (12, 9)
データの内容:トレドとローマの経度距離に関するデータがあります。データには名前、経度、年、フルネーム、都市、国、緯度、ソース、ギャップの情報が含まれています。
解析手法の提案:このデータを解析するためには、以下のような解析手法が使えそうです。
-
経度距離の推定:トレドとローマの経度距離を推定するために、回帰分析や時系列分析が適しています。また、地理情報システム(GIS)を使用して、地図上での距離を計算する方法もあります。
-
データの可視化:データセットの要素間の関係を視覚化するために、散布図や地図上のプロットが有用です。また、時系列データのトレンドや変化を可視化するために、折れ線グラフや棒グラフが適しています。
-
データのクラスタリング:データセット内のグループやクラスタを特定するために、クラスタリング手法(例:k-means、階層クラスタリング)を使用することができます。これにより、似た特徴を持つデータポイントをグループ化し、データのパターンや関係を把握することができます。
Pythonライブラリの提案:この解析手法を実装するためには、以下のPythonライブラリが役立ちます。
-
pandas:データの読み込み、整形、操作を行うためのライブラリです。データのフィルタリングや集計などの作業を簡単に行うことができます。
-
matplotlib:グラフの描画や可視化に使用されるライブラリです。散布図、折れ線グラフ、棒グラフなどのさまざまなグラフを作成することができます。
-
scikit-learn:機械学習やデータマイニングに使用される包括的なライブラリです。回帰分析やクラスタリングなどの解析手法を実装するための機能が提供されています。
-
geopandas:地理情報データの処理や可視化に特化したライブラリです。地図データの読み込み、地理情報の処理、地図上でのプロットなどを行うことができます。
これらのライブラリを使用することで、データセットの解析や可視化を効率的に行うことができます。また、さまざまな手法を組み合わせることで、より深い洞察を得ることができるでしょう。
先頭10データ:
Name | Longitude | Year | Longname | City | Country | Latitude | Source | Gap | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | G. Jansonius | 17.736 | 1605 | Jan Jansson | Amsterdam | Flanders | 52.373056 | Map | 0 |
2 | G. Mercator | 19.872 | 1567 | Gerardus Mercator | Leuven | Flanders | 50.883333 | Map | 0 |
3 | I. Schonerus | 20.638 | 1536 | Johann Schoner | Bamberg | Germany | 49.891667 | Astron | 0 |
4 | P. Lantsbergius | 21.106 | 1530 | Phillip van Lansberge | Middelburg | Belgium | 51.500000 | Astron | 0 |
5 | T. Brahe | 21.447 | 1578 | Tycho Brahe | Hven | Denmark | 55.866667 | Astron | 0 |
6 | I. Regiomontanus | 25.617 | 1463 | Johann Muller | Nuremberg | Germany | 49.450000 | Astron | 1 |
7 | Orontius | 26.000 | 1542 | Oronce Fine | Paris | France | 48.866667 | Astron | 1 |
8 | C. Clavius | 26.340 | 1567 | Christoph Clavius | Rome | Italy | 41.900000 | Astron | 1 |
9 | C. Ptolomeus | 27.787 | 150 | Claudius Ptolemaeus | Alexandria | Egypt | 31.198056 | Astron | 1 |
10 | A. Argelius | 28.170 | 1610 | Andrea Argoli | Padua | Italy | 45.416667 | Astron | 1 |
Macdonell
Macdonell's Data on Height and Finger Length of Criminals, used by Gosset (1908)
Data shape: (924, 3)
データの内容:
このデータは、犯罪者の身長と指の長さに関する情報を含んでいます。各行には、身長、指の長さ、およびその組み合わせの出現頻度が示されています。
解析手法の提案:
このデータセットを解析するためには、身長と指の長さの関係を調べることが重要です。以下の手法が使えそうです。
-
散布図:身長と指の長さの関係を可視化するために、散布図を作成することができます。これにより、2つの変数間の相関関係や傾向を把握することができます。
-
回帰分析:身長を目的変数、指の長さを説明変数として、回帰分析を行うことができます。これにより、身長と指の長さの関係を数値化し、予測モデルを構築することができます。
-
カイ二乗検定:身長と指の長さの関係を調べるために、カイ二乗検定を使用することもできます。これにより、2つの変数間の独立性を検定することができます。
Pythonライブラリの提案:
上記の解析手法を実装するためには、以下のPythonライブラリが利用可能です。
-
pandas:データの読み込みや整形、集計などのデータ処理に使用します。
-
matplotlib:散布図やグラフの作成に使用します。身長と指の長さの関係を視覚化するために便利です。
-
scikit-learn:回帰分析や機械学習モデルの構築に使用します。身長と指の長さの関係を数値化し、予測モデルを構築するために利用できます。
-
scipy:カイ二乗検定などの統計解析に使用します。身長と指の長さの独立性を検定するために利用できます。
以上の手法とライブラリを使用することで、このデータセットの分析が可能です。
先頭10データ:
height | finger | frequency | |
---|---|---|---|
1 | 4.630208 | 9.4 | 0 |
2 | 4.630208 | 9.5 | 0 |
3 | 4.630208 | 9.6 | 0 |
4 | 4.630208 | 9.7 | 0 |
5 | 4.630208 | 9.8 | 0 |
6 | 4.630208 | 9.9 | 0 |
7 | 4.630208 | 10.0 | 1 |
8 | 4.630208 | 10.1 | 0 |
9 | 4.630208 | 10.2 | 0 |
10 | 4.630208 | 10.3 | 0 |
MacdonellDF
Macdonell's Data on Height and Finger Length of Criminals, used by Gosset (1908)
Data shape: (3000, 2)
データの内容:
このデータセットは、Macdonellが収集した犯罪者の身長と指の長さのデータです。Gosset(1908年)によって使用されました。
解析手法の提案:
身体的特徴と犯罪行為の関連性を調べるために、身長と指の長さの関係を分析することが考えられます。具体的には、身長と指の長さの相関係数を計算したり、身長や指の長さの分布を可視化したりすることができます。
Pythonライブラリの提案:
この分析には、主に以下のPythonライブラリが利用できます。
- NumPy: 数値計算をサポートするライブラリです。相関係数の計算や統計的な操作に利用できます。
- Pandas: データ解析によく使われるライブラリで、データの読み込みや操作、可視化などに便利です。
- Matplotlib: グラフやプロットを作成するためのライブラリです。データの分布を可視化する際に利用できます。
- Seaborn: Matplotlibをベースにした統計データの可視化ライブラリで、美しいグラフを簡単に作成することができます。
以上のライブラリを使って、身長と指の長さの関係を調査し、可視化することができます。
先頭10データ:
height | finger | |
---|---|---|
1 | 4.630208 | 10.0 |
2 | 4.713542 | 10.3 |
3 | 4.796875 | 9.9 |
4 | 4.796875 | 10.2 |
5 | 4.796875 | 10.2 |
6 | 4.796875 | 10.3 |
7 | 4.796875 | 10.4 |
8 | 4.796875 | 10.7 |
9 | 4.880208 | 10.0 |
10 | 4.880208 | 10.1 |
Michelson
Michelson's Determinations of the Velocity of Light
Data shape: (100, 1)
データの内容:
このデータはMichelsonが光の速度を測定した結果を示しています。測定結果はvelocityというカラムに表示されており、10回の測定結果があります。
どのような解析手法が使えそうか:
このデータは連続的な数値データであり、光の速度に関する情報を持っています。統計分析やグラフ化によって、平均速度や変動の度合いなどを調査することができます。また、データの傾向やパターンを探るための時系列分析も有効です。
そのために使えるPythonライブラリは何か:
このデータの解析には、主にPandasとMatplotlibを使用することができます。Pandasはデータの前処理や集計を行うための便利なライブラリであり、データの読み込みやデータフレームの操作が容易に行えます。また、Matplotlibはデータの可視化ツールであり、グラフ作成やデータの視覚化に役立ちます。
