概要
出力ファイルがどのようになっているか?
出力されるのがディレクトリだが、その構造がわからないので、 outputs
で指定するべきものを
記述する方法がわからないときがある
結論
CWLが実行されたディレクトリにあるものを全部とってきてしまう。
outputs:
out:
type: Directory
outputBinding:
glob: $(runtime.outdir)
とりあえず、何がでてくるかわからないときは、以下のようにして、すべてをキャプチャするという手がある
ツールがうまく言った場合、ランダムな名前のディレクトリが出力されるので、
ls -ltr
などで、タイムスタンプが新しいものを探す。
TODO:
サンプルを作る