CWLでの出力の形式を指定する

まだ調べ途中のメモ

概要

CWLで出力 output に関しても、型を指定したい

まとめ

input についても、型を指定することが可能であるが、
output についても、同様に型を指定することができる。

https://www.commonwl.org/v1.0/CommandLineTool.html
An output schema describes the valid format for an output object.

ユーザーガイドでの例
http://www.commonwl.org/user_guide/16-file-formats/

実例をみてみる。

grepのサンプル
この書き方だと、出力形式が不定（現在調べ中）

grep の出力結果の定義に関して、
例えばこれとかどうだろう？
http://bioportal.bioontology.org/ontologies/EDAM/?p=classes&conceptid=http%3A%2F%2Fedamontology.org%2Fdata_2526&jump_to_nav=true

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