以下にサンプルコードを示します:
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
# データの読み込み
data = pd.read_csv('dataset.csv')
# 平均速度の計算
mean_velocity = data['velocity'].mean()
# 変動の度合いの計算
variance_velocity = data['velocity'].var()
# データの可視化
plt.plot(data['velocity'])
plt.xlabel('Measurement')
plt.ylabel('Velocity')
plt.title('Michelson\'s Determinations of the Velocity of Light')
plt.show()
このコードでは、まずPandasを使用してデータセットを読み込んでいます。次に、平均速度と変動の度合いを計算し、最後にMatplotlibを使用してデータを折れ線グラフとして表示しています。
このようにデータサイエンティストとしての視点で、データの内容、解析手法、Pythonライブラリの提案を行うことができます。
先頭10データ:
velocity | |
---|---|
1 | 850 |
2 | 740 |
3 | 900 |
4 | 1070 |
5 | 930 |
6 | 850 |
7 | 950 |
8 | 980 |
9 | 980 |
10 | 880 |
MichelsonSets
Michelson's Determinations of the Velocity of Light
Data shape: (20, 5)
データの内容: Michelsonの光速測定実験のデータセットであり、10回の測定結果が記録されています。
解析手法: このデータセットは数値データであり、測定結果の分布や平均値の比較など、統計的な解析が適しています。具体的には、データの傾向やばらつきを確認するための記述統計や、データ間の関係性を探索するための相関分析が有用です。
Pythonライブラリの提案:
- pandas: データの読み込みや前処理、記述統計などを行うために使用できます。
- numpy: 数値データの計算や統計処理に使用できます。
- matplotlibやseaborn: データの可視化に使用できます。特に、箱ひげ図やヒストグラムなどはデータの傾向を理解するのに役立ちます。
- scipy: 統計解析や仮説検定などの高度な統計処理に使用できます。
以上のライブラリを活用することで、データの内容を理解し、適切な解析手法を選択してデータの解析を進めることができます。
先頭10データ:
ds12 | ds13 | ds14 | ds15 | ds16 | |
---|---|---|---|---|---|
1 | 850 | 740 | 900 | 1070 | 930 |
2 | 850 | 950 | 980 | 980 | 880 |
3 | 1000 | 980 | 930 | 650 | 760 |
4 | 810 | 1000 | 1000 | 960 | 960 |
5 | 960 | 940 | 960 | 940 | 880 |
6 | 800 | 850 | 880 | 900 | 840 |
7 | 830 | 790 | 810 | 880 | 880 |
8 | 830 | 800 | 790 | 760 | 800 |
9 | 880 | 880 | 880 | 860 | 720 |
10 | 720 | 620 | 860 | 970 | 950 |
Minard.cities
Data from Minard's famous graphic map of Napoleon's march on Moscow
Data shape: (20, 3)
データの内容:
ミナールドの有名なグラフィックマップに基づいた、ナポレオンのモスクワ進軍のデータです。データには経度(long)、緯度(lat)、都市名(city)が含まれています。
解析手法:
このデータを用いて、ナポレオンの進軍経路を可視化することができます。また、各都市の位置情報を基に、進軍速度や移動距離などの解析も行うことができます。
Pythonライブラリ:
地理情報の可視化や解析には、以下のPythonライブラリが活用できます。
- Matplotlib: グラフや地図の描画に利用します。
- Seaborn: データの可視化や統計解析に利用します。
- Pandas: データの読み込みや前処理に利用します。
- Geopandas: 地理情報データの読み込みや可視化に利用します。
- Scikit-learn: クラスタリングや予測モデルの構築に利用します。
以上のライブラリを組み合わせて、データの可視化や解析を行うことができます。
先頭10データ:
long | lat | city | |
---|---|---|---|
1 | 24.0 | 55.0 | Kowno |
2 | 25.3 | 54.7 | Wilna |
3 | 26.4 | 54.4 | Smorgoni |
4 | 26.8 | 54.3 | Moiodexno |
5 | 27.7 | 55.2 | Gloubokoe |
6 | 27.6 | 53.9 | Minsk |
7 | 28.5 | 54.3 | Studienska |
8 | 28.7 | 55.5 | Polotzk |
9 | 29.2 | 54.4 | Bobr |
10 | 30.2 | 55.3 | Witebsk |
Minard.temp
Data from Minard's famous graphic map of Napoleon's march on Moscow
Data shape: (9, 4)
データの内容:
このデータは、ナポレオンのモスクワ進軍の有名なグラフィックマップで使用されているデータです。データには、経度、気温、日数、日付の情報が含まれています。
解析手法の提案:
このデータセットを分析するためには、以下のような解析手法が使えそうです。
- 時系列データの可視化と分析:データセットには日付と日数が含まれており、ナポレオンの進軍の経過を追跡するために時系列データの可視化と分析が有効です。
- 気温データの統計的な要約と比較:気温データを統計的に要約し、異なる日付や地点間の気温の比較を行うことで、進軍の過程での気候の変化を分析することができます。
Pythonライブラリの提案:
このデータセットを分析するためには、以下のPythonライブラリが利用できます。
- pandas: データの読み込み、操作、可視化など幅広いデータ分析の機能を提供します。
- matplotlib: グラフやプロットを作成して、データの可視化を行うためのライブラリです。
- seaborn: matplotlibをベースにした統計データの可視化を簡単に行うためのライブラリです。
- statsmodels: 時系列分析や統計モデリングのための機能を提供するライブラリです。
以上の手法とライブラリを使用することで、ナポレオンの進軍の過程での気候の変化をより深く分析することができます。
先頭10データ:
long | temp | days | date | |
---|---|---|---|---|
1 | 37.6 | 0 | 6 | Oct18 |
2 | 36.0 | 0 | 6 | Oct24 |
3 | 33.2 | -9 | 16 | Nov09 |
4 | 32.0 | -21 | 5 | Nov14 |
5 | 29.2 | -11 | 10 | NaN |
6 | 28.5 | -20 | 4 | Nov28 |
7 | 27.2 | -24 | 3 | Dec01 |
8 | 26.7 | -30 | 5 | Dec06 |
9 | 25.3 | -26 | 1 | Dec07 |
Minard.troops
Data from Minard's famous graphic map of Napoleon's march on Moscow
Data shape: (51, 5)
データの内容:
このデータは、ナポレオンのモスクワへの進軍を示した有名なミナールドのグラフィックマップから取得されたものです。データセットには、位置情報(経度と緯度)、生存者数、進行方向、およびグループの情報が含まれています。
解析手法:
このデータセットを使用して、ナポレオンの進軍中の生存者数の変化や進行方向の変化を可視化し、パターンや傾向を明らかにすることができます。また、生存者数と位置情報の関係を分析し、特定の地点での生存者数の減少や増加の要因を特定することもできます。
Pythonライブラリの提案:
この解析には、以下のPythonライブラリが役立つでしょう。
- Pandas:データの読み込み、整形、および集計に使用できます。
- Matplotlib:データの可視化に使用できます。地図上に生存者数の変化をプロットしたり、進行方向の変化を示すラインプロットを作成することができます。
- Seaborn:データの視覚化とパターンの把握に使用できます。特に、生存者数と位置情報の関係をヒートマップや散布図で可視化するのに役立ちます。
以上のライブラリを使用して、データの可視化や分析を行うことで、ナポレオンの進軍中の生存者数や進行方向に関する洞察を得ることができます。
先頭10データ:
long | lat | survivors | direction | group | |
---|---|---|---|---|---|
1 | 24.0 | 54.9 | 340000 | A | 1 |
2 | 24.5 | 55.0 | 340000 | A | 1 |
3 | 25.5 | 54.5 | 340000 | A | 1 |
4 | 26.0 | 54.7 | 320000 | A | 1 |
5 | 27.0 | 54.8 | 300000 | A | 1 |
6 | 28.0 | 54.9 | 280000 | A | 1 |
7 | 28.5 | 55.0 | 240000 | A | 1 |
8 | 29.0 | 55.1 | 210000 | A | 1 |
9 | 30.0 | 55.2 | 180000 | A | 1 |
10 | 30.3 | 55.3 | 175000 | A | 1 |
Nightingale
Florence Nightingale's data on deaths from various causes in the Crimean War
Data shape: (24, 10)
データの内容:
このデータセットは、フローレンス・ナイチンゲールがクリミア戦争中に収集した死亡原因に関するデータです。データには、日付、月、年、軍隊の人数、病気による死亡数、負傷による死亡数、その他の原因による死亡数、および各原因の死亡率が含まれています。
どのような解析手法が使えそうか:
このデータセットでは、時間の経過に伴う死亡原因の変化や、異なる原因の死亡率の比較など、時系列データの分析が有用です。また、各死亡原因のトレンドや相関性を把握するための可視化も重要です。
そのために使えるPythonライブラリは何か:
この解析には、pandasやmatplotlibなどのPythonライブラリが役立ちます。pandasを使用してデータを読み込み、整形し、必要な計算を行い、matplotlibを使用してデータの可視化を行うことができます。
以下は、データの解析と可視化の例です。
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
# データの読み込み
data = pd.read_csv("dataset.csv")
# 日付をdatetime型に変換
data["Date"] = pd.to_datetime(data["Date"])
# 死亡原因ごとのトレンドを可視化
plt.figure(figsize=(10, 6))
plt.plot(data["Date"], data["Disease"], label="Disease")
plt.plot(data["Date"], data["Wounds"], label="Wounds")
plt.plot(data["Date"], data["Other"], label="Other")
plt.xlabel("Date")
plt.ylabel("Number of Deaths")
plt.title("Trend of Deaths by Cause")
plt.legend()
plt.show()
# 死亡原因ごとの死亡率を可視化
plt.figure(figsize=(10, 6))
plt.plot(data["Date"], data["Disease.rate"], label="Disease")
plt.plot(data["Date"], data["Wounds.rate"], label="Wounds")
plt.plot(data["Date"], data["Other.rate"], label="Other")
plt.xlabel("Date")
plt.ylabel("Death Rate")
plt.title("Death Rate by Cause")
plt.legend()
plt.show()
このように、pandasとmatplotlibを組み合わせることで、データの解析と可視化が容易になります。
先頭10データ:
Date | Month | Year | Army | Disease | Wounds | Other | Disease.rate | Wounds.rate | Other.rate | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 1854-04-01 | Apr | 1854 | 8571 | 1 | 0 | 5 | 1.4 | 0.0 | 7.0 |
2 | 1854-05-01 | May | 1854 | 23333 | 12 | 0 | 9 | 6.2 | 0.0 | 4.6 |
3 | 1854-06-01 | Jun | 1854 | 28333 | 11 | 0 | 6 | 4.7 | 0.0 | 2.5 |
4 | 1854-07-01 | Jul | 1854 | 28722 | 359 | 0 | 23 | 150.0 | 0.0 | 9.6 |
5 | 1854-08-01 | Aug | 1854 | 30246 | 828 | 1 | 30 | 328.5 | 0.4 | 11.9 |
6 | 1854-09-01 | Sep | 1854 | 30290 | 788 | 81 | 70 | 312.2 | 32.1 | 27.7 |
7 | 1854-10-01 | Oct | 1854 | 30643 | 503 | 132 | 128 | 197.0 | 51.7 | 50.1 |
8 | 1854-11-01 | Nov | 1854 | 29736 | 844 | 287 | 106 | 340.6 | 115.8 | 42.8 |
9 | 1854-12-01 | Dec | 1854 | 32779 | 1725 | 114 | 131 | 631.5 | 41.7 | 48.0 |
10 | 1855-01-01 | Jan | 1855 | 32393 | 2761 | 83 | 324 | 1022.8 | 30.7 | 120.0 |
OldMaps
Latitudes and Longitudes of 39 Points in 11 Old Maps
Data shape: (468, 6)
データの内容:
このデータセットは11枚の古地図における39地点の緯度と経度の情報です。各地点には名前や年などの情報も含まれています。
どのような解析手法が使えそうか:
このデータセットでは、地点ごとの緯度と経度の変化を分析することができます。また、時系列データとしての特徴もありますので、地点ごとの緯度と経度の時間変化や地点同士の関係性を解析することも考えられます。さらに、地図上での分布やパターンの特徴を抽出することもできます。
そのために使えるPythonライブラリは何か:
このデータセットを解析するためには、以下のPythonライブラリが有用です。
- Pandas: データセットの読み込みやデータの整理、クレンジングに使用します。
- Matplotlib: 緯度と経度の変化を可視化するために使用します。折れ線グラフや散布図などが有効です。
- Seaborn: 地点ごとの緯度と経度の関係性を可視化するために使用します。ヒートマップや散布図行列などが有効です。
- Scikit-learn: 地点の分布やパターンを抽出するために、クラスタリングや次元削減の手法を使用します。
- Geopandas: 緯度と経度の地理情報を可視化するために使用します。地図上に地点をプロットすることができます。
これらのライブラリを組み合わせて、データセットの特徴を把握し、有益な情報を抽出することができます。また、他の解析手法やライブラリも使用することで、さらに高度な解析を行うことも可能です。
先頭10データ:
point | col | name | year | lat | long | |
---|---|---|---|---|---|---|
1 | 1 | 1 | Actual | NaN | 41.68 | 82.85 |
2 | 1 | 2 | Coronelli | 1688.0 | 41.62 | 87.67 |
3 | 1 | 3 | Del'Isle | 1703.0 | -41.12 | -83.03 |
4 | 1 | 4 | Popple | 1733.0 | -41.03 | -85.10 |
5 | 1 | 5 | Belin | 1744.0 | 41.28 | 82.42 |
6 | 1 | 6 | Belin | 1755.0 | 43.13 | 82.25 |
7 | 1 | 7 | Mitchell | 1755.0 | 42.05 | 82.88 |
8 | 1 | 8 | D'Anville | 1755.0 | 42.15 | 81.63 |
9 | 1 | 9 | Lattre | 1784.0 | 42.03 | 83.53 |
10 | 1 | 10 | Arrowsmith | 1802.0 | 42.02 | 82.90 |
PearsonLee
Pearson and Lee's data on the heights of parents and children classified by gender
Data shape: (746, 6)
データの内容:
- データは子供と親の身長に関する情報を含んでいます。
- child列は子供の身長を示し、parent列は親の身長を示しています。
- frequency列は子供と親の身長の組み合わせの出現頻度を示しています。
- gp、par、chl列はそれぞれ性別、親子関係を示しています。
解析手法の提案:
- このデータを用いて、親の身長と子供の身長の関係性やパターンを明らかにすることができます。
- 相関分析や回帰分析を行うことで、親の身長と子供の身長の関連性を調査することができます。
- また、親の身長と子供の身長の分布を可視化することで、特定の身長範囲において集中している傾向や外れ値を特定することができます。
Pythonライブラリの提案:
- データの読み込み、操作、可視化にはpandasライブラリを使用することができます。
- 相関分析や回帰分析にはscikit-learnライブラリを使用することができます。
- 可視化にはmatplotlibやseabornライブラリを使用することができます。
例えば、以下のようなコードでデータの読み込みと可視化を行うことができます:
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
# データの読み込み
data = pd.read_csv('data.csv')
# 親の身長と子供の身長の散布図を作成
plt.scatter(data['parent'], data['child'])
plt.xlabel('Parent Height')
plt.ylabel('Child Height')
plt.title('Relationship between Parent and Child Heights')
plt.show()
このコードを実行することで、親の身長と子供の身長の関係を可視化することができます。
先頭10データ:
child | parent | frequency | gp | par | chl | |
---|---|---|---|---|---|---|
1 | 59.5 | 62.5 | 0.50 | fs | Father | Son |
2 | 59.5 | 63.5 | 0.50 | fs | Father | Son |
3 | 59.5 | 64.5 | 1.00 | fs | Father | Son |
4 | 60.5 | 62.5 | 0.50 | fs | Father | Son |
5 | 60.5 | 66.5 | 1.00 | fs | Father | Son |
6 | 61.5 | 59.5 | 0.25 | fs | Father | Son |
7 | 61.5 | 60.5 | 0.25 | fs | Father | Son |
8 | 61.5 | 62.5 | 0.50 | fs | Father | Son |
9 | 61.5 | 63.5 | 1.00 | fs | Father | Son |
10 | 61.5 | 64.5 | 0.25 | fs | Father | Son |
PolioTrials
Polio Field Trials Data
Data shape: (8, 6)
データの内容:
このデータセットは「ポリオのフィールド試験データ」であり、さまざまな実験グループとその結果に関する情報を提供しています。各グループの人口、麻痺症例数、非麻痺症例数、誤った報告数などが含まれています。
解析手法の提案:
このデータセットでは、実験グループ間のポリオの影響を比較するための比較解析が有効です。具体的には、実験グループ間の麻痺症例数や非麻痺症例数の差異を検定したり、各グループの相対リスクやオッズ比を計算することが考えられます。
Pythonライブラリの提案:
この解析には、以下のPythonライブラリが役立つでしょう。
- pandas: データの読み込み、整形、集計などのデータ処理に使用します。
- numpy: 数値計算や統計処理に使用します。特に、検定や比率の計算に役立ちます。
- statsmodels: 統計モデリングや検定、信頼区間の計算など、高度な統計分析に使用します。
- seaborn: グラフの作成や可視化に使用します。特に、比較グラフや状態分布の可視化に役立ちます。
これらのライブラリを使用して、データの読み込みから統計解析、可視化までを行うことができます。具体的な解析手法や可視化方法は、データの目的や仮説に基づいて適切に選択する必要があります。
先頭10データ:
Experiment | Group | Population | Paralytic | NonParalytic | FalseReports | |
---|---|---|---|---|---|---|
1 | RandomizedControl | Vaccinated | 200745 | 33 | 24 | 25 |
2 | RandomizedControl | Placebo | 201229 | 115 | 27 | 20 |
3 | RandomizedControl | NotInoculated | 338778 | 121 | 36 | 25 |
4 | RandomizedControl | IncompleteVaccinations | 8484 | 1 | 1 | 0 |
5 | ObservedControl | Vaccinated | 221998 | 38 | 18 | 20 |
6 | ObservedControl | Controls | 725173 | 330 | 61 | 48 |
7 | ObservedControl | Grade2NotInoculated | 123605 | 43 | 11 | 12 |
8 | ObservedControl | IncompleteVaccinations | 9904 | 4 | 0 | 0 |
Prostitutes
Parent-Duchatelet's time-series data on the number of prostitutes in Paris
Data shape: (516, 5)
データの内容:
- データセットID: Prostitutes
- タイトル: Parent-Duchateletによるパリの売春婦の数の時系列データ
- データ: 年月、数、月、日付のカラムを持つデータフレーム
解析手法の提案:
このデータセットはパリの売春婦の数の時系列データであり、時間に関連した変化を分析することが意義を持つでしょう。以下の解析手法が使えそうです。
-
時系列予測: パリの売春婦の数の将来の動向を予測できるようにするために、時系列予測モデルを構築します。ARIMAモデルやLSTMネットワークなどの予測モデルを使用できます。
-
季節性の分析: データに季節的なパターンや周期性があるかどうかを調査するために、季節性の分析を行います。季節調整済みのデータセットを作成するために、季節調整法(例:季節調整ARIMAモデル)を使用します。
-
相関分析: パリの売春婦の数と他の要因(例:経済指標や社会的要因)との相関関係を調べることで、売春婦の数に影響を与える要因を特定します。相関分析やグレンジャーカウスリテストなどの手法が使用できます。
-
時間帯の比較: 日中や夜間など、時間帯ごとの売春婦の数の変化を調査することで、時間帯による売春婦の需要の変動を分析します。時間帯別の平均数や分布を可視化することができます。
Pythonライブラリの提案:
上記の解析手法を実装するために、以下のPythonライブラリが役立ちます。
- pandas: データフレームの操作や時系列データの処理に使用します。
- numpy: 数値計算や配列の操作に使用します。
- matplotlibやseaborn: データの可視化やグラフの作成に使用します。
- statsmodels: 時系列予測モデルや季節調整法、相関分析などの統計モデルを構築するために使用します。
- scikit-learn: 相関分析や予測モデルの作成に使用します。
- tensorflowやpytorch: LSTMなどの深層学習モデルを構築するために使用します。
これらのライブラリを使用して、上記の解析手法を実装することができます。
先頭10データ:
Year | month | count | mon | date | |
---|---|---|---|---|---|
1 | 1812 | Jan | 1110 | 1 | 1812-01-01 |
2 | 1812 | Feb | 1124 | 2 | 1812-02-01 |
3 | 1812 | Mar | 1180 | 3 | 1812-03-01 |
4 | 1812 | Apr | 1235 | 4 | 1812-04-01 |
5 | 1812 | May | 1267 | 5 | 1812-05-01 |
6 | 1812 | Jun | 1296 | 6 | 1812-06-01 |
7 | 1812 | Jul | 1299 | 7 | 1812-07-01 |
8 | 1812 | Aug | 1372 | 8 | 1812-08-01 |
9 | 1812 | Sep | 1403 | 9 | 1812-09-01 |
10 | 1812 | Oct | 1396 | 10 | 1812-10-01 |
Pyx
Trial of the Pyx
Data shape: (72, 4)
データの内容:
このデータセットは「Pyxの試験」に関するデータであり、異なるグループとそのバッグの数、偏差、カウントが含まれています。
解析手法の提案:
このデータセットは、グループごとのバッグの数と偏差を分析するのに適しています。例えば、グループごとのバッグの数の平均や分布を調べることで、バッグの傾向や異常を特定することができます。また、異なるグループ間でバッグの数や偏差の比較を行うことも可能です。
Pythonライブラリの提案:
このデータセットを分析するためには、主にpandasとmatplotlibを使用することができます。pandasは、データの整理や集計、統計的な操作に利用できます。また、matplotlibは可視化のために使用され、グラフやプロットを作成してデータの傾向やパターンを視覚化するのに役立ちます。
先頭10データ:
Bags | Group | Deviation | count | |
---|---|---|---|---|
1 | 1 and 2 | near std | Below -R | 34 |
2 | 3 | near std | Below -R | 11 |
3 | 4 | near std | Below -R | 20 |
4 | 5 | below std | Below -R | 30 |
5 | 6 | below std | Below -R | 32 |
6 | 7 | below std | Below -R | 47 |
7 | 8 | above std | Below -R | 11 |
8 | 9 | above std | Below -R | 10 |
9 | 10 | above std | Below -R | 14 |
10 | 1 and 2 | near std | (-R to -.2) | 57 |
Quarrels
Statistics of Deadly Quarrels
Data shape: (779, 84)
データの内容:
- クオレルに関する統計データ
- 年度、国際的な争いの有無、植民地の争いの有無、革命の有無など、さまざまな要素が含まれている
解析手法の提案:
- データセットが統計データであるため、統計解析やデータマイニングの手法が使えそうです。
- 例えば、データ間の相関関係やパターンを分析するために、相関分析やクラスタリングなどの手法が有用です。
Pythonライブラリの提案:
- データの加工や分析には、PandasやNumPyなどの基本的なデータ分析ライブラリが使えます。
- 相関分析やクラスタリングには、scikit-learnやSciPyなどが便利です。
- 可視化には、MatplotlibやSeabornなどが適しています。
以上の手法とライブラリを使用して、データセットを詳細に分析し、有用な情報を抽出することができます。
先頭10データ:
ID | year | international | colonial | revolution | nat.grp | grp.grpSame | grp.grpDif | numGroups | months | pairs | monthsPairs | logDeaths | deaths | exchangeGoods | obstacleGoods | intermarriageOK | intermarriageBan | simBody | difBody | simDress | difDress | eqWealth | difWealth | simMariagCust | difMariagCust | simRelig | difRelig | philanthropy | restrictMigration | sameLanguage | difLanguage | simArtSci | travel | ignorance | simPersLiberty | difPersLiberty | sameGov | sameGovYrs | prevConflict | prevConflictYrs | chronicFighting | persFriendship | persResentment | difLegal | nonintervention | thirdParty | supportEnemy | attackAlly | rivalsLand | rivalsTrade | churchPower | noExtension | territory | habitation | minerals | StrongHold | taxation | loot | objectedWar | enjoyFight | pride | overpopulated | fightForPay | joinWinner | otherDesiredWar | propaganda3rd | protection | sympathy | debt | prevAllies | yearsAllies | intermingled | interbreeding | propadanda | orderedObey | commerceOther | feltStronger | competeIntellect | insecureGovt | prepWar | RegionalError | CasualtyError | Auxiliaries | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 1 | 1914 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 16 | 52 | 44 | 1436 | 7.2 | 15900000 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 3 | 3 | 2 |
2 | 2 | 1914 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 17 | 43 | 44 | 1436 | 7.2 | 15900000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 14 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 3 | 3 | 2 |
3 | 3 | 1914 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 17 | 52 | 44 | 1436 | 7.2 | 15900000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 55 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 14 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 3 | 3 | 2 |
4 | 4 | 1914 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 15 | 53 | 44 | 1436 | 7.2 | 15900000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 3 | 1 |
5 | 5 | 1914 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 17 | 52 | 44 | 1436 | 7.2 | 15900000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 3 | 3 | 2 |
6 | 6 | 1914 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 16 | 33 | 44 | 1436 | 7.2 | 15900000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 3 | 1 |
7 | 7 | 1918 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 17 | 1 | 44 | 1436 | 7.2 | 15900000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 14 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 3 | 2 |
8 | 8 | 1915 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 17 | 642 | 44 | 1436 | 7.2 | 15900000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 48 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 15 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 3 | 3 | 2 |
9 | 9 | 1916 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 15 | 32 | 44 | 1436 | 7.2 | 15900000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 3 | 3 | 2 |
10 | 10 | 1918 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 16 | 1 | 44 | 1436 | 7.2 | 15900000 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 3 | 2 |
Snow.deaths
John Snow's map and data on the 1854 London Cholera outbreak
Data shape: (578, 3)
データの内容:
このデータセットは、1854年のロンドンコレラの流行に関するジョン・スノウによるマップとデータです。データには、ケース番号と位置座標(xとy)が含まれています。
解析手法の提案:
このデータは、ロンドンの特定の地域でのコレラの発生状況を示しています。地理的な位置情報が含まれているため、空間的なパターンやクラスタリングを分析することができます。また、コレラに関連する要因や影響を特定するために、地理情報と他のデータセットを組み合わせて解析することもできます。
Pythonライブラリの提案:
このデータセットの解析には、以下のPythonライブラリが役立つでしょう。
- Pandas:データの読み込み、整理、操作に使用します。
- Matplotlib:データの可視化に使用します。地図や散布図を作成することができます。
- Seaborn:データの可視化をさらに強化するために使用します。特に、地理的なパターンの可視化に適しています。
- Scikit-learn:空間的なパターンやクラスタリングを分析するために使用します。特に、K-meansクラスタリングアルゴリズムが適しています。
- Geopandas:地理情報を扱うための拡張機能を提供します。地図上でデータを表示し、空間的な操作を行うことができます。
これらのライブラリを使用することで、データの可視化と分析を行うことができます。地理的なパターンやコレラの要因に関する洞察を得ることができるでしょう。
先頭10データ:
case | x | y | |
---|---|---|---|
1 | 1 | 13.588010 | 11.095600 |
2 | 2 | 9.878124 | 12.559180 |
3 | 3 | 14.653980 | 10.180440 |
4 | 4 | 15.220570 | 9.993003 |
5 | 5 | 13.162650 | 12.963190 |
6 | 6 | 13.806170 | 8.889046 |
7 | 7 | 13.102140 | 10.560810 |
8 | 8 | 11.004030 | 11.867130 |
9 | 9 | 15.154750 | 11.704510 |
10 | 10 | 11.126390 | 9.643859 |
Snow.polygons
John Snow's map and data on the 1854 London Cholera outbreak
Data shape: (54, 3)
提案:
データの内容:
このデータは1854年のロンドンコレラの流行について、ジョン・スノウが作成した地図とデータです。データには、地点の開始時間、X座標、Y座標が含まれています。
解析手法の提案:
このデータを解析するためには、以下のような手法が使えそうです。
- 空間データの可視化と解析:地図上にデータをプロットし、地点間の関係やパターンを分析することができます。また、地域ごとのコレラの発生率や影響の範囲を把握することもできます。
- 時系列データの解析:データには開始時間が含まれているため、時間の経過に伴うコレラの拡大や変化を分析することができます。
- 空間統計解析:地点ごとのコレラの発生確率やクラスタリングなど、地理的な要素を考慮した統計解析を行うことができます。
Pythonライブラリの提案:
上記の解析手法を実施するために、以下のPythonライブラリが使えるでしょう。
- Matplotlib:データの可視化や地図上でのプロットを行うために使用します。
- Pandas:データの整理や加工を行うために使用します。
- GeoPandas:地理情報を扱うための拡張機能を提供しており、地点や地域などの空間データを処理するのに便利です。
- Scikit-learn:空間統計解析やクラスタリングなどの統計解析手法を実施するために使用します。
これらのライブラリを使用して、データの可視化や統計解析を行い、ロンドンコレラの流行に関する洞察を得ることができます。
先頭10データ:
start | x | y | |
---|---|---|---|
1 | 0 | 10.296380 | 16.42210 |
2 | 1 | 9.433622 | 18.88881 |
3 | 0 | 2.999976 | 16.31577 |
4 | 1 | 10.296440 | 16.42222 |
5 | 0 | 11.194390 | 15.85302 |
6 | 1 | 12.655010 | 18.88887 |
7 | 0 | 10.296420 | 16.42217 |
8 | 1 | 11.194250 | 15.85301 |
9 | 0 | 15.052140 | 14.26500 |
10 | 1 | 13.800650 | 18.88889 |
Snow.pumps
John Snow's map and data on the 1854 London Cholera outbreak
Data shape: (13, 4)
データの内容:
1854年のロンドンコレラの流行時にジョン・スノーが作成したマップとデータセットです。データにはポンプの位置とラベル、およびその位置の座標が含まれています。
解析手法の提案:
このデータセットは空間データ(地理情報)を扱っており、ポンプの位置とコレラの発生場所との関係を分析することができます。具体的な解析手法としては、以下のようなものが考えられます。
-
空間クラスタリング: ポンプの位置とコレラの発生場所との間の関係を特定するために、空間クラスタリング手法を使用することができます。例えば、K-meansクラスタリングやDBSCANなどが考えられます。
-
空間回帰分析: ポンプの位置座標を説明変数として、コレラの発生件数を目的変数とする回帰分析を行うことができます。具体的な手法としては、回帰モデル(線形回帰、ロジスティック回帰など)や地理統計モデル(GeoGLMなど)が考えられます。
Pythonライブラリの提案:
上記の解析手法を実装するためには、以下のPythonライブラリが便利です。
-
scikit-learn: 空間クラスタリングや回帰分析を行うための機械学習ライブラリです。K-meansクラスタリングや回帰モデルの実装に使用できます。
-
geopandas: 空間データを扱うためのライブラリです。地理情報の操作や可視化に便利です。
-
pysal: 空間データの統計解析を行うためのライブラリです。空間自己相関の検定や空間回帰分析に使用できます。
以上のような手法とライブラリを使用することで、ポンプの位置とコレラの発生場所との関係を詳細に分析することができます。
先頭10データ:
pump | label | x | y | |
---|---|---|---|---|
1 | 1 | NaN | 8.651201 | 17.891600 |
2 | 2 | NaN | 10.984780 | 18.517851 |
3 | 3 | Oxford St #1 | 13.378190 | 17.394541 |
4 | 4 | Oxford St #2 | 14.879830 | 17.809919 |
5 | 5 | Gt Marlborough | 8.694768 | 14.905470 |
6 | 6 | Crown Chapel | 8.864416 | 12.753540 |
7 | 7 | Broad St | 12.571360 | 11.727170 |
8 | 8 | Warwick | 10.660970 | 7.428647 |
9 | 9 | Briddle St | 13.521460 | 7.958250 |
10 | 10 | So Soho | 16.434891 | 9.252130 |
Snow.streets
John Snow's map and data on the 1854 London Cholera outbreak
Data shape: (1241, 4)
データの内容:
このデータは、1854年のロンドンコレラ流行時にジョン・スノーが作成した地図とデータです。データには、ストリートの番号(street)、住民数(n)、位置のX座標(x)、位置のY座標(y)が含まれています。
解析手法の提案:
このデータを使ってできる解析手法としては、以下のようなものが考えられます。
-
空間クラスタリング:コレラ発生地点の空間的なパターンを把握するために、地理的な近さに基づいてストリートをクラスタリングする手法が有効です。これにより、コレラの拡散パターンやホットスポットを特定することができます。
-
人口密度分析:住民数(n)のデータを使って、地域ごとの人口密度を計算し、コレラの発生リスクが高い地域を特定することができます。
-
可視化:xとyの位置情報を使って、地図上にデータを可視化することで、コレラの発生地点や人口密度の分布を直感的に理解しやすくすることができます。
Pythonライブラリの提案:
上記の解析手法を実装するためには、以下のPythonライブラリが便利です。
-
scikit-learn:空間クラスタリング手法を実装するためのライブラリです。例えば、K-meansクラスタリングやDBSCANクラスタリングを利用することができます。
-
NumPy:数値演算を効率的に行うためのライブラリです。データの前処理や計算に利用できます。
-
pandas:データ操作や分析に便利なツールを提供するライブラリです。データの読み込みや可視化、集計などを行うことができます。
-
matplotlib:データの可視化に利用するライブラリです。地図やグラフの描画に使用できます。
以上の手法とライブラリを組み合わせることで、このデータセットから有益な情報を抽出し、コレラの流行時の状況を理解することができます。
先頭10データ:
street | n | x | y | |
---|---|---|---|---|
1 | 1 | 2 | 16.738001 | 18.695999 |
2 | 1 | 2 | 17.660000 | 18.712000 |
3 | 2 | 2 | 14.462000 | 18.655001 |
4 | 2 | 2 | 16.738001 | 18.695999 |
5 | 3 | 2 | 12.793881 | 18.616131 |
6 | 3 | 2 | 14.462000 | 18.655001 |
7 | 4 | 2 | 11.599876 | 18.588308 |
8 | 4 | 2 | 12.793881 | 18.616131 |
9 | 5 | 2 | 10.971961 | 18.573677 |
10 | 5 | 2 | 11.599876 | 18.588308 |
Wheat
Playfair's Data on Wages and the Price of Wheat
Data shape: (53, 3)
データの内容:
- 年ごとの小麦の価格と賃金のデータ
解析手法の提案:
- 年ごとの小麦の価格と賃金の関係を分析するため、時系列データの相関関係を調べることが有用です。具体的な手法としては、時系列データの相関係数や回帰分析が考えられます。
使えるPythonライブラリの提案:
- pandasライブラリを利用してデータの読み込みやデータフレームの操作を行います。
- matplotlibライブラリやseabornライブラリを利用してデータの可視化を行います。
- statsmodelsライブラリを利用して相関係数や回帰モデルの作成や評価を行います。
先頭10データ:
Year | Wheat | Wages | |
---|---|---|---|
1 | 1565 | 41.0 | 5.00 |
2 | 1570 | 45.0 | 5.05 |
3 | 1575 | 42.0 | 5.08 |
4 | 1580 | 49.0 | 5.12 |
5 | 1585 | 41.5 | 5.15 |
6 | 1590 | 47.0 | 5.25 |
7 | 1595 | 64.0 | 5.54 |
8 | 1600 | 27.0 | 5.61 |
9 | 1605 | 33.0 | 5.69 |
10 | 1610 | 32.0 | 5.78 |
Wheat.monarchs
Playfair's Data on Wages and the Price of Wheat
Data shape: (12, 4)
データの内容:
このデータセットは、Playfairが作成した賃金と小麦の価格に関するデータです。各行には、君主の名前、即位年、退位年、およびその時期が英連邦であったかどうかが含まれています。
解析手法の提案:
このデータセットでは、各君主の在位期間や英連邦の有無を分析することができます。また、各君主の在位期間中の賃金と小麦の価格の変動を比較することもできます。
Pythonライブラリの提案:
このデータセットを分析するには、pandasとmatplotlibを使用すると便利です。
pandasはデータの読み込み、データの整理、データの集計などの操作を行うために使用できます。また、matplotlibはデータの可視化に使用できます。君主の在位期間の推移や賃金と小麦の価格の変動をグラフ化することができます。
先頭10データ:
name | start | end | commonwealth | |
---|---|---|---|---|
1 | Elizabeth | 1565 | 1603 | 0 |
2 | James I | 1603 | 1625 | 0 |
3 | Charles I | 1625 | 1649 | 0 |
4 | Cromwell | 1649 | 1660 | 1 |
5 | Charles II | 1660 | 1685 | 0 |
6 | James II | 1685 | 1689 | 0 |
7 | W&M | 1689 | 1702 | 0 |
8 | Anne | 1702 | 1714 | 0 |
9 | George I | 1714 | 1727 | 0 |
10 | George II | 1727 | 1760 | 0 |
Yeast
Student's (1906) Yeast Cell Counts
Data shape: (36, 3)
・データの内容: Yeast(酵母)の学生による細胞数のカウントデータ
・どのような解析手法が使えそうか: サンプルごとのカウントデータの比較や、カウントデータの統計的な解析(平均・分散の比較など)
・そのために使えるPythonライブラリは何か: データの可視化にはmatplotlibやseaborn、統計解析にはscipyやstatsmodels、データ操作や分析にはpandasが利用できる。
提案:
このデータセットでは、2つのサンプル(AとB)において0から5の細胞数のカウントデータがあります。まずは、各サンプルごとのカウントデータの分布を可視化し、平均や分散の比較を行うことが有用です。
具体的な解析手法としては、以下のようなものが考えられます:
- サンプルAとBのカウントデータの平均値の比較: t検定や非パラメトリックな検定(Mann-Whitney U検定など)を用いて、サンプル間の差異の有意性を検証する。
- カウントデータの分布の比較: サンプル間のカウントデータの分布が異なるかどうかを検討するために、カイ二乗検定やフィッシャーの正確確率検定を使用することができる。
これらの解析手法を実装するためには、Pythonのライブラリであるpandas、matplotlib、seaborn、scipy、statsmodelsなどが利用できます。pandasを使ってデータの読み込みや操作、matplotlibやseabornを使ってデータの可視化、scipyやstatsmodelsを使って統計解析を行うことができます。
先頭10データ:
sample | count | freq | |
---|---|---|---|
1 | A | 0 | 213 |
2 | A | 1 | 128 |
3 | A | 2 | 37 |
4 | A | 3 | 18 |
5 | A | 4 | 3 |
6 | A | 5 | 1 |
7 | B | 0 | 103 |
8 | B | 1 | 143 |
9 | B | 2 | 98 |
10 | B | 3 | 42 |
YeastD.mat
Student's (1906) Yeast Cell Counts
Data shape: (20, 20)
データ内容:
- YeastD.matというデータセットで、学生の酵母細胞数のカウント結果が含まれています。
解析手法:
- このデータセットは、異なる条件下での酵母細胞数の測定結果を含んでおり、条件間の比較や傾向の分析が可能です。
- 解析手法としては、集計や可視化、統計的仮説検定、回帰分析などが考えられます。
Pythonライブラリ:
- データの集計や可視化には、NumPyやPandasが有用です。
- 統計的仮説検定には、SciPyの統計モジュールを使用することができます。
- 回帰分析には、Scikit-learnやStatsmodelsが利用できます。
提案:
- まずは、集計や可視化を行い、異なる条件下での酵母細胞数の傾向を把握しましょう。
- 次に、条件間の比較を行うために、統計的仮説検定を実施します。
- 最後に、酵母細胞数と他の変数との関連性を調べるために、回帰分析を行いましょう。
以上の手法とPythonライブラリを活用することで、データセットから有益な情報を抽出し、データサイエンスの観点からの解析を行うことができます。
先頭10データ:
C1 | C2 | C3 | C4 | C5 | C6 | C7 | C8 | C9 | C10 | C11 | C12 | C13 | C14 | C15 | C16 | C17 | C18 | C19 | C20 | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
R1 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 5 | 2 | 4 | 7 | 7 | 4 | 7 | 5 | 2 | 8 | 6 | 7 | 4 | 3 | 4 |
R2 | 3 | 3 | 2 | 4 | 2 | 5 | 4 | 2 | 8 | 6 | 3 | 6 | 6 | 10 | 8 | 3 | 5 | 6 | 4 | 4 |
R3 | 7 | 9 | 5 | 2 | 7 | 4 | 4 | 2 | 4 | 4 | 4 | 3 | 5 | 6 | 5 | 4 | 1 | 4 | 2 | 6 |
R4 | 4 | 1 | 4 | 7 | 3 | 2 | 3 | 5 | 8 | 2 | 9 | 5 | 3 | 9 | 5 | 5 | 2 | 4 | 3 | 4 |
R5 | 4 | 1 | 5 | 9 | 3 | 4 | 4 | 6 | 6 | 5 | 4 | 6 | 5 | 5 | 4 | 3 | 5 | 9 | 6 | 4 |
R6 | 4 | 4 | 5 | 10 | 4 | 4 | 3 | 8 | 3 | 2 | 1 | 4 | 1 | 5 | 6 | 4 | 2 | 3 | 3 | 3 |
R7 | 3 | 7 | 4 | 5 | 1 | 8 | 5 | 7 | 9 | 5 | 8 | 9 | 5 | 6 | 6 | 4 | 3 | 7 | 4 | 4 |
R8 | 7 | 5 | 6 | 3 | 6 | 7 | 4 | 5 | 8 | 6 | 3 | 3 | 4 | 3 | 7 | 4 | 4 | 4 | 5 | 3 |
R9 | 8 | 10 | 6 | 3 | 3 | 6 | 5 | 2 | 5 | 3 | 11 | 3 | 7 | 4 | 7 | 3 | 5 | 5 | 3 | 4 |
R10 | 1 | 3 | 7 | 2 | 5 | 5 | 5 | 3 | 3 | 4 | 6 | 5 | 6 | 1 | 6 | 4 | 4 | 4 | 6 | 4 |
ZeaMays
Darwin's Heights of Cross- and Self-fertilized Zea May Pairs
Data shape: (15, 5)
データの内容:Zea May(トウモロコシ)の交配と自家受粉による植物の高さのデータ。各ペアごとに交配と自家受粉による高さの差も示されている。
解析手法の提案:このデータは、交配と自家受粉による植物の高さの比較を行うためのデータと言えます。交配による遺伝子の組み合わせの効果を調べるために、t検定や対応のあるt検定を用いて、交配と自家受粉による高さの差が統計的に有意かどうかを検定することができます。
使用できるPythonライブラリの提案:統計解析には、NumPyやSciPyといったライブラリが利用できます。また、t検定や対応のあるt検定を実装するためには、scipy.statsモジュールを使用することができます。さらに、データの可視化には、MatplotlibやSeabornなどのライブラリを活用することができます。
先頭10データ:
pair | pot | cross | self | diff | |
---|---|---|---|---|---|
1 | 1 | 1 | 23.500 | 17.375 | 6.125 |
2 | 2 | 1 | 12.000 | 20.375 | -8.375 |
3 | 3 | 1 | 21.000 | 20.000 | 1.000 |
4 | 4 | 2 | 22.000 | 20.000 | 2.000 |
5 | 5 | 2 | 19.125 | 18.375 | 0.750 |
6 | 6 | 2 | 21.500 | 18.625 | 2.875 |
7 | 7 | 3 | 22.125 | 18.625 | 3.500 |
8 | 8 | 3 | 20.375 | 15.250 | 5.125 |
9 | 9 | 3 | 18.250 | 16.500 | 1.750 |
10 | 10 | 3 | 21.625 | 18.000 | 3.625 |
barley
Yield data from a Minnesota barley trial
Data shape: (90, 3)
データの内容:
このデータは、ミネソタで行われた大麦の試験から得られた収量データです。各行には、試験地点、品種、収量が示されています。
解析手法:
このデータセットでは、収量を予測するための回帰分析が適しています。大麦の品種や試験地点が収量にどのような影響を与えるのかを調査することが目的です。
Pythonライブラリ:
回帰分析を行うためには、scikit-learnというPythonライブラリが便利です。このライブラリには、様々な回帰モデル(線形回帰、決定木回帰、ランダムフォレスト回帰など)が実装されており、データセットに適したモデルを選択することができます。
以下は、scikit-learnを使用して回帰分析を行う例です。
import pandas as pd
from sklearn.linear_model import LinearRegression
# データの読み込み
data = pd.DataFrame({
'y': [0.0005, 0.0000, 0.0000, 0.0010, 0.0025, 0.0005, 0.0050, 0.0130, 0.0150, 0.0150],
'site': ['A', 'A', 'A', 'A', 'A', 'A', 'A', 'A', 'A', 'A'],
'variety': [1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 'X']
})
# ダミー変数化
data = pd.get_dummies(data, columns=['site', 'variety'])
# 説明変数と目的変数を分割
X = data.drop('y', axis=1)
y = data['y']
# 線形回帰モデルの学習
model = LinearRegression()
model.fit(X, y)
# 予測
prediction = model.predict(X)
この例では、ダミー変数化を行っているため、'site'と'variety'のカテゴリ変数が数値化され、線形回帰モデルに入力することができます。また、学習済みモデルを用いて予測を行うこともできます。
先頭10データ:
y | site | variety | |
---|---|---|---|
1 | 0.0005 | A | 1 |
2 | 0.0000 | A | 2 |
3 | 0.0000 | A | 3 |
4 | 0.0010 | A | 4 |
5 | 0.0025 | A | 5 |
6 | 0.0005 | A | 6 |
7 | 0.0050 | A | 7 |
8 | 0.0130 | A | 8 |
9 | 0.0150 | A | 9 |
10 | 0.0150 | A | X |
environmental
Atmospheric environmental conditions in New York City
Data shape: (111, 4)
データの内容:
このデータはニューヨーク市の大気環境条件に関するデータです。以下の4つのカラムがあります。
- ozone:オゾン濃度
- radiation:放射量
- temperature:気温
- wind:風速
解析手法の提案:
このデータセットでは、大気環境条件に関するデータが記録されています。以下のような解析手法が使えそうです。
- 相関分析:各変数間の相関関係を調べることで、大気環境条件の影響を特定することができます。
- 回帰分析:気温やオゾン濃度を予測するためのモデルを構築することができます。
Pythonライブラリの提案:
この解析手法を実施するためには、以下のPythonライブラリが使えます。
- pandas:データの読み込みやデータフレームの操作に使用します。
- matplotlibやseaborn:データの可視化に使用します。
- scikit-learn:回帰分析や相関分析などの機械学習手法を実装するために使用します。
- statsmodels:統計解析や回帰分析を実施するために使用します。
先頭10データ:
ozone | radiation | temperature | wind | |
---|---|---|---|---|
1 | 41 | 190 | 67 | 7.4 |
2 | 36 | 118 | 72 | 8.0 |
3 | 12 | 149 | 74 | 12.6 |
4 | 18 | 313 | 62 | 11.5 |
5 | 23 | 299 | 65 | 8.6 |
6 | 19 | 99 | 59 | 13.8 |
7 | 8 | 19 | 61 | 20.1 |
8 | 16 | 256 | 69 | 9.7 |
9 | 11 | 290 | 66 | 9.2 |
10 | 14 | 274 | 68 | 10.9 |
ethanol
Engine exhaust fumes from burning ethanol
Data shape: (88, 3)
データの内容:
このデータはエタノールの燃焼によるエンジン排気ガスの成分データです。NOx、C、Eの3つの変数があります。
どのような解析手法が使えそうか:
エタノールの燃焼によるエンジン排気ガスの成分データの解析には、以下のような手法が考えられます。
- 多変量解析:NOx、C、Eの相互関係を調べるために、多変量解析を行うことができます。
- 回帰分析:エタノールの燃焼パラメータ(C、E)とNOxの関係性を明らかにするために、回帰分析を行うことができます。
そのために使えるPythonライブラリは何か:
上記の解析手法には、以下のPythonライブラリが使えます。
- pandas:データを操作し、分析を行うために使用します。
- numpy:数値計算を行うために使用します。
- scipy:統計解析や回帰分析を行うために使用します。
- scikit-learn:機械学習モデルによる回帰分析を行うために使用します。
例えば、データの読み込みや前処理にはpandasを使用し、回帰分析にはscikit-learnを使用することができます。
先頭10データ:
NOx | C | E | |
---|---|---|---|
1 | 3.741 | 12.0 | 0.907 |
2 | 2.295 | 12.0 | 0.761 |
3 | 1.498 | 12.0 | 1.108 |
4 | 2.881 | 12.0 | 1.016 |
5 | 0.760 | 12.0 | 1.189 |
6 | 3.120 | 9.0 | 1.001 |
7 | 0.638 | 9.0 | 1.231 |
8 | 1.170 | 9.0 | 1.123 |
9 | 2.358 | 12.0 | 1.042 |
10 | 0.606 | 12.0 | 1.215 |
melanoma
Melanoma skin cancer incidence
Data shape: (37, 2)
・データの内容:メラノーマ(皮膚癌)の発生率に関するデータであり、年ごとの発生率が記録されている。
・どのような解析手法が使えそうか:年ごとのメラノーマの発生率の変化を把握するために、時系列解析や可視化が有効である。
・そのために使えるPythonライブラリは何か:PandasやMatplotlibを使用して、データの読み込み、時系列解析、可視化を行うことができる。
提案:
-
データの読み込みと確認:
Pandasライブラリを使って、データを読み込み、データの形式や欠損値の有無を確認する。 -
時系列解析:
データの年ごとのメラノーマの発生率の変化を把握するために、時系列解析を行う。
- 季節性の確認:季節性があるかどうかを確認するために、季節調整済み指数や季節部分の分解を行う。
- トレンドの確認:長期的な変化傾向を確認するために、移動平均や指数平滑法を用いる。
- 外れ値の検出:異常な値や外れ値があるかどうかを確認するために、統計的な手法(例:箱ひげ図)を用いる。
- 可視化:
メラノーマの発生率の変化を視覚的に把握するために、Matplotlibライブラリを使用してグラフを作成する。
- 折れ線グラフ:年ごとのメラノーマの発生率の変化を折れ線グラフで表示する。
- ヒストグラム:メラノーマの発生率の分布をヒストグラムで表示する。
以上の手法とPythonライブラリを使用することで、メラノーマの発生率の変化を詳細に分析し、可視化することができます。
先頭10データ:
year | incidence | |
---|---|---|
1 | 1936 | 0.9 |
2 | 1937 | 0.8 |
3 | 1938 | 0.8 |
4 | 1939 | 1.3 |
5 | 1940 | 1.4 |
6 | 1941 | 1.2 |
7 | 1942 | 1.7 |
8 | 1943 | 1.8 |
9 | 1944 | 1.6 |
10 | 1945 | 1.5 |
singer
Heights of New York Choral Society singers
Data shape: (235, 2)
データの内容:
New York Choral Societyの歌手の身長と声のパートのデータです。
解析手法の提案:
このデータセットでは、声のパートごとに身長が記録されています。身長と声のパートの関係を調べるために、相関分析やグループ間の差の検定などの統計手法が使えそうです。具体的には、声のパートごとに身長の平均値や分布を比較することができます。
Pythonライブラリの提案:
以下のPythonライブラリが役立つでしょう。
- pandas: データの読み込みや整理、集計などの処理に便利です。
- matplotlibやseaborn: データの可視化に使用します。ヒストグラムや箱ひげ図を作成することで、声のパートごとの身長の分布を比較することができます。
- scipy.stats: 統計解析に使用します。t検定やANOVAなどの統計モデルを実行することができます。
また、データの前処理や特徴量エンジニアリングにはnumpyやscikit-learnなどのライブラリも役立ちます。
先頭10データ:
height | voice.part | |
---|---|---|
1 | 64 | Soprano 1 |
2 | 62 | Soprano 1 |
3 | 66 | Soprano 1 |
4 | 65 | Soprano 1 |
5 | 60 | Soprano 1 |
6 | 61 | Soprano 1 |
7 | 65 | Soprano 1 |
8 | 66 | Soprano 1 |
9 | 65 | Soprano 1 |
10 | 63 | Soprano 1 |